摘要:
对模型化合物中的局部折叠和H键键模式的检查可能非常有用,有助于洞察长链低聚物根据远程相互作用采用特定折叠模式(即折叠剂)的倾向。结合实验技术(例如X射线衍射,FT-IR吸收和NMR光谱)和密度泛函理论(DFT)级别的理论计算,我们研究了尿素片段在短链中引起的局部折叠模式β-和γ-氨基酸衍生物的氮杂类似物。我们发现,尿素转体,基于1 <-3 H键相互作用的稳健的C(8)构象,在模型尿素肽(I-IV)中大量填充,该模型是通过替换β-氨基的α-碳获得的氮酸。这种H键方案很可能与远程H键相互作用竞争,从而防止了基于较长寡聚物中远程链内相互作用的二级结构的形成。在通过在主链(V-VIII)中添加亚甲基而获得的相关低聚物中,邻近的H键键合的相互作用是不利的,即,几乎不存在相应的C9折叠模式。在这个系列中,对于更长的寡聚物,基于远程链内相互作用的折叠成为可能。我们目前的光谱证据表明,四脲VIII可能是能够重现在2