4-N-苯甲酰基-2'-O-[1-(4-氯苯基)-4-乙氧基哌啶-4-基]胞苷 | 263009-01-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 中文名称: 4-N-苯甲酰基-2'-O-[1-(4-氯苯基)-4-乙氧基哌啶-4-基]胞苷
• 英文名称: 4-N-Benzoyl-2'-O-[1-(4-chlorophenyl)-4-ethoxypiperidin-4-yl]cytidine
• 英文别名: N-[1-[(2R,3R,4R,5R)-3-[1-(4-chlorophenyl)-4-ethoxypiperidin-4-yl]oxy-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide
• CAS: 263009-01-4
• 化学式: C₂₉H₃₃ClN₄O₇
• 分子量: 585.057
• InChiKey: DQUXLERFUXACOX-LYPBTDJXSA-N

物化性质

• 密度：
  1.42±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  133
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-N-苯甲酰基-2'-O-[1-(4-氯苯基)-4-乙氧基哌啶-4-基]胞苷 在 氨 、 水 作用下， 反应 16.0h， 以85%的产率得到2'-O-[1-(4-Chlorophenyl)-4-ethoxypiperidin-4-yl]cytidine
  参考文献：
  名称：

  Some observations relating to the use of 1-aryl-4-alkoxypiperidin-4-yl groups for the protection of the 2′-hydroxy functions in the chemical synthesis of oligoribonucleotides

  摘要：

  讨论了在寡核苷酸合成中，十个1-芳基-4-甲氧基哌啶-4-基（R = Me，包括先前报道的Ctmp 5和Fpmp 6）保护基对2'-羟基功能的酸催化去除的相对速率。这些研究导致开发了1-(4-氯苯基)-4-乙氧基哌啶-4-基（Cpep）保护基8（R = Et，R1 = R2 = H，R3 = Cl），其在pH 0.5下比Ctmp和Fpmp群更加稳定，而在pH 3.75下更加不稳定。研究了核苷酸基在低pH和高pH下对2'-O-Fpmp和2'-O-Ctmp保护基稳定性的影响。

  DOI：

  10.1039/a908149f
• 作为产物：
  描述：

  1-(4-氯苯基)-哌啶-4-酮 在 三氟化硼乙醚 、 四乙基氟化铵水合物 、 对甲苯磺酸 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 6.25h， 生成 4-N-苯甲酰基-2'-O-[1-(4-氯苯基)-4-乙氧基哌啶-4-基]胞苷
  参考文献：
  名称：

  Some observations relating to the use of 1-aryl-4-alkoxypiperidin-4-yl groups for the protection of the 2′-hydroxy functions in the chemical synthesis of oligoribonucleotides

  摘要：

  讨论了在寡核苷酸合成中，十个1-芳基-4-甲氧基哌啶-4-基（R = Me，包括先前报道的Ctmp 5和Fpmp 6）保护基对2'-羟基功能的酸催化去除的相对速率。这些研究导致开发了1-(4-氯苯基)-4-乙氧基哌啶-4-基（Cpep）保护基8（R = Et，R1 = R2 = H，R3 = Cl），其在pH 0.5下比Ctmp和Fpmp群更加稳定，而在pH 3.75下更加不稳定。研究了核苷酸基在低pH和高pH下对2'-O-Fpmp和2'-O-Ctmp保护基稳定性的影响。

  DOI：

  10.1039/a908149f

文献信息

• LARGE-SCALE SYNTHESIS OF “Cpep” RNA MONOMERS AND THEIR APPLICATION IN AUTOMATED RNA SYNTHESIS
  作者：R. T. Pon、S. Yu、T. Prabhavalkar、T. Mishra、B. Kulkarni、Y. S. Sanghvi

  DOI：10.1081/ncn-200060150

  日期：2005.4.1

  Small interfering RNAs (siRNA) are the latest candidates for oligonucleotide-based therapeutics. Should siRNA be successful in clinical trials, a huge demand for synthetic RNA is anticipated. We believe that 1-(4-chlorophenyl)-4-ethoxypiperidin-4-yl(Cpep) is an ideal 2'-protecting group for large-scale syntheses. Unlike 2'-silyl groups, mild acid hydrolysis instead of fluoride ion is used for the 2'-deprotection. The syntheses of 2'-Cpep protected nucleosides (A, Q G, and U) has been accomplished on a 0.5 Kg scale. The 2'-Cpep monomers were transformed into 3'-O-phosphoramidites for conventional automated solid-phase synthesis. Cost-effective processes for large-scale synthesis of Cpep monomers and initial automated solid-phase synthesis are demonstrated.
• Some observations relating to the use of 1-aryl-4-alkoxypiperidin-4-yl groups for the protection of the 2′-hydroxy functions in the chemical synthesis of oligoribonucleotides
  作者：Wayne Lloyd、Colin B. Reese、Quanlai Song、Anthony M. Vandersteen、Cristina Visintin、Pei-Zhou Zhang

  DOI：10.1039/a908149f

  日期：——

  The comparative rates of acid-catalysed removal of ten 1-aryl-4-methoxypiperidin-4-yl 8 (R = Me) [including the previously reported Ctmp 5 and Fpmp 6] protecting groups for the 2′-hydroxy functions in oligoribonucleotide synthesis are discussed. These studies have led to the development of the 1-(4-chlorophenyl)-4-ethoxypiperidin-4-yl (Cpep) protecting group 8 (R = Et, R1 = R2 = H, R3 = Cl) which is both more stable than the Ctmp and Fpmp groups at pH 0.5 and more labile at pH 3.75. The influence of the ribonucleoside aglycone on the stability of the 2′-O-Fpmp and 2′-O-Ctmp protecting groups both at low and high pH is examined.

  讨论了在寡核苷酸合成中，十个1-芳基-4-甲氧基哌啶-4-基（R = Me，包括先前报道的Ctmp 5和Fpmp 6）保护基对2'-羟基功能的酸催化去除的相对速率。这些研究导致开发了1-(4-氯苯基)-4-乙氧基哌啶-4-基（Cpep）保护基8（R = Et，R1 = R2 = H，R3 = Cl），其在pH 0.5下比Ctmp和Fpmp群更加稳定，而在pH 3.75下更加不稳定。研究了核苷酸基在低pH和高pH下对2'-O-Fpmp和2'-O-Ctmp保护基稳定性的影响。