H-Arg(Mtr)-Gly-OBn | 1203698-07-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: H-Arg(Mtr)-Gly-OBn
• 英文别名: benzyl 2-[[(2S)-2-amino-5-[[amino-[(4-methoxy-2,3,6-trimethylphenyl)sulfonylamino]methylidene]amino]pentanoyl]amino]acetate
• CAS: 1203698-07-0
• 化学式: C₂₅H₃₅N₅O₆S
• 分子量: 533.649
• InChiKey: KXXATZKQZNAFAI-FQEVSTJZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.8
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  184
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  H-Arg(Mtr)-Gly-OBn 、 (1R,4R,6S)-4-(9-fluorenylmethoxycarbonylamino)-2-(methoxycarbonyl)-2-azabicyclo[4.1.0]heptane-1-carboxylic acid 在 N,N-二异丙基乙胺 、 3-(二乙氧基邻酰氧基)-1,2,3-苯并三嗪-4-酮 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 96.25h， 以71%的产率得到4-Fmoc-[2-(methoxycarbonyl)-4-NHCPA]-Arg(Mtr)-Gly-OBn
  参考文献：
  名称：

  环丙烷胡椒酸作为线性和环状拟肽的模板：在合成包含Arg-Gly-Asp（RGD）的肽作为αvβ3整联蛋白配体中的应用

  摘要：

  据报道，作为线性和环状拟肽的构象受限模板，取代的环丙烷胡椒酸（CPA）的合成和评价。各种不同取代的（聚）羟基和氨基-2-氮杂双环[4.1.0]庚烷-1-羧酸是通过适当官能化的内酰胺衍生的烯醇磷酸酯的Pd催化甲氧基羰基化反应，然后是OH-定向环丙烷化。CPA已成功引入线性肽序列中，以评估关于胡椒酸肽键的顺式/反式异构体，并引入具有Arg-Gly-Asp（RGD）序列的环状拟肽中，该环状拟肽物表现出纳摩尔活性作为α的拮抗剂。v β 3M21人黑素瘤细胞中的整联蛋白。因此，CPA似乎适合用于药物发现的新型拟肽。

  DOI：

  10.1002/chem.201403077
• 作为产物：
  描述：

  Boc-Arg(Mtr)-Gly-OBn 在 tin(II) trifluoromethanesulfonate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以96%的产率得到H-Arg(Mtr)-Gly-OBn
  参考文献：
  名称：

  4-Aminoproline-based arginine-glycine-aspartate integrin binders with exposed ligation points: practical in-solution synthesis, conjugation and binding affinity evaluation

  摘要：

  本文介绍了三种新型 4- 氨基脯氨酸基精氨酸-甘氨酸-天冬氨酸整合素结合剂--化合物 15、17 和 19--的简便实用的溶液内合成方法。两个候选化合物带有暴露的叠氮和胺官能团，进一步发展为三聚体平台 21 以及荧光素和 DOTA 结合物 23 和 25。对这些新化合物与人类 αVβ3 和 αVβ5 整合素受体的结合亲和力进行了检测。单体候选化合物和共价共轭物对αVβ3受体的配体能力都在一位数纳摩尔范围内（IC50αVβ3=0.2-8.0 nM；IC50αVβ5=5.0-1621 nM），从而证明了共轭作用不会影响新一代整合素配体的良好结合特性。

  DOI：

  10.1039/b914836a

文献信息

• Synthesis and conformational analysis of peptides embodying 2,3-methanopipecolic acids
  作者：Luciano Ricci、Lorenzo Sernissi、Dina Scarpi、Francesca Bianchini、Alessandro Contini、Ernesto G. Occhiato

  DOI：10.1039/c7ob01617d

  日期：——

  The conformational analysis of linear and cyclic peptides incorporating 2,3-methanopipecolic acids (or Cyclopropane Pipecolic Acids, CPAs) as conformationally constrained α-amino acids is reported. Compared to peptides containing proline or pipecolic acid, a striking increase of the cis isomer (42–92%) around the CPA amide bond is observed, both in water and organic solvents, when these unnatural amino

  报道了线性和环状肽的构象分析，所述线性和环状肽并入了2,3-甲基胡椒酸（或环丙烷胡椒酸，CPAs）作为受构象约束的α-氨基酸。与含有脯氨酸或胡椒酸的肽相比，当这些非天然氨基酸以线性氨基酸序列形式存在时，在水和有机溶剂中均观察到CPA酰胺键周围的顺式异构体显着增加（42–92％）。计算了水中同一键周围的旋转势垒，得出的结果与脯氨酰顺/反异构化的结果相当。在有机溶剂中，注册会计师在我肽的+ 2位诱导VIa型β-转二级结构的形成。当掺入的环肽，所述顺式围绕2,3- methanopipecolic酰胺键几何仍然流行，并在本文中研究了实施例（α的环状含RGD的配体V β 3整联模仿西仑吉肽），所述主链几何结构的保护并且还发现了天然肽的侧链空间取向。鉴于脯氨酸顺/反异构体在许多生物学过程中的重要性，CPA可用作脯氨酸模拟物，用于探测蛋白质-配体相互作用并生成新的生物活性化合物。
• Stereodivergent synthesis of 5-aminopipecolic acids and application in the preparation of a cyclic RGD peptidomimetic as a nanomolar α_Vβ₃ integrin ligand
  作者：Lorenzo Sernissi、Luciano Ricci、Dina Scarpi、Francesca Bianchini、Daniela Arosio、Alessandro Contini、Ernesto G. Occhiato

  DOI：10.1039/c8ob00534f

  日期：——

  employed in peptide synthesis as conformationally constrained α- and δ-amino acids. The cis isomer was used as a δ-amino acid to construct a cyclic RGD-containing peptidomimetic, the ability of which to compete with biotinylated vitronectin for binding with the isolated αVβ3 integrin was measured (IC50 = 4.2 ± 0.9 nM). A complete 1H NMR and computational conformational analysis was performed to elucidate

  设计了立体发散策略，以得到适当保护形式的对映纯顺式和反式5-氨基哌酸（5-APA），以构象约束的α-和δ-氨基酸形式用于肽合成。的顺式异构体被用作δ氨基酸，构建环状含RGD的肽模拟物，其中，以与生物素化的玻连蛋白竞争与所述分离α结合的能力V β 3（IC整合测定50 = 4.2±0.9 nm）的。进行了完整的1 H NMR和计算构象分析，以阐明与cilengitide相比，该环状拟肽具有高亲和力的原因。
• Cyclic RGD peptidomimetics containing 4- and 5-amino-cyclopropane pipecolic acid (CPA) templates as dual αVβ3 and α5β1 integrin ligands
  作者：Lorenzo Sernissi、Andrea Trabocchi、Dina Scarpi、Francesca Bianchini、Ernesto G. Occhiato

  DOI：10.1016/j.bmc.2015.12.039

  日期：2016.2

  corresponding antagonist c(RGD7) derived from the isomeric 4-amino-CPA. Both compounds were also nanomolar ligands of the α5β1 integrin (expressed in human erythroleukemia cell line K562). These results suggest that the CPA-derived templates are suitable for the preparation of dual αvβ3 and α5β1 ligands to suppress integrin-mediated events as well as for targeted drug delivery in cancer therapy.

  使用在羧基和氨基之间具有顺式相对立体化学的4-氨基和5-氨基-环丙烷哌啶酸（CPA）作为模板，以制备含有RGD序列（可能是整联蛋白结合剂）的环状拟肽。拟肽C（RGD8）建立在5-氨基CPA显示的抑制活性（IC 50  = 2.4 nm）的朝向α v β 3整联蛋白受体（在M21人黑素瘤细胞系中表达）相比的最有效拮抗剂的迄今已报道，其活性是衍生自4-氨基-CPA异构体的相应拮抗剂c（RGD7）的十倍。这两种化合物也作为α纳摩尔配体5 β1整联蛋白（在人类红白血病细胞系K562中表达）。这些结果表明，该CPA衍生的模板是适合于双制备α v β 3和α 5 β 1的配体，抑制整合素介导的事件，以及用于在癌症治疗中靶向药物递送。
• Enantioselective Synthesis of <i>cis</i> and <i>trans</i> 4-Aminopipecolic Acids as γ-Amino Acids for the Construction of Cyclic RGD-Containing Peptidomimetics Antagonists of α_V β₃ Integrin
  作者：Francesca Dordoni、Dina Scarpi、Francesca Bianchini、Alessandro Contini、Ernesto G. Occhiato

  DOI：10.1002/ejoc.202000634

  日期：2020.8.2

  A stereodivergent preparation of cis and trans 4‐aminopipecolic acids (4‐APAs) was developed from a common precursor to obtain suitably protected, constrained γ‐amino acids useful in peptidomimetic synthesis. Two antagonists of αVβ3 integrin were synthesized.

  从常见的前体中开发出了顺式和反式4-氨基哌酸（4-APA）的立体发散剂，以获得可适当保护，受约束的γ-氨基酸，可用于拟肽合成。α的两个拮抗剂V β 3整联合成。