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3-(2-脱氧-beta-D-赤式-呋喃戊糖基)-3H-咪唑并[2,1-I]嘌呤 | 68498-25-9

中文名称
3-(2-脱氧-beta-D-赤式-呋喃戊糖基)-3H-咪唑并[2,1-I]嘌呤
中文别名
N6-亚乙烯基-2'-脱氧腺苷
英文名称
3-(2-Deoxy-β-D-erythro-pentafuranosyl)-3H-imidazo[2,1-i]purine
英文别名
1,N6-etheno-2′-deoxyadenosine;2’-deoxy-1,N6-ethenoadenosine;1,N6-Etheno-2'-deoxyadenosine;2'-deoxy-1,N6-ethenoadenosine;1-imidazo[2,1-i]purin-3-yl-β-D-erythro-1,2-dideoxy-pentofuranose;3-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-3H-imidazo[2,1-i]purine;Ethenodeoxyadenosine;(2R,3S,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-imidazo[2,1-f]purin-3-yloxolan-3-ol
3-(2-脱氧-beta-D-赤式-呋喃戊糖基)-3H-咪唑并[2,1-I]嘌呤化学式
CAS
68498-25-9
化学式
C12H13N5O3
mdl
MFCD00056769
分子量
275.267
InChiKey
XQQIMTUYVDUWKJ-DJLDLDEBSA-N
BEILSTEIN
——
EINECS
——
  • 物化性质
  • 计算性质
  • ADMET
  • 安全信息
  • SDS
  • 制备方法与用途
  • 上下游信息
  • 反应信息
  • 文献信息
  • 表征谱图
  • 同类化合物
  • 相关功能分类
  • 相关结构分类

物化性质

  • 熔点:
    69-74°C
  • 密度:
    1.85±0.1 g/cm3(Predicted)
  • 溶解度:
    可溶于DMSO(少许)、甲醇(少许)
  • 物理描述:
    Solid

计算性质

  • 辛醇/水分配系数(LogP):
    0.7
  • 重原子数:
    20
  • 可旋转键数:
    2
  • 环数:
    4.0
  • sp3杂化的碳原子比例:
    0.416
  • 拓扑面积:
    97.7
  • 氢给体数:
    2
  • 氢受体数:
    6

SDS

SDS:6153742168d1a47914d843ffa2903b2e
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制备方法与用途

N6-乙酰基-2'-脱氧腺苷(N6-Etheno 2'-deoxyadenosine)是一种由活性氧/活性氮诱导的DNA氧化损伤产物,可作为生物指标评估动物或人组织中的慢性炎症和脂质过氧化。

上下游信息

  • 上游原料
    中文名称 英文名称 CAS号 化学式 分子量
  • 下游产品
    中文名称 英文名称 CAS号 化学式 分子量
    • 1
    • 2

反应信息

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文献信息

  • Novel Antagonists Acting at the P2Y<sub>1</sub> Purinergic Receptor:  Synthesis and Conformational Analysis Using Potentiometric and Nuclear Magnetic Resonance Titration Techniques
    作者:Pierre Raboisson、Anthony Baurand、Jean-Pierre Cazenave、Christian Gachet、Myriam Retat、Bernard Spiess、Jean-Jacques Bourguignon
    DOI:10.1021/jm0104062
    日期:2002.2.1
    5'-bisphosphate (1a, pA(2) = 6.55 +/- 0.05), revealing the potency-enhancing effects of the 2-methyl group. The better activity of 1e as compared to 1a was analyzed using both potentiometric and nuclear magnetic resonance titration techniques, which highlighted specific conformational features of this compound. These results clearly indicate the preference for both compounds for an anti conformation at the
    人P2Y(1)受体广泛分布在许多组织中,并具有G蛋白偶联受体的经典结构。该受体被5'-二磷酸腺苷(ADP)激活,对血小板聚集至关重要。在本文中,我们描述了新颖的P2Y(1)拮抗剂的合成,这些拮抗剂至少可以作为定义P2Y(1)受体的生理作用的工具,而最多只能作为新的抗血栓形成剂。因此,我们制备了2,N(6)-二甲基-2'-脱氧腺苷-3',5'-二磷酸酯衍生物1e。化合物1e抑制ADP诱导的血小板聚集,形状改变和细胞内钙升高的能力证明了其生物学活性。该化合物是P2Y(1)受体的完全拮抗剂,pA(2)值为7.11 +/- 0。11和发现是比参考N(6)-甲基-2'-脱氧腺苷-3',5'-双磷酸酯(1a,pA(2)= 6.55 +/- 0.05)强4倍,揭示了2-甲基的效力增强作用。使用电位滴定法和核磁共振滴定技术分析了1e与1a相比更好的活性,突出了该化合物的特定构象特征。这些结果清楚地表明对于
  • Metal-Mediated Assembly of 1,<i>N</i><sup>6</sup>-Ethenoadenine: From Surfaces to DNA Duplexes
    作者:Soham Mandal、Can Wang、Rajneesh K. Prajapati、Jutta Kösters、Sandeep Verma、Lifeng Chi、Jens Müller
    DOI:10.1021/acs.inorgchem.6b00927
    日期:2016.7.18
    ligands bind to Ag(I) ions. The molecular structures of [Ag2(1)2](ClO4)2 and [Ag2(2)2](ClO4)2 (1, 9-ethyl-1,N6-ethenoadenine; 2, 9-propyl-1,N6-propylenoadenine) confirm that dinuclear complexes with short Ag···Ag distances are formed (3.0256(3) and 2.984(1) Å, respectively). The structural motif can be extended to divalent metal ions, as was shown by determining the molecular structure of [Cu2(1)2(CHO2)2(OH2)2](NO3)2·2H2O
    多核金属配合物的设计要求配体-金属载体和金属离子的优选配位几何形状匹配。已知只有少数配体具有N→M载体的平行方向,这使金属离子非常接近。我们在这里建立了腺嘌呤衍生物1,N 6-乙炔腺嘌呤(εA)作为理想的双(单齿)配体。石墨表面上的烷基化εA的扫描隧道显微镜图像清楚地表明,这些配体与Ag(I)离子结合。[Ag 2(1)2 ](ClO 4)2和[Ag 2(2)2 ](ClO 4)的分子结构2(1,9-乙基-1,Ñ 6 -ethenoadenine; 2,9-丙基- 1,Ñ 6 -propylenoadenine)确认被形成为与短的Ag的Ag ...距离双核配合物(3.0256(3)和2.984( 1)分别)。结构主题可以扩展到二价金属离子,如通过使用Cu确定[Cu 2(1)2(CHO 2)2(OH 2)2 ](NO 3)2 ·2H 2 O的分子结构所显示的那样···Cu距离为3.162(2)Å。此外,在介绍1,N
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    作者:Tamizi Sugiyama、Enno Schweinberger、Zygmunt Kazimierczuk、Natalya Ramzaeva、Helmut Rosemeyer、Frank Seela
    DOI:10.1002/(sici)1521-3765(20000117)6:2<369::aid-chem369>3.0.co;2-2
    日期:2000.1.17
    2-Aza-2'-deoxyadenosine (2, z2Ad) is synthesized via its 1,N6-etheno derivative 7 and enzymatically deaminated to 2-aza-2'-deoxyinosine (3). Compound 2 is converted into the phosphoramidite building block 10b. This is employed in solid-phase oligonucleotide synthesis. The 2-azapurine base forms a strong base pair with guanine, but a much weaker one with adenine, thymine, and cytosine. Oligonucleotide
    2-Aza-2'-脱氧腺苷(2,z2Ad)是通过其1,N6-乙炔衍生物7合成的,并被酶法脱氨基形成2-aza-2'-脱氧肌苷(3)。化合物2被转化为亚磷酰胺结构单元10b。这用于固相寡核苷酸合成中。2-氮杂嘌呤碱基与鸟嘌呤形成强碱基对,而与腺嘌呤,胸腺嘧啶和胞嘧啶则弱得多。合成了在一个或两个末端带有悬空核苷酸残基的寡核苷酸双链体,例如2-aza-2'-脱氧腺苷和7-deaza-2'-脱氧腺苷(4,c7Ad),并且双链体的热稳定性为与悬挂的核苷酸残基的疏水性相关。
  • A New One‐Pot Fluorescence Derivatization Strategy for Highly Sensitive MicroRNA Analysis
    作者:Li Pan、Huaisheng Zhang、Jingjin Zhao、Ifedayo Victor Ogungbe、Shulin Zhao、Yi‐Ming Liu
    DOI:10.1002/chem.201905639
    日期:2020.5.4
    of miRNAs may lead to a range of human pathologies. Therefore, analysis of miRNAs is valuable for disease diagnostics. In this work, a novel one-pot fluorescence derivatization strategy was developed for miRNA analysis. The mechanism of the derivatization reaction was explored by using instrumental methods, including liquid chromatography, fluorescence spectroscopy, and mass spectrometry. Highly fluorescent
    MicroRNA (miRNA) 在发育和凋亡过程中调节超过 30% 的哺乳动物基因的表达,miRNA 的异常表达可能导致一系列人类病理。因此,miRNA 分析对于疾病诊断很有价值。在这项工作中,开发了一种新的用于 miRNA 分析的一锅法荧光衍生化策略。使用仪器方法(包括液相色谱、荧光光谱和质谱)探索衍生化反应的机制。在 100 °C 下,核酸中的腺嘌呤与 2-氯乙醛 (CAA) 反应,形成高荧光 N6-乙烯酸腺嘌呤 (ε-腺嘌呤) 并从 miRNA 序列中分离。 这是第一个实验证据,证明形成的 ε-腺嘌呤和水介导的氢键相互作用在 2'-和 3'-位置的氧阴离子之间的相互作用显着稳定了氧代碳苯,这使得 miRNA 的脱嘌呤和衍生化非常有效。基于这种衍生化策略,开发了一种简单灵敏的高效液相色谱法用于 miRNA 的定量测定。HPLC 方法与磁性固相萃取 (MSPE) 相结合,可用于测定血清样品中亚皮摩尔水平的
  • Protection-Free One-Pot Synthesis of 2′-Deoxynucleoside 5′-Triphosphates and DNA Polymerization
    作者:Julianne Caton-Williams、Matthew Smith、Nicolas Carrasco、Zhen Huang
    DOI:10.1021/ol201073e
    日期:2011.8.19
    one-pot synthesis of deoxyribonucleoside 5′-triphosphates without any protection on the nucleosides. A facile synthesis is achieved by generating an in situ phosphitylating reagent that reacts selectively with the 5′-hydroxyl groups of the unprotected nucleosides. The synthesized triphosphates are of high quality and can be effectively incorporated into DNAs by DNA polymerase. This novel approach is straightforward
    通过区分核苷上的官能团,我们设计并开发了一种对核苷没有任何保护的脱氧核糖核苷 5'-三磷酸的一锅合成。通过生成与未保护核苷的 5'-羟基选择性反应的原位亚磷酸化试剂,实现了简便的合成。合成的三磷酸盐质量高,可以通过 DNA 聚合酶有效地整合到 DNA 中。这种新颖的方法对于三磷酸合成来说是直接且具有成本效益的。
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