1-[(2R,3R,4R,5R)-5-(tert-Butyl-diphenyl-silanyloxymethyl)-3-fluoro-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl]-5-methyl-1H-pyrimidine-2,4-dione | 110497-15-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-[(2R,3R,4R,5R)-5-(tert-Butyl-diphenyl-silanyloxymethyl)-3-fluoro-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl]-5-methyl-1H-pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 110497-15-9
• 化学式: C₂₆H₃₁FN₂O₅Si
• 分子量: 498.626
• InChiKey: KVLZILJAPPSBKV-GBEXAXCTSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.02
• 重原子数：
  35.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  93.55
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[(2R,3R,4R,5R)-5-(tert-Butyl-diphenyl-silanyloxymethyl)-3-fluoro-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl]-5-methyl-1H-pyrimidine-2,4-dione 在 2,6-二甲基吡啶 、 sodium tetrahydroborate 、 四氧化锇 、 偶氮二异丁腈 、 双(三甲基硅基)亚磷酸盐 、 甲基三苯氧基碘磷 、 水 、 N-甲基吗啉氧化物 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 苯 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-2',3'-dideoxy-2'-β-fluoro-3'-C-methyl-5-methyluridine
  参考文献：
  名称：

  新型3'-C-亚甲基胸苷和5-甲基尿苷/胞苷H-膦酸酯和亚膦酸酯的合成，用于寡核苷酸的新骨架修饰。

  摘要：

  新型5'-O-DMT-和MMT保护的3'-C-亚甲基修饰的胸苷，5-甲基尿苷和5-甲基胞苷H-膦酸酯1-7与O-甲基，氟，氢和O-（2通过一种新的有效策略，由相应的关键中间体3'-C-碘甲基核苷和中间体BTSP（通过Arbuzov反应原位制备）合成了2'-位的-甲氧基乙基）取代基。Arbuzov反应的修饰反应条件防止了DMT和MMT保护基的丢失，并直接提供了所需的5'-O-DMT-和/或MMT保护的3'-C-亚甲基修饰的H-膦酸酯1 -6虽然在PC键形成后也通过操纵保护基制备了一些。3'-C-碘甲基-5-甲基胞嘧啶53的修饰Arbuzov反应 由其5-甲基尿苷衍生物42制备，并用BTSP提供5-甲基胞嘧啶H-膦酸酯54，将其进一步转移到相应的4-N-（N-甲基吡咯烷-2-亚基）-保护的H-膦酸酯单体7。5使用DCC作为偶联剂，将'-O-MMT保护的3'-C-亚甲基改性的H-膦酸酯5、3和7

  DOI：

  10.1021/jo001699u
• 作为产物：
  描述：

  2’-氟胸苷 、 叔丁基二苯基氯硅烷 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 作用下， 反应 48.0h， 生成 1-[(2R,3R,4R,5R)-5-(tert-Butyl-diphenyl-silanyloxymethyl)-3-fluoro-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl]-5-methyl-1H-pyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of 2′‐Substituted MMI Linked Nucleosidic Dimers: An Optimization Study in Search of High Affinity Oligonucleotides for Use in Antisense Constructs

  摘要：

  The synthesis of a series of methylene(methylimino) (MMI) linked oligodeoxyribonucleotide dimers modified at the 2'-position with fluoro and/or methoxy groups and their incorporation into different sequences has been accomplished. From these dimers, his 2'-OMe MMI dimer was selected for further studies based on its synthetic accessibility and the increased thermodynamic stability conferred upon oligonucleotides incorporating this modification.

  DOI：

  10.1081/ncn-120028337