1,5-anhydro-4,6-O-benzylidene-3-deoxy-2-O-[(4-methylphenyl)sulfonyl]-D-ribo-hexitol | 149312-18-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 1,5-anhydro-4,6-O-benzylidene-3-deoxy-2-O-[(4-methylphenyl)sulfonyl]-D-ribo-hexitol
• 英文别名: 1,5-anhydro-4,6-O-benzylidene-3-deoxy-2-O-(p-tolylsulfonyl)-D-ribo-hexitol；hexahydro-2-phenylpyrano[3,2-d][1,3]dioxin-7-yl p-toluenesulfonate；[(2R,4aR,7R,8aS)-2-phenyl-4,4a,6,7,8,8a-hexahydropyrano[3,2-d][1,3]dioxin-7-yl] 4-methylbenzenesulfonate
• CAS: 149312-18-5
• 化学式: C₂₀H₂₂O₆S
• 分子量: 390.457
• InChiKey: XKHHGLKVQIEAKW-GSEOLPGOSA-N

物化性质

• 沸点：
  555.4±50.0 °C(predicted)
• 密度：
  1.35±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.9
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  79.4
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1,5-anhydro-4,6-O-benzylidene-3-deoxy-2-O-[(4-methylphenyl)sulfonyl]-D-ribo-hexitol 在 吡啶 、 四氮唑 、 水 、 sodium hydride 、 溶剂黄146 、 N,N-二异丙基乙胺 、 sodium nitrite 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 反应 42.7h， 生成 1’,5’-anhydro-2’,3’-dideoxy-2’-[6-N-(dimethylamino)methylidene-2-O-(diphenylcarbamoyl)purin-9-yl]-6’-O-dimethoxytrityl-D-arabinohexitol-4’-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropyl)phosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  异鸟嘌呤和 5-甲基-异胞嘧啶碱基，体外和体内

  摘要：

  5-甲基异胞嘧啶 (isoC Me ) 和异鸟嘌呤 (isoG) 核苷的合成、碱基配对特性以及体外和体内特征，并入 HNA(h)（己糖醇核酸）-DNA(d) 嵌合骨架, 被描述。通过选择性脱氨作为关键步骤制备所需的 h-isoG 亚磷酰胺。正如T m测量所证明的，己糖醇对 dT 的错配辨别力稍好一些。d-isoG 碱基错配遵循 T>G>C 的顺序，而 h-isoG 碱基错配遵循 G>C>T 的顺序。h- 和 d-isoC Me碱基主要与 G 错配。酶促掺入实验表明己糖醇骨架对选择性有不同的影响。在酶促测定中，isoG 主要与 T 错误结合，isoC Me主要与 A 错误结合。进一步的体内分析证实了脱氧核糖和己糖醇 isoC Me / isoG 碱基在细胞环境中的碱基对解释模式，通过掺入碱基转化为质粒 DNA。体内结果表明，错配和错误掺入取决于碱基的骨架支架，这表明朝着正交性的合理进展。

  DOI：

  10.1002/chem.201406392
• 作为产物：
  描述：

  3-O-acetyl-1,5-anhydro-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-2-C-p-tolylsulfonyl-D-arabino-hex-1-enitol 在 sodium tetrahydroborate 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 生成 1,5-anhydro-4,6-O-benzylidene-3-deoxy-2-O-[(4-methylphenyl)sulfonyl]-D-ribo-hexitol
  参考文献：
  名称：

  3-反应-乙酰基-2- -甲苯磺酰基-D- -和- -与亲核-己-1- enitol衍生物; S N 2'机制首先在糖衍生物中得到证明

  摘要：

  发现标题化合物与甲醇钠和硼氢化钠的反应主要通过S N 2'机理进行。亲核试剂从-3处剩下的乙酰氧基基团的同一侧选择性攻击异头碳原子。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)97461-6

文献信息

• Synthesis, Biological Activity, and Molecular Modeling of Ribose-Modified Deoxyadenosine Bisphosphate Analogues as P2Y₁ Receptor Ligands
  作者：Erathodiyil Nandanan、Soo-Yeon Jang、Stefano Moro、Hea Ok Kim、Maqbool A. Siddiqui、Pamela Russ、Victor E. Marquez、Roger Busson、Piet Herdewijn、T. Kendall Harden、José L. Boyer、Kenneth A. Jacobson

  DOI：10.1021/jm990249v

  日期：2000.3.1

  than the corresponding (S)-isomer. The 2-chloro-N(6)-methyl-(N)-methanocarba analogue was an antagonist of IC(50) 51.6 nM. Thus, the ribose ring (N)-conformation appeared to be favored in recognition at P2Y(1) receptors. A cyclobutyl analogue was an antagonist with IC(50) of 805 nM, while morpholine ring-containing analogues were nearly inactive. Anhydrohexitol ring-modified bisphosphate derivatives

  已经探索了腺苷 3', 5'-二磷酸作为 P2Y(1) 受体拮抗剂的构效关系，揭示了 N(6)-甲基基团的效力增强作用和取代核糖部分的能力。 Nandanan et al. J. Med. Chem. 1999, 42, 1625-1638)。我们引入了受约束的碳环（以探索糖褶皱的作用）、与腺嘌呤部分的非糖基键以及磷酸基团移位。每种类似物对 P2Y(1) 受体的生物学活性的特点是测量其刺激火鸡红细胞膜中的磷脂酶 C（激动剂作用）和抑制其由 30 nM 2-甲基硫腺苷-5'-二磷酸（拮抗剂作用）引起的刺激的能力）。N(6)-甲基在几个案例中的加入将纯激动剂转化为拮抗剂。碳环 N(6)-methyl-2'-deoxyadenosine bisphosphate 类似物是纯 P2Y(1) 受体拮抗剂，与核糖类似物 (MRS 2179) 等效。在一系列环约束的甲卡巴衍生物中，稠合环丙烷部分将核苷的假糖环约束为北
• Radiosynthesis and in vitro evaluation of 1-(tetrahydro-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-2H-pyran-3-yl)-5-[125I]iodouracil: A new potential agent for HSV1-tk reporter gene monitoring
  作者：Nam Hyun Jo、Jung Young Kim、Mohammed I. El-Gamal、Won-Kyoung Choi、Jin-Hun Park、Eun Jung Kim、Jung-Hyuck Cho、Hyun-Joon Ha、Tae Hyun Choi、Chang-Hyun Oh

  DOI：10.1002/jlcr.1819

  日期：——

  Synthesis, radiolabelling, and in vitro evaluation of a new 125I-labelled iodouracil hexitol nucleoside analogue are reported. The target compound was successfully synthesized by an iodination–destannylation method and then purified by reverse phase HPLC. The radiochemical purity of the product was >99% with decay-corrected yields of 48±3%. In vitro cellular uptake testing was carried out using MCA and MCA-tk cell lines for comparison of compound 1 with [18F]FHBG. The newly synthesized compound 1 showed higher accumulation in herpex simplex virus type 1 thymidine kinase (HSV1-tk) gene expression cell line (MCA-tk cell line) than in the wild type MCA cell line compared with [18F]FHBG. The MCA-tk to MCA cellular uptake ratio for compound 1 was higher than that of [18F]FHBG from 2 h after incubation. The radioiodine-labelled compound 1 (I-125, t1/2=59.37 days) has a longer physical half-life than F-18-(t1/2=110 min) labelled FHBG. Radioiodine-labelled compound 1 could be used for monitoring gene expression for a long time. The selectivity for MCA-tk cell line makes compound 1 a promising imaging agent for HSV1-tk expression. Copyright © 2010 John Wiley & Sons, Ltd.

  报道了一种新的125I标记的碘尿嘧啶己醇核苷类似物的合成、放射性标记和体外评估。目标化合物通过碘化-去锡化方法成功合成，并通过反相高效液相色谱法纯化。产品的放射化学纯度超过99%，其衰变校正产率为48±3%。体外细胞摄取测试采用MCA和MCA-tk细胞系，比较化合物1与[18F]FHBG的表现。新合成的化合物1在单纯疱疹病毒1型胸腺嘧啶激酶（HSV1-tk）基因表达细胞系（MCA-tk细胞系）中的积累高于野生型MCA细胞系，且与[18F]FHBG相比，化合物1的MCA-tk与MCA细胞摄取比率在孵育2小时后更高。放射性碘标记的化合物1（I-125，t1/2=59.37天）的物理半衰期长于F-18（t1/2=110分钟）标记的FHBG。放射性碘标记的化合物1可以用于长期监测基因表达。对MCA-tk细胞系的选择性使得化合物1成为HSV1-tk表达的有前景的成像剂。版权 © 2010 John Wiley & Sons, Ltd.
• Improved Synthesis of Anhydrohexitol Building Blocks for Oligonucleotide Synthesis
  作者：Bart De Bouvere、Luc Kerremans、Jef Rozenski、Gerard Janssen、Arthur van Aerschot、Paul Claes、Roger Busson、Piet Herdewijn

  DOI：10.1002/jlac.199719970724

  日期：1997.7

  The synthesis of the four building blocks used for the preparation of hexitol nucleic acids were optimized. The nucleoside analogues with a purine base moiety are best prepared by a nucleophilic substitution reaction, whereas the pyrimidine nucleosides can best be obtained using Mitsunobu-type conditions.

  优化了用于制备己糖醇核酸的四个构件的合成。具有嘌呤碱基部分的核苷类似物最好通过亲核取代反应制备，而嘧啶核苷可以使用Mitsunobu型条件获得最佳。
• Hexitol Nucleic Acids (HNA): Synthesis and Properties
  作者：B. De Bouvere、L. Kerreinans、C. Hendrix、H. De Winter、G. Schepers、A. Van Aerschot、P. Herdewijn

  DOI：10.1080/07328319708006119

  日期：1997.7

  While improved alkylation procedures have been worked out for the coupling of purine bases to the anhydrohexitol ring using sulphonate activating groups on the anhydrohexitol ring, the Mitsunobu reaction seems to be the method of choice for synthesis of the pyrimidine analogues. In a mixed sequence context, the anhydrohexitol oligonucleotides still display strong and very selective basepairing properties, with a strong preference for RNA as the complement.
• Synthesis and evaluation of hexitol nucleoside congeners as ambiguous nucleosides
  作者：Catia Lambertucci、Guy Schepers、Gloria Cristalli、Piet Herdewijn、Arthur Van Aerschot

  DOI：10.1016/j.tetlet.2007.01.111

  日期：2007.3

  A series of anhydrohexitol nucleoside congeners was synthesized as ambiguous or so-called universal nucleosides and was evaluated for their hybridization potential and discrimination properties. The 1,5-anhydro-2,3-dideoxy-2-(5-nitroindazol-1-yl)-D-arabino-hexitol 4e showed the lower spread in T-m values upon hybridization to the natural bases, with minimal destabilization, and therefore behaved as a true ambiguous nucleoside. (c) 2007 Published by Elsevier Ltd.