Acetic acid (2R,3R,3aR,5S,6aS)-5-(4-benzoylamino-2-oxo-2H-pyrimidin-1-yl)-6a-(4-bromo-phenyl)-2-(tert-butyl-diphenyl-silanyloxymethyl)-hexahydro-furo[3,2-b]furan-3-yl ester | 881424-04-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: Acetic acid (2R,3R,3aR,5S,6aS)-5-(4-benzoylamino-2-oxo-2H-pyrimidin-1-yl)-6a-(4-bromo-phenyl)-2-(tert-butyl-diphenyl-silanyloxymethyl)-hexahydro-furo[3,2-b]furan-3-yl ester
• 英文别名: [(2S,3aS,5R,6R,6aR)-2-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1-yl)-3a-(4-bromophenyl)-5-[[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxymethyl]-3,5,6,6a-tetrahydro-2H-furo[3,2-b]furan-6-yl] acetate
• CAS: 881424-04-0
• 化学式: C₄₂H₄₂BrN₃O₇Si
• 分子量: 808.801
• InChiKey: BXBXEWWVGCAVNG-SSANWCDGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.35
• 重原子数：
  54
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  116
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Acetic acid (2R,3R,3aR,5S,6aS)-5-(4-benzoylamino-2-oxo-2H-pyrimidin-1-yl)-6a-(4-bromo-phenyl)-2-(tert-butyl-diphenyl-silanyloxymethyl)-hexahydro-furo[3,2-b]furan-3-yl ester 在 吡啶 、 sodium hydroxide 、 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 N-{1-[(2S,3aS,5R,6R,6aR)-5-[Bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-3a-(4-bromo-phenyl)-6-hydroxy-hexahydro-furo[3,2-b]furan-2-yl]-2-oxo-1,2-dihydro-pyrimidin-4-yl}-benzamide
  参考文献：
  名称：

  卤代WNA衍生物对非自然型三元组中识别序列扩展的序列依赖性的影响

  摘要：

  形成三链体的寡核苷酸（TFO）是序列特异性的DNA结合剂，但由于嘌呤区中嘧啶碱基的中断，它们的目标双链体仅限于高嘌呤/高嘧啶序列。尽管进行了广泛的研究，但这个问题尚未完全解决。最近，我们开发了一种双环系统作为核苷类似物（WNA，W形核苷类似物）的新型支架，并确定了两种有用的化合物WNA-βT（2）和WNA-βC（5），分别在TA和CG中断位点形成高度稳定和选择性的三链体。但是，随后的研究表明，使用WNA形成三链体取决于TFO的相邻碱基。在这项研究中，我们合成了具有卤代识别碱基或苯环的新型WNA衍生物，并评估了修饰对三链体稳定性和选择性的影响。已经发现的是，WNA-βT类似物保持-5-卤代嘧啶碱基（WNA-β溴U（3）和WNA-β ˚F U（4））表现出高的CG-选择性。在另一方面，将具有溴取代的苯环的WNA-βT衍生物（米BR-WNA-βT（10）和ø BR-WNA-βT（11））已显示高

  DOI：

  10.1021/jo052413u
• 作为产物：
  描述：

  1-(4-bromophenyl)-5-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-2,3-O-isopropylidene-D-ribofuranose 在 吡啶 、 sodium periodate 、 四氧化锇 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 硫酸 、 四氯化锡 、 zinc dibromide 作用下， 以 四氢呋喃 、 硝基甲烷 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 42.0h， 生成 Acetic acid (2R,3R,3aR,5S,6aS)-5-(4-benzoylamino-2-oxo-2H-pyrimidin-1-yl)-6a-(4-bromo-phenyl)-2-(tert-butyl-diphenyl-silanyloxymethyl)-hexahydro-furo[3,2-b]furan-3-yl ester
  参考文献：
  名称：

  卤代WNA衍生物对非自然型三元组中识别序列扩展的序列依赖性的影响

  摘要：

  形成三链体的寡核苷酸（TFO）是序列特异性的DNA结合剂，但由于嘌呤区中嘧啶碱基的中断，它们的目标双链体仅限于高嘌呤/高嘧啶序列。尽管进行了广泛的研究，但这个问题尚未完全解决。最近，我们开发了一种双环系统作为核苷类似物（WNA，W形核苷类似物）的新型支架，并确定了两种有用的化合物WNA-βT（2）和WNA-βC（5），分别在TA和CG中断位点形成高度稳定和选择性的三链体。但是，随后的研究表明，使用WNA形成三链体取决于TFO的相邻碱基。在这项研究中，我们合成了具有卤代识别碱基或苯环的新型WNA衍生物，并评估了修饰对三链体稳定性和选择性的影响。已经发现的是，WNA-βT类似物保持-5-卤代嘧啶碱基（WNA-β溴U（3）和WNA-β ˚F U（4））表现出高的CG-选择性。在另一方面，将具有溴取代的苯环的WNA-βT衍生物（米BR-WNA-βT（10）和ø BR-WNA-βT（11））已显示高

  DOI：

  10.1021/jo052413u