5'-O-dimethoxytrityl-N(4)-benzoyl-2'-O-(t-butyldimethylsilyl)cytidine-3'-O-(2-chlorophenylphosphate)-5'-O-2'-O-t-butyldimethylsilyburidine | 1134195-49-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: 5'-O-dimethoxytrityl-N(4)-benzoyl-2'-O-(t-butyldimethylsilyl)cytidine-3'-O-(2-chlorophenylphosphate)-5'-O-2'-O-t-butyldimethylsilyburidine
• CAS: 1134195-49-5
• 化学式: C₆₄H₇₇ClN₅O₁₆PSi₂
• 分子量: 1294.94
• InChiKey: YZVGSDNFHUHTCN-VFDYIISWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  11.25
• 重原子数：
  89.0
• 可旋转键数：
  23.0
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  248.45
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  19.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  N-苯甲酰-5'-O-[二(4-甲氧基苯基)苯甲基]-2'-O-[(1,1-二甲基乙基)二甲基硅]-胞苷 、 2'-O-叔丁基二甲基硅烷基尿苷 在 苯甲基-2-磺酰三硝基三氮唑 、 N-甲基咪唑 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 1.0h， 以40%的产率得到5'-O-dimethoxytrityl-N(4)-benzoyl-2'-O-(t-butyldimethylsilyl)cytidine-3'-O-(2-chlorophenylphosphate)-5'-O-2'-O-t-butyldimethylsilyburidine
  参考文献：
  名称：

  Preparation of Nucleotide Oligomer

  摘要：

  本发明提供了一种制备核苷酸寡聚物的方法，包括(a)将核苷酸二聚体或核苷酸三聚体偶联到固相支撑上或通用固相支撑上的核苷酸作为起始物；(b)顺序地将核苷酸单体偶联到步骤(a)得到的结构上，制备核苷酸寡聚物；以及(c)从固相支撑上去除核苷酸寡聚物。本发明的方法提供了核苷酸寡聚物，其纯度比传统技术高出15-20%。本发明使得能够在较短时间内高效、廉价地合成高纯度的核苷酸寡聚物成为可能。

  公开号：

  US20100273999A1