通过使用弱亲和色谱(WAC),NMR光谱学和分子模拟相结合的方法研究蛋清蛋白溶菌酶(HEWL)与市售和化学合成的碳水化合物配体之间的相互作用,我们报告了新的亲和力数据以及HEWL蛋白的详细结合模型。配位体的平衡解离常数既可以通过WAC获得,也可以通过NMR光谱获得,两者相吻合。使用1 H饱和转移差(STD)效应通过NMR光谱推导了溶液中的两种HEWL-二糖复合物的结构,并转移了1 H,1H-NOESY实验,弛豫矩阵计算,分子对接和分子动力学模拟。在溶液中两个二糖β- d -Gal p - (1→4)-β- d -Glc p NAC-OME和β- d -Glc p NAc-(1→4)-β- d -Glc p NAc- OMe在两个糖残基之间的糖苷键处以顺式构象结合HEWL的B和C位点。分子间氢键键合和CH /π相互作用以糖-蛋白相互作用的特征形式形成了蛋白-配体复合物的基础。显式的分子动力学
通过使用弱亲和色谱(WAC),NMR光谱学和分子模拟相结合的方法研究蛋清蛋白溶菌酶(HEWL)与市售和化学合成的碳水化合物配体之间的相互作用,我们报告了新的亲和力数据以及HEWL蛋白的详细结合模型。配位体的平衡解离常数既可以通过WAC获得,也可以通过NMR光谱获得,两者相吻合。使用1 H饱和转移差(STD)效应通过NMR光谱推导了溶液中的两种HEWL-二糖复合物的结构,并转移了1 H,1H-NOESY实验,弛豫矩阵计算,分子对接和分子动力学模拟。在溶液中两个二糖β- d -Gal p - (1→4)-β- d -Glc p NAC-OME和β- d -Glc p NAc-(1→4)-β- d -Glc p NAc- OMe在两个糖残基之间的糖苷键处以顺式构象结合HEWL的B和C位点。分子间氢键键合和CH /π相互作用以糖-蛋白相互作用的特征形式形成了蛋白-配体复合物的基础。显式的分子动力学
作者:Eun Ju Kim、Dona C. Love、Etzer Darout、Mohannad Abdo、Brian Rempel、Stephen G. Withers、Paul R. Rablen、John A. Hanover、Spencer Knapp
DOI:10.1016/j.bmc.2010.08.010
日期:2010.10
The title compound, which differs from the powerful O-GlcNAcase (OGA) inhibitor GlcNAc-thiazoline only at the chalcogen atom (Se for S), is a much weaker inhibitor in a direct OGA assay. In human cells, however, the selenazoline shows comparable ability to induce hyper-O-GlcNAc-ylation, and the two show similar reduction of insulin-stimulated translocation of glucose transporter 4 in differentiated 3T3 adipocytes. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.