U-(13)C-UTP | 1261286-85-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: U-(13)C-UTP
• CAS: 1261286-85-4
• 化学式: C₉H₁₅N₂O₁₅P₃
• 分子量: 493.045
• InChiKey: PGAVKCOVUIYSFO-JPODGFSCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.5
• 重原子数：
  29.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  264.37
• 氢给体数：
  7.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  U-(13)C-L-aspartic acid 、 重碳酸钠-13C 、 葡萄糖-13C 在 alpha-酮戊二酸 、 磷酸肌酸 、 glucose-6-phosphate dehydrogenase from baker's yeast 、 phosphogluconate dehydrogenase, recombinant from E_. coli 、 ribose-5-phosphate isomerase from spinach 、 ribose-phosphate diphosphate kinase, recombinant from E_. coli 、 dATP 、 烟酰胺腺嘌呤双核苷酸磷酸盐 、 fumaric acid disodium salt 、 氯化铵 作用下， 反应 48.0h， 以40%的产率得到U-(13)C-UTP
  参考文献：
  名称：

  酶法从头合成嘧啶核苷酸

  摘要：

  稳定同位素标记的使用彻底改变了核酸的 NMR 研究，并且需要掺入特定同位素标记的方法以促进特定的 NMR 实验和应用。酶促合成提供了一种高效灵活的方法，可以从各种市售的专门标记的前体合成核苷三磷酸，从而可以对体外转录制备的 RNA 进行同位素标记。在这里，我们概括了体外嘧啶的从头生物合成，使用重组表达的酶进行具有多种稳定同位素标记模式的 UTP 和 CTP 的高效单锅合成。(13)C、(15)N、(2)H 标记的 HIV-2 TAR RNA 的过滤 NMR 实验证明了该方法的实用性和价值。这种灵活的酶促合成将使实施详细且信息丰富的 RNA 稳定同位素标记方案变得更加经济高效，为研究 RNA 分子的结构和动力学提供先进的工具。

  DOI：

  10.1021/ja1059685