New Strategies for the Design of Folded Peptoids Revealed by a Survey of Noncovalent Interactions in Model Systems
作者:Benjamin C. Gorske、Joseph R. Stringer、Brent L. Bastian、Sarah A. Fowler、Helen E. Blackwell
DOI:10.1021/ja907184g
日期:2009.11.18
n-->pi* interactions in dictating the structures of larger, folded peptoids. This new, modular design strategy has guided the construction of peptoids containing 1-naphthylethyl side chains, which we show can be utilized to effectively eliminate trans-amide rotamers from the peptoid backbone, yielding the most conformationally homogeneous class of peptoid structures yet reported in terms of amide rotamerism
控制类肽或 N 取代的甘氨酸寡聚体中主链顺式和反式酰胺之间的平衡是构建离散折叠类肽结构的重大挑战。通过对一组单体 peptoid 模型系统的分析,我们开发了控制 peptoid 构象的新的和一般的策略,这些策略利用局部非共价相互作用来调节主链酰胺旋转异构平衡,包括 n-->pi*、空间和氢键相互作用。实施这些策略所需的化学功能通常仅限于拟肽侧链,在已知产生拟肽结构的侧链 N-α-碳上保持手性,并且与标准拟肽合成技术完全兼容。我们对 peptoid 模型系统的检查还阐明了溶剂如何影响各种侧链-骨架相互作用,揭示了 peptoids 中这些非共价相互作用的基本方面,而这些非共价相互作用以前在很大程度上是未表征的。作为对我们单体模型系统的验证,我们将这项研究的范围扩展到包括 peptoid 低聚物,并且现在已经证明了局部空间和 n-->pi* 相互作用在决定较大折叠 peptoids 结构方面的