9H-fluoren-9-ylmethyl N-[(2S,3S)-1-[[(1R)-1-[(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxycarbonylamino]-3-methylbutyl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]carbamate | 284048-99-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 9H-fluoren-9-ylmethyl N-[(2S,3S)-1-[[(1R)-1-[(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxycarbonylamino]-3-methylbutyl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]carbamate
• CAS: 284048-99-3
• 化学式: C₃₁H₃₈N₄O₇
• 分子量: 578.665
• InChiKey: QMJCRNMXXAEWLP-XECDKEEKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.8
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  143
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  9H-fluoren-9-ylmethyl N-[2-[[(1R,2S)-1-[(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxycarbonylamino]-2-methylbutyl]amino]-2-oxoethyl]carbamate 、 9H-fluoren-9-ylmethyl N-[(2S,3S)-1-[[(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxycarbonylamino]methylamino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]carbamate 、 9H-fluoren-9-ylmethyl N-[(2S,3S)-1-[[(1R)-1-[(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxycarbonylamino]-3-methylbutyl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]carbamate 以12%的产率得到(4S)-4-amino-5-[[(2S)-1-[[(2S)-1-[[2-[[(2S,3S)-1-[[[(2S,3S)-1-[[(2S)-1-[[(2S,3R)-1-[[(1S)-1-carboxy-2-methylpropyl]amino]-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]carbamoylamino]methylamino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-2-oxoethyl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-5-oxopentanoic acid
  参考文献：
  名称：

  N-保护的α-氨基酸和二肽的琥珀酰亚胺氨基甲酸酯衍生物——脲肽和低聚脲/肽杂交体的合成

  摘要：

  由多种N制备琥珀酰亚胺（1-{[（烷氧基）羰基]氨基}-1-X-甲基）氨基甲酸酯（4）和琥珀酰亚胺[1-（酰氨基）-1-X-甲基]氨基甲酸酯（5）描述了 -Boc-、-Z- 或 -Fmoc 保护的 α-氨基酸和二肽以及氨基甲酸酯的结构特征。我们之前已经表明，源自 N-Boc 二肽的琥珀酰亚胺氨基甲酸酯 5 可以作为 1,3,5-三氮杂-2,6-二酮（一类新型的构象受限二肽模拟物）的直接前体。在此，我们评估了这些构件在合成脲基肽（在溶液中和在固体支持物上）、肽基乙内酰脲、低聚脲和一些低聚（脲/酰胺）杂化物的用途。脲基三肽 6i 和五聚体 10 的 NMR 构象研究，由交替的酰胺和脲组成，建议折叠构象（即尿素转向）以尿素键的顺，反（E，Z）几何形状为特征，填充在 [D5] 吡啶和 [D6] DMSO 溶液中。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim

  DOI：

  10.1002/ejoc.200601010
• 作为产物：
  描述：

  (C₁₅H₁₁O₂)(NHCHCO)2(C₄H₉)(C₄H₉)(N) 、 N-羟基丁二酰亚胺 在 吡啶 作用下， 以 甲苯 为溶剂， 反应 0.08h， 生成 9H-fluoren-9-ylmethyl N-[(2S,3S)-1-[[(1R)-1-[(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxycarbonylamino]-3-methylbutyl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  N-保护的α-氨基酸和二肽的琥珀酰亚胺氨基甲酸酯衍生物——脲肽和低聚脲/肽杂交体的合成

  摘要：

  由多种N制备琥珀酰亚胺（1-{[（烷氧基）羰基]氨基}-1-X-甲基）氨基甲酸酯（4）和琥珀酰亚胺[1-（酰氨基）-1-X-甲基]氨基甲酸酯（5）描述了 -Boc-、-Z- 或 -Fmoc 保护的 α-氨基酸和二肽以及氨基甲酸酯的结构特征。我们之前已经表明，源自 N-Boc 二肽的琥珀酰亚胺氨基甲酸酯 5 可以作为 1,3,5-三氮杂-2,6-二酮（一类新型的构象受限二肽模拟物）的直接前体。在此，我们评估了这些构件在合成脲基肽（在溶液中和在固体支持物上）、肽基乙内酰脲、低聚脲和一些低聚（脲/酰胺）杂化物的用途。脲基三肽 6i 和五聚体 10 的 NMR 构象研究，由交替的酰胺和脲组成，建议折叠构象（即尿素转向）以尿素键的顺，反（E，Z）几何形状为特征，填充在 [D5] 吡啶和 [D6] DMSO 溶液中。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim

  DOI：

  10.1002/ejoc.200601010

文献信息

• Development of Designed Site-Directed Pseudopeptide-Peptido-Mimetic Immunogens as Novel Minimal Subunit-Vaccine Candidates for Malaria
  作者：José Manuel Lozano、Liliana P. Lesmes、Luisa F. Carreño、Gina M. Gallego、Manuel Elkin Patarroyo

  DOI：10.3390/molecules15128856

  日期：——

  Synthetic vaccines constitute the most promising tools for controlling and preventing infectious diseases. When synthetic immunogens are designed from the pathogen native sequences, these are normally poorly immunogenic and do not induce protection, as demonstrated in our research. After attempting many synthetic strategies for improving the immunogenicity properties of these sequences, the approach consisting of identifying high binding motifs present in those, and then performing specific changes on amino-acids belonging to such motifs, has proven to be a workable strategy. In addition, other strategies consisting of chemically introducing non-natural constraints to the backbone topology of the molecule and modifying the α-carbon asymmetry are becoming valuable tools to be considered in this pursuit. Non-natural structural constraints to the peptide backbone can be achieved by introducing peptide bond isosters such as reduced amides, partially retro or retro-inverso modifications or even including urea motifs. The second can be obtained by strategically replacing L-amino-acids with their enantiomeric forms for obtaining both structurally site-directed designed immunogens as potential vaccine candidates and their Ig structural molecular images, both having immuno-therapeutic effects for preventing and controlling malaria.

  合成疫苗是控制和预防传染病最有前景的工具。当合成免疫原是根据病原体的天然序列设计时，这些免疫原通常免疫原性较差，无法诱导保护，如我们的研究所示。在尝试多种合成策略以提高这些序列的免疫原性后，我们发现一种可行的策略是识别其中高结合位点的特征，并对属于这些位点的氨基酸进行特定的改动。此外，其他一些策略也越来越受到重视，包括通过化学方式在分子的主干拓扑上引入非天然限制，以及修改α-碳不对称性。通过引入肽键异构体（如还原酰胺、部分逆转或逆转修饰，甚至包含脲基团）可以实现对肽主干的非天然结构限制。后者可以通过策略性地用其对映体替换L-氨基酸来获得，以获取具有结构特异性设计的免疫原，作为潜在疫苗候选者及其免疫球蛋白结构分子图像，这两者都对预防和控制疟疾具有免疫治疗效果。