pyrimidoblamic acid | 75452-30-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: pyrimidoblamic acid
• 英文别名: 6-amino-2-[(1S)-3-amino-1-[[(2S)-3-amino-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-3-oxopropyl]amino]-3-oxopropyl]-5-methylpyrimidine-4-carboxylic acid
• CAS: 75452-30-1
• 化学式: C₁₇H₂₇N₇O₆
• 分子量: 425.445
• InChiKey: XVCYESGSBIEXAS-IUCAKERBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.2
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  226
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  pyrimidoblamic acid 在 盐酸 作用下， 以 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 1.0h， 以100%的产率得到(-)-Pyrimidoblamsaeure
  参考文献：
  名称：

  Boger, Dale L.; Menezes, Royce F.; Honda, Takeshi, Angewandte Chemie, 1993, vol. 105, # 2, p. 310 - 311

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  Boc-Dap(NH₂)-CONH₂ 在 双氧水 作用下， 以 乙醚 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.5h， 生成 pyrimidoblamic acid
  参考文献：
  名称：

  抗肿瘤抗生素博来霉素的合成研究。十四。Boc-嘧啶基溴酸的合成。

  摘要：

  在希夫碱 2 与丙二酸单酯或乙烯氧基硼烷反应的基础上，开发了将醋酸单元引入希夫碱 2 的新方法。此外，还利用这两种方法合成了 Boc-嘧啶基氨基甲酸，它是全合成博来霉素的关键片段。

  DOI：

  10.1248/cpb.33.520

文献信息

• Synthesis and evaluation of deglycobleomycin A2 analogues containing a tertiary N-methyl amide and simple ester replacement for the l-histidine secondary amide: Direct functional characterization of the requirement for secondary amide metal complexation
  作者：Dale L. Boger、Shuji Teramoto、Hui Cai

  DOI：10.1016/0968-0896(95)00183-2

  日期：1996.2

  indistinguishable from those of deglycobleomycin A2 (2) confirming that the distinctions between bleomycin A2 (1) and deglycobleomycin (2) are due to the removal of the disaccharide and not the introduction of the L-histidine free beta-hydroxy group. The agents 4 and 5 containing a tertiary N-methyl amide and ester in place of the L-histidine secondary amide were found to cleave duplex DNA but to do so in a nonsequence

  详述了3-5个脱糖霉素A2（2）的类似物的合成和比较研究，它们直接解决了L-组氨酸仲酰胺的重要性。试剂3仅缺少脱糖霉素A2的L-组氨酸β-羟基，并且相应的试剂4和5掺入叔N-甲基酰胺和简单的酯代替L-组氨酸仲酰胺。3的DNA切割特性与脱糖霉素A2（2）基本上没有区别，这证实了博莱霉素A2（1）和脱糖霉素（2）之间的区别是由于去除了二糖而不是引入了不含L-组氨酸的β-羟基。发现含有叔N-甲基酰胺和酯代替L-组氨酸仲酰胺的试剂4和5可以裂解双链DNA，但以非序列选择性方式裂解，效率大大降低，双链至单链减少裂解率仅略大于游离铁本身。后面这些观察结果确定了L-组氨酸仲酰胺的功能要求，并与L-组氨酸去质子化的仲酰胺是功能性金属螯合和活性所必需的建议相一致。
• Assessment of the Role of the Bleomycin A₂ Pyrimidoblamic Acid C4 Amino Group
  作者：Dale L. Boger、Timothy M. Ramsey、Hui Cai、Silvia T. Hoehn、John W. Kozarich、JoAnne Stubbe

  DOI：10.1021/ja971889v

  日期：1998.1.1

  The preparation and examination of 3 and 4 and their unnatural epimers 6 and 7 by following a new and alternative synthesis of 2 was conducted to assess the role of the pyrimidine C4 amine of bleomycin A2 (1) and deglycobleomycin A2 (2). The agent 3 bearing a pyrimidine C4 dimethylamino substituent exhibited a substantially diminished DNA cleavage efficiency (10−15×) relative to 2 and the loss of the

  3 和 4 及其非天然差向异构体 6 和 7 的制备和检查遵循 2 的新的替代合成，以评估博来霉素 A2 (1) 和去甘博莱霉素 A2 (2) 的嘧啶 C4 胺的作用。带有嘧啶 C4 二甲氨基取代基的试剂 3 表现出相对于 2 显着降低的 DNA 切割效率（10-15 倍）和特征 5'-GC/5'-GT 切割选择性的丧失。与2相比，去除嘧啶C4氨基的试剂4表现出更大的DNA切割效率降低（30倍）。对于该试剂，特征切割选择性根据测定条件略微或显着降低。即使在没有实质性改变的情况下，检测它的能力需要 4 与 25-37 °C 的温度。此信息和温度依赖性表明结合相互作用减少，并且与嘧啶 C4 a...
• On the role of individual bleomycin thiazoles in oxygen activation and DNA cleavage
  作者：Norimitsu Hamamichi、Anand Natrajan、Sidney M. Hecht

  DOI：10.1021/ja00042a002

  日期：1992.7

  novel bleomycin (BLM) analogs were prepared by total synthesis to permit the evaluation of the role of individual thiazole moieties in the processes of bleomycin-mediated oxygen activation and DNA degradation. Each of the compounds was structurally related to deglycobleomycin demethyl A 2 but contained an S-methyl-L-cysteine moiety in lieu of one of the two thiazoles normally present in bleomycin

  通过全合成制备了两种结构新颖的博来霉素 (BLM) 类似物，以评估单个噻唑部分在博来霉素介导的氧活化和 DNA 降解过程中的作用。每种化合物在结构上都与去甘博来霉素脱甲基 A 2 相关，但含有 S-甲基-L-半胱氨酸部分，代替了通常存在于博来霉素中的两种噻唑中的一种
• Solid-Phase Synthesis of Bleomycin Group Antibiotics. Construction of a 108-Member Deglycobleomycin Library
  作者：Christopher J. Leitheiser、Kenneth L. Smith、Michael J. Rishel、Shigeki Hashimoto、Kazuhide Konishi、Craig J. Thomas、Chunhong Li、Michael M. McCormick、Sidney M. Hecht

  DOI：10.1021/ja021388w

  日期：2003.7.1

  structural modifications to bleomycin and deglycobleomycin have been reported, no bleomycin or deglycobleomycin analogue having enhanced DNA cleavage activity has yet been described. The successful synthesis of a deglycobleomycin on a solid support has permitted the facile solid-phase synthesis of 108 unique deglycobleomycin analogues through parallel solid-phase synthesis. Each of the deglycobleomycin analogues

  博来霉素 (BLM) 是从轮状链霉菌中分离出的结构相关的糖肽抗生素，可介导 DNA 和 RNA 的序列选择性氧化损伤。去糖博来霉素缺乏碳水化合物部分，可以像博来霉素本身一样切割 DNA，尽管效力较低，并且已成功用于分析博来霉素的功能域。尽管已经报道了对博来霉素和去甘博来霉素的结构修饰，但尚未描述具有增强的 DNA 切割活性的博来霉素或去甘博来霉素类似物。在固体支持物上成功合成了去甘博莱霉素，允许通过平行固相合成轻松固相合成 108 种独特的去甘博莱霉素类似物。每种去糖博莱霉素类似物都被有效合成；通过HPLC积分确定每种粗产物的纯度大于60%。去糖博莱霉素库的固相合成提供了接近毫克到毫克的每种去糖博莱霉素，从而允许通过 (1) H NMR 和高分辨率质谱法进行表征。每个类似物都表现出高于背景切割的超螺旋质粒 DNA 松弛；该文库包括两种类似物，它们比亲本去糖霉素分子在更大程度上介导质粒松弛。
• Synthetic studies on an antitumor antibiotic, bleomycin. XIV. The synthesis of Boc-pyrimidoblamic acid.
  作者：MASAMI OTSUKA、MASATOSHI NARITA、MAKOTO YOSHIDA、SUSUMU KOBAYASHI、MASAJI OHNO、YOJI UMEZAWA、HAJIME MORISHIMA、SEIICHI SAITO、TOMOHISA TAKITA、HAMAO UMEZAWA

  DOI：10.1248/cpb.33.520

  日期：——

  New methodology was developed for the introduction of an acetate unit into the Schiff base 2, based on the reaction of the Schiff base 2 with malonic acid monoester or vinyloxyborane. Furthermore, the synthesis of Boc-pyrimidoblamic acid, a key fragment for the total synthesis of bleomycin, was achieved by utilizing these two methods.

  在希夫碱 2 与丙二酸单酯或乙烯氧基硼烷反应的基础上，开发了将醋酸单元引入希夫碱 2 的新方法。此外，还利用这两种方法合成了 Boc-嘧啶基氨基甲酸，它是全合成博来霉素的关键片段。