摘要:
分别制备了含有碱基类似物3-deazaadenine和3-甲基-2-吡啶酮的两种核苷衍生物,作为dA和dT的类似物。在转化成适当保护的亚磷酰胺后,用位点特异性放置的类似物制备DNA序列。当存在于双链DNA序列中时,类似物导致存在于小沟中的一个或两个氢键合官能团(dA的N3-氮和dT的O2-羰基)缺失。已经使用多种DNA序列探测了小沟中两个配体的结合,即4',6-二dia基-2-苯基吲哚(DAPI)和Hoechst 33258。这些序列包含ad(GAATTC)2核心,该核心具有被一个或多个dA和dT残基取代的类似核苷。DAPI与任何包含两个中心dT残基的O2-羰基的序列牢固结合。dc3A残基的存在在某些情况下确实增强了结合。在中心O 2-羰基之一缺失的情况下,结合显着降低,而在两者都不存在的情况下,未检测到显着结合。类似的,尽管用Hoechst 33258与类似序列结合观察到的结果不太明显。