3',5'-(tert-butyldimethylsilyl)-5-(1,3-dioxan-2-yl)deoxycytidine | 1535202-63-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物
• 英文名称: 3',5'-(tert-butyldimethylsilyl)-5-(1,3-dioxan-2-yl)deoxycytidine
• CAS: 1535202-63-1
• 化学式: C₂₅H₄₇N₃O₆Si₂
• 分子量: 541.836
• InChiKey: AEMOVGZTUYCTDT-XUVXKRRUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.96
• 重原子数：
  36.0
• 可旋转键数：
  7.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.84
• 拓扑面积：
  107.06
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3',5'-(tert-butyldimethylsilyl)-5-(1,3-dioxan-2-yl)deoxycytidine 在 吡啶 、 氟化氢吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 25.0h， 生成 5'-(dimethoxytrityl)-4-N-para-methoxybenzoyl-5-(1,3-dioxan-2-yl)deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  包含所有4种表观遗传核苷的DNA启动子片段的合成：5-甲基，5-羟甲基，5-甲酰基和5-羧基2'-脱氧胞苷

  摘要：

  已开发出5-甲酰基-2'-脱氧胞苷（fdC）亚磷酰胺结构单元，该结构能够合成具有出色纯度和产率的fdC含DNA。与5-甲基-dC，5-羟甲基-dC和羧基-dC的亚磷酰胺组合，可以制备出包含所有四个表观遗传碱基的OCT-4启动子片段。由于对这些新的表观遗传学基础有极大的兴趣，因此将其全部四个插入DNA的能力对于科学界来说具有极大的价值。

  DOI：

  10.1002/anie.201308469
• 作为产物：
  描述：

  3',5'-(tertbutyldimethylsilyl)-5-(formyl)deoxycytidine 、 1,3-丙二醇 在 四氯化钛 、 原甲酸三乙酯 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 6.0h， 以83%的产率得到3',5'-(tert-butyldimethylsilyl)-5-(1,3-dioxan-2-yl)deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  包含所有4种表观遗传核苷的DNA启动子片段的合成：5-甲基，5-羟甲基，5-甲酰基和5-羧基2'-脱氧胞苷

  摘要：

  已开发出5-甲酰基-2'-脱氧胞苷（fdC）亚磷酰胺结构单元，该结构能够合成具有出色纯度和产率的fdC含DNA。与5-甲基-dC，5-羟甲基-dC和羧基-dC的亚磷酰胺组合，可以制备出包含所有四个表观遗传碱基的OCT-4启动子片段。由于对这些新的表观遗传学基础有极大的兴趣，因此将其全部四个插入DNA的能力对于科学界来说具有极大的价值。

  DOI：

  10.1002/anie.201308469