phakellistatin 13 | 493012-52-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: phakellistatin 13
• 英文别名: (6S,9S,15S,18S,21S,24S)-6-benzyl-21-[(1R)-1-hydroxyethyl]-15-(1H-indol-3-ylmethyl)-18-(2-methylpropyl)-1,4,7,13,16,19,22-heptazatricyclo[22.3.0.09,13]heptacosane-2,5,8,14,17,20,23-heptone
• CAS: 493012-52-5
• 化学式: C₄₂H₅₄N₈O₈
• 分子量: 798.94
• InChiKey: GCYCNNNVEBIXIM-SKOSDCFOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3
• 重原子数：
  58
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  222
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  phakellistatin 13 在 氧气 、 rose bengal 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 phakellistatin 3 、 isophakellistatin 3
  参考文献：
  名称：

  phakellistatin 13的合成并氧化为phakellistatin 3和isophakellistatin 3。

  摘要：

  合成了天然产物phakellistatin 13环-（TrpProPheGlyProThrLeu）。phakellistatin 13的光敏氧化产生了天然产物phakellistatin 3和isophakellistatin 3，这首次证明色氨酸残基可以在全长肽中直接转化为相应的3a-hydroxypyrrolo [2,3-b]吲哚啉。二氢吲哚产物竞争性氧化被认为是质量平衡低的原因，并且可能是所有色胺的氧化环化过程中质量平衡低的原因。[反应-见文字]

  DOI：

  10.1021/ol049614p
• 作为产物：
  描述：

  在 N-methyl-N-ethynyl methanesulfonamide 作用下， 以 二氯甲烷 、 二甲基亚砜 为溶剂， 以98%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  Ynamide 介导的肽键形成：机理研究和合成应用

  摘要：

  Ynamide 偶联剂结合了传统活性酯和偶联剂的优点，同时克服了它们的缺点，并在解决臭名昭著的外消旋/差向异构化问题方面表现出优势。在系统的机理研究的基础上，ynamide 偶联试剂的适用性已成功扩展到肽片段缩合、头尾环化和固相肽合成。

  DOI：

  10.1002/anie.202212247

文献信息

• Total synthesis of five proline-enriched cyclic heptapeptides from the marine sponge Stylissa carteri
  作者：Yulei Li、Qi Chang、Minghao Wu、Xia Zhao

  DOI：10.1016/j.tetlet.2018.03.083

  日期：2018.5

  The total synthesis of five naturally occurring cyclic proline-enriched heptapeptides from the marine sponge Stylissa carteri was reported. The five cyclic heptapeptides were synthesized by applying a two-step solid-phase/solution synthesis strategy. The linear heptapeptides were assembled by standard Fmoc chemistry on 2-chlorotrityl chloride resin, cleaved off-resin with acetic acid/trifluoroethanol/dichloromethane

  据报道，从海生海绵Stylissa carteri合成了五种天然富含环脯氨酸的七肽。通过应用两步固相/溶液合成策略合成了五个环状七肽。通过标准Fmoc化学将线性七肽组装在2-氯三苯甲基氯树脂上，用乙酸/三氟乙醇/二氯甲烷裂解树脂以保持侧链保护基完整，随后通过溶液法实现环化。通过制备型RP-HPLC系统纯化最终产物，并通过HR-QTOF-MS NMR表征其结构。发现合成肽的光谱数据与报道的天然产物的光谱数据相同。
• Solid Phase Synthesis of Marine Cyclopeptide Phakellistatin 13
  作者：Demeng Xia、Chao Liu、Hui Song、Xiang Li、Na Li

  DOI：10.1007/s10600-018-2460-6

  日期：2018.7

  The synthesis of the naturally occurring marine cyclopeptide phakellistatin 13 has been achieved by solid phase peptide synthesis (SPPS). A general method was described to synthesize the cyclic peptide by a two-step solid-phase/solution synthesis strategy. The linear peptide was assembled by standard Fmoc chemistry on solid-phase and subsequently cyclized in solution phase to yield fully protected cyclic heptapeptide. After removing the protected groups, phakellistatin 13 was obtained and purified by semi-preparative reverse phase high-performance RP-HPLC, and its structure was confirmed by NMR and HR-ESI-MS.

  通过固相肽合成（SPPS）技术合成了天然海洋环肽 phakellistatin 13。该研究介绍了一种通过两步固相/溶液合成策略合成环肽的一般方法。线性肽通过标准的 Fmoc 化学反应在固相上合成，然后在溶液相中环化，得到完全保护的环状七肽。去除保护基团后，得到 phakellistatin 13，并通过半制备反相高性能 RP-HPLC 进行纯化，其结构通过 NMR 和 HR-ESI-MS 得到确认。
• Peptide 2-formylthiophenol esters do not proceed through a Ser/Thr ligation pathway, but participate in a peptide aminolysis to enable peptide condensation and cyclization
  作者：Chun Ling Tung、Clarence T. T. Wong、Xuechen Li

  DOI：10.1039/c5ob00825e

  日期：——

  Peptide thiol salicylaldehyde (SAL) esters unexpectedly do not follow a Ser/Thr ligation pathway to react with peptides containing N-terminal Ser/Thr, but proceed towards a peptide aminolysis in DMSO. The reaction takes place even at a low substrate concentration (1 mM). The method has been successfully used to synthesize several natural cyclic peptides, with a high ratio of monocyclic to dimeric products

  肽硫醇水杨醛（SAL）酯出乎意料地不遵循Ser / Thr连接途径与含有N端Ser / Thr的肽反应，而是在DMSO中进行肽氨基分解。即使在低底物浓度（1 mM）下也可以进行反应。该方法已成功用于合成几种天然环肽，单环与二聚体产物的比例很高。