(1S,2R,5R)-3-(hydroxymethyl)-5-(5-iodo-4-methyl-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)cyclopent-3-ene-1,2-diol | 1415220-40-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡咯并嘧啶类
• 英文名称: (1S,2R,5R)-3-(hydroxymethyl)-5-(5-iodo-4-methyl-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)cyclopent-3-ene-1,2-diol
• 英文别名: (1S,2R,5R)-3-(hydroxymethyl)-5-(5-iodo-4-methylpyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)cyclopent-3-ene-1,2-diol
• CAS: 1415220-40-4
• 化学式: C₁₃H₁₄IN₃O₃
• 分子量: 387.177
• InChiKey: KJOCOGWWBTZHBR-JLLWLGSASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  91.4
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1S,2R,5R)-3-(hydroxymethyl)-5-(5-iodo-4-methyl-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)cyclopent-3-ene-1,2-diol 在 甲醇 、 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 potassium carbonate 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 10.0h， 生成 (1S,2R,5R)-5-(5-ethynyl-4-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-3-(hydroxymethyl)cyclopent-3-ene-1,2-diol
  参考文献：
  名称：

  基于结构的药物化学方法开发4-甲基-7-脱氮杂腺嘌呤碳环核苷作为抗HCV剂

  摘要：

  实施了基于结构的方法来设计和合理选择用于合成和抗HCV活性评估的分子。通过对氨基的生物等位取代，分析了先前发现的分子（I，II，III型）的系统结构与活性之间的关系，从而设计出了新的分子（IV型）。配体构象，结合模式研究和类药物性质是选择最终合成分子的主要决定因素。通过分叉的弱氢键（C–H…O），用甲基取代氨基恢复了与RNA模板（Tem 799）的相互作用。从分子建模研究中观察到，这是一个有趣的发现。发现6c –e具有抗HCV活性（37-46μM中的EC 50），而6a，6b和6g无活性。化合物6f（EC 50 28μM）是该系列中活性最高的化合物，但它也显示出一定的细胞毒性（CC 50 52.8μM）。除6f外，没有发现任何化合物具有细胞毒性（CC 50  > 100μM）。本研究公开了基于结构的方法用于新颖的抗HCV铅发现，并为铅优化开辟了未来的范围。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2012.09.072
• 作为产物：
  描述：

  5-O-三苯甲基-2,3-O-异亚丙基-D-呋喃核糖 在 咪唑 、 RuCl2(1,3-dimesityl-imidazolidin-2-yl)(PCy3)(=CHPh) 、 盐酸 、 4-二甲氨基吡啶 、 正丁基锂 、 草酰氯 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 四丁基氟化铵 、 二甲基亚砜 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 45.75h， 生成 (1S,2R,5R)-3-(hydroxymethyl)-5-(5-iodo-4-methyl-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)cyclopent-3-ene-1,2-diol
  参考文献：
  名称：

  基于结构的药物化学方法开发4-甲基-7-脱氮杂腺嘌呤碳环核苷作为抗HCV剂

  摘要：

  实施了基于结构的方法来设计和合理选择用于合成和抗HCV活性评估的分子。通过对氨基的生物等位取代，分析了先前发现的分子（I，II，III型）的系统结构与活性之间的关系，从而设计出了新的分子（IV型）。配体构象，结合模式研究和类药物性质是选择最终合成分子的主要决定因素。通过分叉的弱氢键（C–H…O），用甲基取代氨基恢复了与RNA模板（Tem 799）的相互作用。从分子建模研究中观察到，这是一个有趣的发现。发现6c –e具有抗HCV活性（37-46μM中的EC 50），而6a，6b和6g无活性。化合物6f（EC 50 28μM）是该系列中活性最高的化合物，但它也显示出一定的细胞毒性（CC 50 52.8μM）。除6f外，没有发现任何化合物具有细胞毒性（CC 50  > 100μM）。本研究公开了基于结构的方法用于新颖的抗HCV铅发现，并为铅优化开辟了未来的范围。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2012.09.072