GpCpA | 5863-85-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 英文名称: GpCpA
• 英文别名: rGuo-P-rCyd-P-rAdo；[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-4-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] [(2R,3S,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-3-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-4-hydroxyoxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate
• CAS: 5863-85-4
• 化学式: C₂₉H₃₇N₁₃O₁₈P₂
• 分子量: 917.637
• InChiKey: PXSNWOFCVOVTHI-POYLIAOGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -9.1
• 重原子数：
  62
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  454
• 氢给体数：
  11
• 氢受体数：
  24

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  GpCpA 、 N-p-biphenylisopropoxycarbonyl-phenylalanine (Bpoc-Phe-OH) 生成 [(2R,3S,4R,5R)-2-[[[(2R,3S,4R,5R)-2-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-3H-purin-9-yl)-4-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxymethyl]-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-4-hydroxyoxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxymethyl]-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxyoxolan-3-yl] (2S)-2-amino-3-phenylpropanoate
  参考文献：
  名称：

  HAGEN, MICHAEL D.;CHLADEK, STANISLAV, NUCLEOSIDES AND NUCLEOTIDES, 8,(1989) N-6, C. 1019-1022

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  在 甲酸 作用下， 反应 0.5h， 生成 GpCpA 、 [(2R,3S,4R,5R)-2-[[[(2R,3S,4R,5R)-2-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-3H-purin-9-yl)-4-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxymethyl]-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-4-hydroxyoxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxymethyl]-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxyoxolan-3-yl] (2S)-2-amino-3-phenylpropanoate
  参考文献：
  名称：

  Aminoacyl derivatives of nucleosides, nucleotides, and polynucleotides. 45. Synthesis of 2'(3')-O-(aminoacyl) trinucleotides incorporating all four common bases

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jo00256a025

文献信息

• Base moiety selectivity in cleavage of short oligoribonucleotides by di- and tri-nuclear Zn(II) complexes of azacrown-derived ligands
  作者：Maarit Laine、Kaisa Ketomäki、Päivi Poijärvi-Virta、Harri Lönnberg

  DOI：10.1039/b904828f

  日期：——

  l]benzene (L1) and the trinuclear Zn2+ complex of 1,3,5-tris[(1,5,9-triazacyclododecan-3-yl)oxymethyl]benzene (L3) has been studied. The dinuclear complex cleaves at sufficiently low concentrations ([(Zn2+)2L1] ≤ 0.1 mmol L−1) the 5′NpU3′ and 5′UpN3′ bonds (N = G, C, A) much more readily than the other phosphodiester bonds, but leaves the 5′UpU3′ site intact. The trinuclear (Zn2+)3L3 complex, in turn

  六聚寡核糖核苷酸的双核Zn 2+配合物的切割。1,3-双[（（1,5,9-三氮杂环十二烷-3-基）氧基甲基]苯（L 1）和三核Zn 2+络合物1,3,5-三[[（1,5,9-三氮杂环十二烷-3-基）氧甲基]苯（L 3）已被研究。在足够低的浓度下的双核配合物裂解（[（锌2+）2大号1 ]≤0.1毫摩尔大号-1）的5' NPU 3'和5' UPN 3'键（N = G，C，A）更容易比其他磷酸二酯键，但叶片5' UPU 3'位点不变。三核（锌2+）3大号3复合物，进而，裂解5' UPU 3'键更容易比其他任何联系，甚至快于5' NPU3'和5' UPN 3'的网站。多少有些出人意料，在5' UPNpU 3'网站是由二和三核配都只能慢慢切割。当六核苷酸通过3个额外的2'- O-甲基核糖核苷酸CG对封闭在发夹环上时，碱基部分的选择性在质量上仍然相似，尽管略微不那么明显。双螺旋杆内磷酸二酯键不断裂，甚