2-{5-[1-(3-hydroxypropyl)-3,3-dimethyl-2,3-dihydroindol-2-ylidene]penta-1,3-dienyl}-3,3-dimethyl-1-(4-sulfonatobutyl)-3H-indolium | 930090-48-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 2-{5-[1-(3-hydroxypropyl)-3,3-dimethyl-2,3-dihydroindol-2-ylidene]penta-1,3-dienyl}-3,3-dimethyl-1-(4-sulfonatobutyl)-3H-indolium
• CAS: 930090-48-5
• 化学式: C₃₂H₄₀N₂O₄S
• 分子量: 548.747
• InChiKey: FYQBWMJKYCCGJZ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.56
• 重原子数：
  39.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  83.68
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-{5-[1-(3-hydroxypropyl)-3,3-dimethyl-2,3-dihydroindol-2-ylidene]penta-1,3-dienyl}-3,3-dimethyl-1-(4-sulfonatobutyl)-3H-indolium 、 双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦 在 四氮唑 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 3.0h， 以75%的产率得到2-(5-{1-[3-(N,N-diisopropylamino-2-cyanoethylphosphinyloxy)propyl]-3,3-dimethyl-2,3-dihydroindol-2-ylidene}penta-1,3-dienyl)-3,3-dimethyl-1-(4-sulfonatobutyl)-3H-indolium
  参考文献：
  名称：

  Simple reagent for the synthesis of oligonucleotides labeled with 3,3,3′,3′-tetramethyl-2,2′-indodicarbocyanine

  摘要：

  描述了一种磷酰胺试剂的合成，用于制备在5′-末端标记荧光染料3,3,3′,3′-四甲基-2,2′-吲哚二羧氰的寡核苷酸。通过合成几种标记的寡核苷酸确认了该试剂的有效性。

  DOI：

  10.1007/s11172-006-0230-2
• 作为产物：
  描述：

  2,3,3-三甲基-3H-吲哚 在 吡啶 、 盐酸 、 乙酸酐 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 30.0h， 生成 2-{5-[1-(3-hydroxypropyl)-3,3-dimethyl-2,3-dihydroindol-2-ylidene]penta-1,3-dienyl}-3,3-dimethyl-1-(4-sulfonatobutyl)-3H-indolium
  参考文献：
  名称：

  Simple reagent for the synthesis of oligonucleotides labeled with 3,3,3′,3′-tetramethyl-2,2′-indodicarbocyanine

  摘要：

  描述了一种磷酰胺试剂的合成，用于制备在5′-末端标记荧光染料3,3,3′,3′-四甲基-2,2′-吲哚二羧氰的寡核苷酸。通过合成几种标记的寡核苷酸确认了该试剂的有效性。

  DOI：

  10.1007/s11172-006-0230-2