arising from a restricted rotation around the t-amide bond. Employing 2D NMR (NOESY), it is shown here that the Cα-gdm-PNA-T monomer exhibits exclusively the Z-rotamer, while the Cβ-gdm-PNA-T monomer shows only the E-rotamer. The unsubstituted aeg-PNA-T and Cγ-gdm-PNA-T monomers display a mixture of Z/E rotamers. The rotamers with t-amide carbonyl pointing towards the gem-dimethyl group always prevailed
氨乙基甘
氨酸 ( aeg )
PNA的柔性骨架在被取代后变得空间受限,以使构象预组织能够优先结合 DNA 或 RNA。在 Cα(甘
氨酰)或 Cβ/Cγ(
氨基
乙烯)侧与t-酰胺侧链相邻的碳上的庞大偕二甲基 ( gdm ) 取代基可能会影响由于围绕t-酰胺旋转受限而产生的Z / E旋转异构体比率键。使用 2D NMR (NOESY),这里显示Cα- gdm -
PNA-T 单体仅显示Z-旋转异构体,而Cβ- gdm -
PNA-T 单体仅显示E-旋转异构体。未取代的aeg -
PNA-T 和 Cγ - gdm -
PNA-T 单体显示出Z / E旋转异构体的混合物。t-酰胺羰基指向偕二甲基的旋转异构体总是占优势。结果得到了计算研究的支持,这些研究表明,优选的旋转异构体是羰基(酰胺主链和t-酰胺侧链)的稳定 n-π* 相互作用以及 C-H⋯O 相互作用和使偕二甲基与叔
氨基亚甲基之间的空间位阻发生不稳定。Cγ-