N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-O-[2,3,4,6-tetra-O-benzyl-β-D-galactopyranosyl-(1->3)-2-azido-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl]-L-serine allyl ester | 184093-93-4

• 分子结构分类: 有机化合物
• 英文名称: N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-O-[2,3,4,6-tetra-O-benzyl-β-D-galactopyranosyl-(1->3)-2-azido-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl]-L-serine allyl ester
• CAS: 184093-93-4
• 化学式: C₆₈H₆₈N₄O₁₄
• 分子量: 1165.31
• InChiKey: URPYLKHZEKCYEM-UPAKZDJWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  11.24
• 重原子数：
  86.0
• 可旋转键数：
  26.0
• 环数：
  11.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  205.69
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  15.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-O-[2,3,4,6-tetra-O-benzyl-β-D-galactopyranosyl-(1->3)-2-azido-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl]-L-serine allyl ester 在 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 以74%的产率得到N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-O-[2,3,4,6-tetra-O-benzyl-β-D-galactopyranosyl-(1->3)-2-azido-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl]-L-serine allyl ester
  参考文献：
  名称：

  核心2 O-连接的糖肽的固相合成及其酶促唾液酸化

  摘要：

  固相合成糖肽的核心2型四糖结构单元（1a / 1b）是通过二糖基Ser / Thr（3a / 3b）与带有2-三氯乙酰胺基的糖基氟化物（2）的立体选择性糖基化合成的。通过还原容易地将其转化为2-乙酰氨基基团。固相规程合成了糖蛋白白蜡蛋白（215-224）的一个片段，即构件（1b）被利用。用试剂K从树脂上切割合成糖肽，然后用“低酸度TfOH”混合物对产物进行处理，促进了苄基的完全除去，糖苷键的损失最小。通过使用特定的唾液酸转移酶，以非常高的效率将N-乙酰神经氨酸（唾液酸）残基酶促地引入到去保护的糖肽（21）中。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2003.08.047
• 作为产物：
  描述：

  苯基2,3,4,6-四-O-苯甲基-1-硫代-Β-D-半乳糖皮蒽 、 allyl N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-[O-(2-azido-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-(1[*]3)]-L-serine 在 4 A molecular sieve 、 sulfobromophthalein sodium 、 三氟甲磺酸酐 作用下， 以 various solvent(s) 为溶剂， 反应 0.67h， 以67%的产率得到N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-O-[2,3,4,6-tetra-O-benzyl-β-D-galactopyranosyl-(1->3)-2-azido-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl]-L-serine allyl ester
  参考文献：
  名称：

  Stereoselective synthesis of benzyl-protected β-galactosides by propionitrile-mediated glycosylation

  摘要：

  beta-Selective galactosylation was studied using a series of 2-O-benzylated phenyl 1-thio-galactosides and glycosyl acceptors in propionitrile with BSP-TTBP-Tf2O. The glycosylation enabled us to synthesize useful precursors of N-acetyllactosamine and core 1 O-glycoserine derivatives in a highly convergent manner. (c) 2008 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.tet.2008.01.029

文献信息

• Solid-Phase Synthesis of Core 8<i>O</i>-Glycan-Linked MUC5AC Glycopeptide
  作者：Makoto MAEMURA、Atsushi OHGAKI、Yuko NAKAHARA、Hironobu HOJO、Yoshiaki NAKAHARA

  DOI：10.1271/bbb.69.1575

  日期：2005.1

  The benzyl-protected disaccharide building blocks of core 8 O-glycan (15a/15b) for glycopeptide were stereoselectively synthesized by two glycosidation reactions with the glycosyl fluoride method. The building blocks were utilized in the solid-phase synthesis of a glycopeptide carrying two O-glycans with the consensus sequence of the tandem-repeat domain of MUC5AC. The synthetic glycopeptide was detached from the resin with reagent K, and subsequent debenzylation under conditions of low-acidity TfOH afforded glycopeptide 2. The synthetic sample will be used as a suitable standard in studies of the physicochemical or immunochemical characterization of mucin glycoforms.

  利用糖基化氟化物方法，通过两个糖苷化反应立体选择性地合成了用于糖肽的核心 8 O-聚糖（15a/15b）的苄基保护二糖构件。利用这些构件固相合成了含有两个 O-聚糖的糖肽，其序列与 MUC5AC 的串联重复结构域的共识序列一致。合成的糖肽用试剂 K 从树脂中分离出来，随后在低酸 TfOH 条件下进行脱苄基反应，得到糖肽 2。该合成样本将在粘蛋白糖形的物理化学或免疫化学表征研究中用作合适的标准。