N-[(1S)-1-[(acetamidocarbamoylamino)carbamoyl]-2-methyl-propyl]-4-[[7-[4-[[(1S)-1-[(acetamidocarbamoylamino)carbamoyl]-2-methyl-propyl]amino]-4-oxo-butoxy]-2-naphthyl]oxy]butanamide | 1391719-56-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-[(1S)-1-[(acetamidocarbamoylamino)carbamoyl]-2-methyl-propyl]-4-[[7-[4-[[(1S)-1-[(acetamidocarbamoylamino)carbamoyl]-2-methyl-propyl]amino]-4-oxo-butoxy]-2-naphthyl]oxy]butanamide
• 英文别名: N-[(2S)-1-[2-(acetamidocarbamoyl)hydrazinyl]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-4-[7-[4-[[(2S)-1-[2-(acetamidocarbamoyl)hydrazinyl]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-4-oxobutoxy]naphthalen-2-yl]oxybutanamide
• CAS: 1391719-56-4
• 化学式: C₃₄H₅₀N₁₀O₁₀
• 分子量: 758.832
• InChiKey: TWHWIRKGXRMJLV-KYJUHHDHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.4
• 重原子数：
  54
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  275
• 氢给体数：
  10
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1-acetamido-3-[[(2S)-2-amino-3-methyl-butanoyl]amino]urea hydrochloride 、 2,7-bis{3-[(3-aminophenyl)carbamoyl]propoxy}naphthalene 在 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以69%的产率得到N-[(1S)-1-[(acetamidocarbamoylamino)carbamoyl]-2-methyl-propyl]-4-[[7-[4-[[(1S)-1-[(acetamidocarbamoylamino)carbamoyl]-2-methyl-propyl]amino]-4-oxo-butoxy]-2-naphthyl]oxy]butanamide
  参考文献：
  名称：

  基于羰基酰肼的分子钳抑制野生型和突变的HIV-1蛋白酶二聚。

  摘要：

  我们设计和合成了一种基于刚性萘基支架的新型分子钳，并评估了它们对HIV-1蛋白酶（PR）的抗二聚体活性。我们将羰基酰肼和寡酰肼（叠氮化物）片段插入它们的拟肽臂中，以减少疏水性并增加代谢稳定性。这些片段旨在通过复制天然PR中两个单体的N和C端之间形成的反平行β折叠中的氢键模式来破坏蛋白质之间的相互作用。动力学分析和荧光探针结合研究表明，几种分子钳可以抑制PR二聚化。迄今为止，最佳非肽类分子钳具有抑制常数K id对于PR为50nM，对于多突变蛋白酶ANAM-11为80nM。PR抑制是选择性的，天冬氨酸蛋白酶肾素和胃蛋白酶不被抑制。

  DOI：

  10.1021/jm300181j

文献信息

• Carbonylhydrazide-Based Molecular Tongs Inhibit Wild-Type and Mutated HIV-1 Protease Dimerization
  作者：Laure Dufau、Ana Sofia Marques Ressurreição、Roberto Fanelli、Nadjib Kihal、Anamaria Vidu、Thierry Milcent、Jean-Louis Soulier、Jordi Rodrigo、Audrey Desvergne、Karine Leblanc、Guillaume Bernadat、Benoit Crousse、Michèle Reboud-Ravaux、Sandrine Ongeri

  DOI：10.1021/jm300181j

  日期：2012.8.9

  Kinetic analyses and fluorescent probe binding studies showed that several molecular tongs can inhibit PR dimerization. The best nonpeptidic molecular tongs to date were obtained with an inhibition constant Kid of 50 nM for PR and 80 nM for the multimutated protease ANAM-11. The PR inhibition was selective, the aspartic proteases renin and pepsin were not inhibited.

  我们设计和合成了一种基于刚性萘基支架的新型分子钳，并评估了它们对HIV-1蛋白酶（PR）的抗二聚体活性。我们将羰基酰肼和寡酰肼（叠氮化物）片段插入它们的拟肽臂中，以减少疏水性并增加代谢稳定性。这些片段旨在通过复制天然PR中两个单体的N和C端之间形成的反平行β折叠中的氢键模式来破坏蛋白质之间的相互作用。动力学分析和荧光探针结合研究表明，几种分子钳可以抑制PR二聚化。迄今为止，最佳非肽类分子钳具有抑制常数K id对于PR为50nM，对于多突变蛋白酶ANAM-11为80nM。PR抑制是选择性的，天冬氨酸蛋白酶肾素和胃蛋白酶不被抑制。