L-arginylglycyl-L-tyrosyl-b,b-d2-L-alanyl-L-leucylglycine | 1167413-03-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: L-arginylglycyl-L-tyrosyl-b,b-d2-L-alanyl-L-leucylglycine
• CAS: 1167413-03-7
• 化学式: C₂₈H₄₅N₉O₈
• 分子量: 637.705
• InChiKey: RPAKYHDUWYQJQN-AOMDFPGASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.64
• 重原子数：
  45.0
• 可旋转键数：
  19.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.54
• 拓扑面积：
  290.95
• 氢给体数：
  11.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  L-arginylglycyl-L-tyrosyl-b,b-d2-L-alanyl-L-leucylglycine 、 2-iodo-benzoic acid 2,5-dioxo-pyrrolidin-1-yl ester 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 0.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  使用位置异构体、氘标记和分子动力学模拟探索肽中的自由基迁移途径

  摘要：

  理解肽中自由基定向解离的关键之一是详细了解介导自由基迁移的因素。肽基可以通过多种方式产生；然而，在大多数情况下，最初产生的自由基必须迁移到其他位置以促进断裂，例如骨架裂解或侧链丢失。本文通过比较邻位、间位和对位的结果来检查自由基迁移的动力学几种肽的-苯甲酰基位置异构体。由几个正交自由基引发剂产生的受限环肽的异构体也被探测为电荷状态的函数。累积起来，结果表明自由基位置的微小变化可以显着影响自由基迁移，肽的整体结构灵活性也是一个重要的控制因素。对邻位与间位或对位敏感的肽 RGYALG 的一个特别有趣的途径一组氘标记的肽完全绘制了取代。然后，这些数据用于优化基于分子动力学的模拟中的参数，随后用于进一步深入了解对自由基迁移动力学影响最大的结构基础。 在新窗口中打开图片

  DOI：

  10.1007/s13361-012-0540-6
• 作为产物：
  描述：

  在 哌啶 、 6-chloro-3-((dimethylamino)(dimethyliminio)methyl)-1H-benzo[d][1,2,3]triazol-3-ium-1-olatehexafluorophosphate(V) 、 三异丙基硅烷 、 三氟乙酸 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 L-arginylglycyl-L-tyrosyl-b,b-d2-L-alanyl-L-leucylglycine
  参考文献：
  名称：

  负电子转移解离和紫外光解离后，酪氨酸去质子化在肽阴离子中产生丰富和选择性的骨架裂解

  摘要：

  肽中的酪氨酸去质子化在 NETD 或 UVPD 上产生优先电子脱离，导致显着的 N-Cα 键裂解 N 端酪氨酸残基。碘酪氨酸修饰肽的 UVPD 用于通过 CI 键的均裂在中性酪氨酸侧链上产生局部自由基。随后自由基物质的碰撞活化产生了相同的相邻 N 端 N-Cα 键的优先裂解。BSA 胰蛋白酶消化物的 LC-MS/MS 分析表明，使用高 pH 流动相时，经常观察到肽的这些裂解。

  DOI：

  10.1021/ja3032086