benzyl (R)‐2‐(((6S,9R,12S,15R,18S,21R,24S)‐2,2,5,6,11,12,17,18,23,24‐decamethyl‐4,7,10,13,16,19,22‐heptaoxo‐9,15,21‐tripentyl‐3,8,14,20‐tetraoxa‐5,11,17,23‐tetraazapentacosan‐25‐oyl)oxy)heptanoate | 917613-40-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: benzyl (R)‐2‐(((6S,9R,12S,15R,18S,21R,24S)‐2,2,5,6,11,12,17,18,23,24‐decamethyl‐4,7,10,13,16,19,22‐heptaoxo‐9,15,21‐tripentyl‐3,8,14,20‐tetraoxa‐5,11,17,23‐tetraazapentacosan‐25‐oyl)oxy)heptanoate
• 英文别名: Boc-N(Me)Ala-D-ONle(Me)-N(Me)Ala-D-ONle(Me)-N(Me)Ala-D-ONle(Me)-N(Me)Ala-D-ONle(Me)-OBn；benzyl (2R)-2-[(2S)-2-[methyl-[(2R)-2-[(2S)-2-[methyl-[(2R)-2-[(2S)-2-[methyl-[(2R)-2-[(2S)-2-[methyl-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyl]amino]propanoyl]oxyheptanoyl]amino]propanoyl]oxyheptanoyl]amino]propanoyl]oxyheptanoyl]amino]propanoyl]oxyheptanoate
• CAS: 917613-40-2
• 化学式: C₅₆H₉₂N₄O₁₅
• 分子量: 1061.36
• InChiKey: DJQPOCVWDJLMMH-AXMRCQICSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  11.9
• 重原子数：
  75
• 可旋转键数：
  41
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  222
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  15

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  benzyl (R)‐2‐(((6S,9R,12S,15R,18S,21R,24S)‐2,2,5,6,11,12,17,18,23,24‐decamethyl‐4,7,10,13,16,19,22‐heptaoxo‐9,15,21‐tripentyl‐3,8,14,20‐tetraoxa‐5,11,17,23‐tetraazapentacosan‐25‐oyl)oxy)heptanoate 在 palladium on activated charcoal 氢气 作用下， 以 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 (R)-2-[(S)-2-({(R)-2-[(S)-2-({(R)-2-[(S)-2-({(R)-2-[(S)-2-(tert-Butoxycarbonyl-methyl-amino)-propionyloxy]-heptanoyl}-methyl-amino)-propionyloxy]-heptanoyl}-methyl-amino)-propionyloxy]-heptanoyl}-methyl-amino)-propionyloxy]-heptanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Verticilide：阐明绝对构型和总合成。

  摘要：

  Verticilide（1）是从Verticillium sp。的培养液中分离得到的24元环状二肽。FKI-1033。它抑制了雷诺定与雷诺定受体（RyR）的结合，并具有杀虫活性。通过手性HPLC分析降解产物6以及合成的（+）和（-）-6，阐明了旋苯环内酯中2-羟基庚酸的立体化学。我们还描述了切实可行的全合成verticilide。[反应：请参见文字]。

  DOI：

  10.1021/ol0623365
• 作为产物：
  描述：

  N-Boc-N-Me-L-Ala-(R)-Hep-N-Me-L-Ala-(R)-Hep 、 (R)-2-((S)-2-{Methyl-[(R)-2-((S)-2-methylamino-propionyloxy)-heptanoyl]-amino}-propionyloxy)-heptanoic acid benzyl ester; hydrochloride 在 N,N-二异丙基乙胺 、 bromo-tris(1-pyrrolidinyl)phosphonium hexafluorophosphate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 以7.80 g的产率得到benzyl (R)‐2‐(((6S,9R,12S,15R,18S,21R,24S)‐2,2,5,6,11,12,17,18,23,24‐decamethyl‐4,7,10,13,16,19,22‐heptaoxo‐9,15,21‐tripentyl‐3,8,14,20‐tetraoxa‐5,11,17,23‐tetraazapentacosan‐25‐oyl)oxy)heptanoate
  参考文献：
  名称：

  Verticilide：阐明绝对构型和总合成。

  摘要：

  Verticilide（1）是从Verticillium sp。的培养液中分离得到的24元环状二肽。FKI-1033。它抑制了雷诺定与雷诺定受体（RyR）的结合，并具有杀虫活性。通过手性HPLC分析降解产物6以及合成的（+）和（-）-6，阐明了旋苯环内酯中2-羟基庚酸的立体化学。我们还描述了切实可行的全合成verticilide。[反应：请参见文字]。

  DOI：

  10.1021/ol0623365

文献信息

• Ring Size as an Independent Variable in Cyclooligomeric Depsipeptide Antiarrhythmic Activity
  作者：Abigail N. Smith、Daniel J. Blackwell、Bjorn C. Knollmann、Jeffrey N. Johnston

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.1c00508

  日期：2021.12.9

  identify a lead compound. Recrafting the three-dimensional space occupied by a small molecule, optimization of hydrogen bond contacts, and enhancing local attractive interactions are traditional approaches in medicinal chemistry. Ring size, however, is rarely able to be leveraged as an independent variable because most hits lack the symmetry required for such a study. Our discovery that the cyclic oligomeric

  命中先导研究采用多种策略来优化与感兴趣靶标的结合。当目标结构可用时，假设驱动的构效关系 (SAR) 是一种强大的策略，可用于精炼药效团，以实现识别先导化合物所需的稳健结合和选择性特征。重构小分子占据的三维空间、优化氢键接触以及增强局部吸引力相互作用是药物化学的传统方法。然而，环尺寸很少能够用作自变量，因为大多数命中缺乏此类研究所需的对称性。我们发现环状寡聚缩酚肽-verticilide 以亚微摩尔效力抑制哺乳动物心脏兰尼碱受体钙释放通道，提供了探索环大小作为变量的机会，独立于其他结构或功能组的变化。我们在此报告，环大小可能是一个关键的自变量，这表明仅适度的构象变化就可以显着影响效力。