trans-A11-B1-C5-D7 | 1242421-35-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: trans-A11-B1-C5-D7
• 英文别名: (2S,5S,8S,13S,16E)-2-(cyclopropylmethyl)-5-(furan-2-ylmethyl)-3,6,9,15,18-pentaoxo-8-[3-(pyrazine-2-carbonylamino)propyl]-1,4,7,10,14-pentazacyclooctadec-16-ene-13-carboxamide
• CAS: 1242421-35-7
• 化学式: C₃₁H₃₉N₉O₈
• 分子量: 665.706
• InChiKey: ISTHYUAXOLPQGF-KYKGGYACSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.3
• 重原子数：
  48
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  257
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  在 sodium periodate 、 HEPES sodium salt 作用下， 生成 cis-A11-B1-C5-D7 、 trans-A11-B1-C5-D7
  参考文献：
  名称：

  DNA 模板化小分子文库的体外选择揭示了一类大环激酶抑制剂

  摘要：

  DNA 模板有机合成能够将 DNA 序列翻译成适合体外选择的合成小分子文库。以前，我们描述了 13 824 成员小分子大环库的 DNA 模板多步合成。在这里，我们报告了通过针对 36 个生物医学相关蛋白质靶标的 DNA 模板小分子大环库的体外选择，发现了调节激酶活性的小分子。DNA 编码选择幸存者通过 PCR 扩增并通过超高通量 DNA 测序进行鉴定。与针对几种蛋白激酶进行选择而富集的 DNA 序列相对应的大环化合物以数毫克的规模合成。体外试验表明，这些大环化合物抑制（或激活）激酶，IC50 值低至 680 nM。我们深入表征了在针对 Src 激酶进行选择时富集的大环家族，并表明抑制高度依赖于大环构建块的身份以及骨架构象。即使在与 Src 密切相关的激酶中，该家族中的两个大环也表现出异常强的 Src 抑制选择性。发现一种大环化合物激活而不是抑制其靶激酶 VEGFR2。总之，这些结果确立了使用

  DOI：

  10.1021/ja104903x