cyclo[Arg-Asp-Gly-Gly-Asn-Ser-Asn-Asn-Glu-Ile-Nle(N3)-Gly-Leu-Thr] | 1429053-20-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: cyclo[Arg-Asp-Gly-Gly-Asn-Ser-Asn-Asn-Glu-Ile-Nle(N3)-Gly-Leu-Thr]
• 英文别名: 3-[(2S,5S,8S,14S,17S,20S,23S,32S,35S,38S,41S)-32,38,41-tris(2-amino-2-oxoethyl)-8-(4-azidobutyl)-5-[(2S)-butan-2-yl]-23-(carboxymethyl)-20-[3-(diaminomethylideneamino)propyl]-17-[(1R)-1-hydroxyethyl]-35-(hydroxymethyl)-14-(2-methylpropyl)-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42-tetradecaoxo-1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40-tetradecazacyclodotetracont-2-yl]propanoic acid
• CAS: 1429053-20-2
• 化学式: C₅₈H₉₅N₂₃O₂₃
• 分子量: 1482.53
• InChiKey: OYHQCFWOAYYHKX-BIRFZHBRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -8.2
• 重原子数：
  104
• 可旋转键数：
  26
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.66
• 拓扑面积：
  731
• 氢给体数：
  23
• 氢受体数：
  26

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  在 (benzotriazo-1-yloxy)tris(dimethylamino)phosphonium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三异丙基硅烷 、 三氟乙酸 作用下， 以13%的产率得到cyclo[Arg-Asp-Gly-Gly-Asn-Ser-Asn-Asn-Glu-Ile-Nle(N3)-Gly-Leu-Thr]
  参考文献：
  名称：

  使用智能库对包含gp120的蛋白模拟物的不连续表位进行支架优化†

  摘要：

  现在可以快速有效地获得多种蛋白质表面不连续表位模拟物。尽管蛋白质-蛋白质相互作用在许多疾病中都涉及不连续表位的重要作用，但是使用基于肽的分子模拟不连续表位仍然是一个重大挑战。使用铜（我）催化的叠氮化物-炔烃环加成反应（CuAAC），我们已经开发出一种用于合成不连续表位模拟物集合的通用有效方法。代表HIV-gp120中不连续表位的多达三个不同的环肽与选定的支架分子缀合。支架分子的变化，环状肽环大小的优化以及对成功的蛋白质模拟物所产生的文库的筛选导致了HIV gp120模拟物，其IC 50值为1.7μM。此处介绍的方法可快速，高度可复制地访问代表蛋白质模拟物的非常复杂的生物分子构建体的干净，智能库，以用作合成疫苗及其他用途。

  DOI：

  10.1039/c3ob27470e