measured. The three dimensional structures of trypsin-IAP and trypsin-IIAP were predicted by homology modeling, and the conserved residues required for functionality were identified. Two loops controlling the specificity of the trypsin and the substrate-binding pocket represented in the model are almost identical in primary sequences and backbone tertiary structures of the trypsin families.
胰
蛋白酶是通过破坏赖
氨酸和精
氨酸残基羧基侧的肽键,在动物蛋白消化中很重要的关键蛋白,因此已广泛用于各种
生物技术过程中。在当前的研究中,从鸭(Anas platyrhynchos)中构建了一个容量为5·10(5)CFU / ml的全长cDNA文库。使用表达序列标签(EST)测序,鉴定出编码两个胰
蛋白酶的
基因,然后通过cDNA末端快速扩增(RACE)-PCR获得两个全长的胰
蛋白酶cDNA。使用BlaST,它们被分类为胰
蛋白酶I和II子家族,但是都编码位于C端的信号肽,激活肽和223-aa成熟蛋白。推导的两个成熟蛋白分别命名为胰
蛋白酶-IAP和胰
蛋白酶-IIAP,其理论等电点(pI)和分子量(MW)分别为7.99 / 23466.4 Da和4.65 / 24066.0 Da。
基因的分子表征通过详细的
生物信息学分析进一步进行。系统发育分析表明,胰
蛋白酶-IIAP具有不同于胰
蛋白酶-IAP的进化模式