5'-O-((2-cyanoethoxy)-(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridin-3'-yl)phosphoryl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine | 1134195-53-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物
• 英文名称: 5'-O-((2-cyanoethoxy)-(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridin-3'-yl)phosphoryl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine
• CAS: 1134195-53-1
• 化学式: C₅₄H₇₂N₅O₁₆PSi₂
• 分子量: 1134.33
• InChiKey: PSRDGCXZFWXJEU-RBNYFWAYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.49
• 重原子数：
  78.0
• 可旋转键数：
  22.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  263.11
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  19.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5'-O-((2-cyanoethoxy)-(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridin-3'-yl)phosphoryl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridin-3'-yl 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetate 在 锂硼氢 作用下， 以 四氢呋喃 、 异丙醇 为溶剂， 反应 1.5h， 以60%的产率得到5'-O-((2-cyanoethoxy)-(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridin-3'-yl)phosphoryl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine
  参考文献：
  名称：

  アルコキシフェニル誘導体、ヌクレオシド保護体およびヌクレオチド保護体、オリゴヌクレオチド製造方法、ならびに、置換基除去方法

  摘要：

  通过更简便迅速的液相合成方法，可以合成带有Tag的核苷苷酸和核苷酸，以及使用它们制备寡核苷酸的方法，还提供了选择性去除该烷氧基苯基团的方法，以及用于它们的Tag化试剂等。【解决方案】具有以下部分结构的带有Tag部分的Tag化核苷苷或核苷酸。（在公式中，R分别独立表示直链或支链，碳原子数为10到40的烷基。m表示1到5的整数。当m大于2时，存在多个RO，可以相同也可以不同。X表示O、S、NH或NRN。n表示1到4的整数。RN表示可以被取代，表示碳原子数为1到6的烷基。*表示与单个或多个寡核苷酸或寡核苷酸结合的位置。）【选择图】无

  公开号：

  JP2020203902A

文献信息

• Preparation of Nucleotide Oligomer
  申请人：Jung Kyeong-Eun

  公开号：US20100273999A1

  公开（公告）日：2010-10-28

  The present invention provides a method for preparing nucleotide oligomers, including (a) coupling a nucleotide dimer or nucleotide trimer to a nucleoside attached to solid supports or to universal solid supports as a starting material; (b) sequentially coupling nucleotide monomers to the resulting structures of Step (a) to prepare a nucleotide oligomer; and (c) removing the nucleotide oligomers from the solid supports. The method of the present invention provides nucleotide oligomers having 15-20% higher purity than the conventional art. The present invention enables the efficient and inexpensive synthesis of nucleotide oligomers with high purity within a shorter period of time.

  本发明提供了一种制备核苷酸寡聚物的方法，包括(a)将核苷酸二聚体或核苷酸三聚体偶联到固相支撑上或通用固相支撑上的核苷酸作为起始物；(b)顺序地将核苷酸单体偶联到步骤(a)得到的结构上，制备核苷酸寡聚物；以及(c)从固相支撑上去除核苷酸寡聚物。本发明的方法提供了核苷酸寡聚物，其纯度比传统技术高出15-20%。本发明使得能够在较短时间内高效、廉价地合成高纯度的核苷酸寡聚物成为可能。