Fmoc-L-lysyl-(N^εBoc)-diazomethane | 203854-38-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: Fmoc-L-lysyl-(N^εBoc)-diazomethane
• 英文别名: Fmoc-Lys(Boc)-CHN2；Fmoc-Lys(Boc)-DAM；(S)-7-{[(tert-butoxy)carbonyl]amino}-1-diazo-3-{[(9H-fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl]amino}heptane-2-one；tert-butyl N-[(5S)-7-diazo-5-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-6-oxoheptyl]carbamate
• CAS: 203854-38-0
• 化学式: C₂₇H₃₂N₄O₅
• 分子量: 492.575
• InChiKey: ZLDANRRZEKEJMJ-QHCPKHFHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.6
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  95.7
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Fmoc-L-lysyl-(N^εBoc)-diazomethane 在 N-甲基吗啉 、 silver trifluoroacetate 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 (3S)-3-[[(3R,4R)-3-acetamido-4-hydroxypentanoyl]amino]-7-amino-N-[(2S)-4-[[(2S)-4-amino-4-oxo-1-phenylbutan-2-yl]amino]-1-(1H-indol-3-yl)-4-oxobutan-2-yl]heptanamide
  参考文献：
  名称：

  肽折叠诱导线性和小的β肽对人类生长抑素受体4的高选择性亲和力。

  摘要：

  已知相邻残基（具有（S）构型）的2和3位侧链的β肽会折叠并形成一个转角（类似于α肽β转角）。因此，我们合成了适当取代的β-四肽衍生物，以模拟生长激素抑制素与人类受体hsst（1-5）的结合，后者已知会在含有氨基酸残基Thr，Lys，Trp，和Phe。N-乙酰基肽酰胺Ac-beta（3）-HThr-beta（2）-HLys-beta（3）-HTrp-beta（3）-HPhe-NH（2）（1）确实显示了有针对性的拟态模拟：Lys CH（2）基团位于Trp吲哚环的屏蔽锥中（通过NMR分析，图2），并且对hsst（4）受体具有很高的纳摩尔亲和力（表1）。相比之下，带有Lys侧链的异构体2位于3-位，而不是位于2位，与hsst（4）的亲和力小1000倍。描述了所需的Fmoc保护的β-氨基酸（8-11、17）的合成（方案1-3）。β-氨基酸的偶联是通过手动固相技术在Rink树脂上完成的。

  DOI：

  10.1021/jm010816q
• 作为产物：
  描述：

  (2S)-2-amino-6-{[(tert-butoxy)carbonyl]amino}hexanoic acid hydrochloride 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 Fmoc-L-lysyl-(N^εBoc)-diazomethane
  参考文献：
  名称：

  一锅法从α-氨基酸制备N -9-芴基甲氧基羰基-α-氨基重氮酮

  摘要：

  该研究描述了一种新的“一锅法”合成N -9-芴基甲氧羰基（Fmoc）α-氨基重氮酮的途径。在一系列用作前体的可商购获得的游离或侧链保护的α-氨基酸上测试了该程序。通过用一种试剂，即9-芴基甲基氯甲酸酯（Fmoc-Cl）掩盖和活化α-氨基酸，可以实现向标题化合物的转化。使所得的N-保护的混合酸酐与重氮甲烷反应以生成α-氨基重氮酮，将其通过快速柱色谱法以非常好的至优异的总产率分离。在亲脂性α-氨基酸上验证了该方法的多功能性，并通过制备N进一步证明了该方法的有效性。-Fmoc-α-氨基重氮酮也来自含有侧链掩蔽基团的α-氨基酸，该侧链与Fmoc正交。结果证实，叔丁氧基羰（BOC），叔丁基（吨丁基），和2,2,4,6,7-五甲基-5-磺酰基（了Pbf），三酸不稳定的保护基团主要是在采用的解决办法和固相肽合成，与所采用的反应条件相容。在所有情况下，未观察到起始氨基酸的相应的C-甲基酯的形成。此外，所提

  DOI：

  10.1021/jo301657e

文献信息

• Applying Small Molecule Microarrays and Resulting Affinity Probe Cocktails for Proteome Profiling of Mammalian Cell Lysates
  作者：Haibin Shi、Mahesh Uttamchandani、Shao Q. Yao

  DOI：10.1002/asia.201100523

  日期：2011.10.4

  present in the sample. The brightest microarray hits were converted to affinity‐based probes (AfBPs) using convenient, 1‐step “click” chemistry with benzophenone from the relevant building blocks. Pull‐down/mass spectrometric analysis with these probes (individuals or cocktail) yielded putative protein targets that include well‐known aspartic proteases, such as cathepsin D which is a clear marker for

  事实证明，小分子微阵列（SMM）越来越成为评估蛋白质与配体相互作用以及以高通量方式筛选酶底物和抑制剂的重要工具。我们之前描述了一种SMM辅助的筛选策略，用于快速鉴定针对天冬氨酸蛋白酶γ-分泌酶的探针。在本文中，我们将扩展使用羟乙基胺衍生的抑制剂的扩展库，该抑制剂非排他性地针对天冬氨酸蛋白酶。我们的库在P 2，P 1，P 1 '和P 2 '上是多样化的职位。因此，使用组合固相合成方法合成了86种新抑制剂，使总文库大小达到284种生物素化化合物，并排列在抗生物素蛋白载玻片上。为了阐明复杂生物样品中的酶活性和特性，使用荧光标记的哺乳动物细胞裂解液进行了筛选。这产生了可再现的图谱或结合指纹，与天冬氨酸蛋白酶或辅助蛋白以及样品中存在的其他相互作用靶标的相互作用相对应。最亮的芯片命中率转换为基于亲和力的探针（A fBP）使用便捷的第一步“点击”化学反应，并使用来自相关构件的二苯甲酮。使用这些探针（个人
• Homologation of α-amino acids to β-amino acids using Boc₂O
  作者：Ganga-Ramu Vasanthakumar、Basanagoud S. Patil、Vommina V. Suresh Babu

  DOI：10.1039/b204652k

  日期：——

  The use of Boc2O as a coupling agent in the homologation of N-urethane protected-α-amino acid to its β-homomers by the Arndt–Eistert method is described. The homologation gives good yields without racemization. The use of Boc2O as a coupling agent not only allows the easy scale up of the process but also it is cost effective.

  在利用Arndt-Eistert方法将N-羟基脲保护的α-氨基酸同系化为其β-同系物的过程中，使用Boc2O作为偶联剂的方法已被描述。该同系化反应能够获得良好的产率，且不会发生消旋化。使用Boc2O作为偶联剂不仅使得过程易于放大，而且在成本方面也是经济有效的。
• Cyclic β-Tetra- and Pentapeptides: Synthesis through On-Resin Cyclization and Conformational Studies by X-Ray, NMR and CD Spectroscopy and Theoretical Calculations
  作者：Frank Büttner、Anna S. Norgren、Suode Zhang、Samran Prabpai、Palangpon Kongsaeree、Per I. Arvidsson

  DOI：10.1002/chem.200500249

  日期：2005.10.21

  The solution-phase synthesis of the simplest cyclic beta-tetrapeptide, cyclo(beta-Ala)4 (4), as well as the solid-phase syntheses through side chain anchoring and on-resin cyclization of the cyclic beta3-tetrapeptide cyclo(-beta3hPhe-beta3hLeu-beta3hLys-beta3hGln-) (14) and the first cyclic beta3-pentapeptide cyclo(-beta3hVal-beta3hPhe-beta3hLeu-beta3hLys-beta3hLys-) (19) are reported. Extensive computational

  最简单的环状β-四肽环（β-Ala）4（4）的溶液相合成，以及通过环状β3-四肽环（-）的侧链锚固和树脂环化的固相合成报告了beta3hPhe-beta3hLeu-beta3hLys-beta3hGln-）（14）和第一个环状beta3-pentapeptide环（-beta3hVal-beta3hPhe-beta3hLeu-beta3hLys-beta3hLys-）（19）。进行了广泛的计算和光谱学研究，包括X射线和NMR光谱学，以确定这些非天然低聚物在溶液中和固态时的优选构象。没有手性侧链的环β-Ala）4（4）被显示为溶液中快速互换的构象异构体的混合物，而在环-β3-四肽中包含手性侧链会稳定一个主要的构象异构体。另一方面，环状β3-五肽显示更大的构象自由度。非手性环β-Ala）4（4）的X射线结构显示Ci对称的16元环，相邻的C = O和NH原子相对于环平面成对地指向和指向下方。进行
• Preparation ofN-Fmoc-Protected ?2- and ?3-Amino Acids and their use as building blocks for the solid-phase synthesis of ?-peptides
  作者：Gilles Guichard、Stefan Abele、Dieter Seebach

  DOI：10.1002/hlca.19980810202

  日期：1998.2.4

  solid-phase synthesis apparatus using conventional solid-phase peptide synthesis procedures (Scheme 3). In the case of β3-peptides, two methods were used to anchor the first β-amino acid: esterification of the ortho-chlorotrityl chloride resin with the first Fmoc-β-amino acid 2 (Method I, Scheme 2) or acylation of the 4-(benzyloxy)benzyl alcohol resin (Wang resin) with the ketene intermediates from the Wolff

  受N -Fmoc保护的（Fmoc =（9 H-氟-9-基甲氧基）羰基）β-氨基酸是在固相支持物上高效合成β-寡肽所必需的。对映体纯的Fmoc-β 3 -氨基酸β 3：侧链和NH 2在C（3）（= C（β））从Fmoc保护的（制备小号） -和（- [R）-α-氨基酸与脂族，芳香族和官能化侧链，使用标准或优化的Arndt-Eistert反应顺序。将Fmoc-β 2 -氨基酸（β 2在C（2），NH侧链2（中C 3）（= C（β）））配置轴承丙氨酸，缬氨酸，亮氨酸，和Phe的侧链合成经由所述埃文斯'手性助剂的方法。目标β 3个-heptapeptides 5-8，一个β 3 -十五肽9和β 2 -heptapeptide 10使用常规的固相肽合成方法（在手动固相合成装置合成方案3）。在β的情况下3 -肽，两种方法被用于锚定所述第一β氨基酸：酯化的邻-chlorotrityl氯乙烯树脂与所述第一的
• Improved Cathepsin Probes for Sensitive Molecular Imaging
  作者：Yonit Yitzhak、Hanmant Gaikwad、Tommy Weiss-Sadan、Emmanuelle Merquiol、Boris Turk、Galia Blum

  DOI：10.3390/molecules27030842

  日期：——

  monitor intracellular cathepsin activity and better ascertain their functions under these circumstances. Previous fluorescent activity-based probes (ABPs) that target cathepsins B, L, and S enabled detection of their activity in intact cells as well as non-invasive detection in animal disease models. However, their binding potency is suboptimal compared to the cathepsin inhibitor on which they were based

  半胱氨酸组织蛋白酶在正常条件下存在于细胞的溶酶体区室中，它们在各种细胞过程中发挥关键作用，例如蛋白质和脂质代谢、自噬、抗原呈递以及细胞生长和增殖。因此，异常的定位和活动会导致多种病理状况，例如各种恶性肿瘤、心血管疾病、骨质疏松症和其他疾病。因此，人们重新关注扩展工具包以监测细胞内组织蛋白酶活性并更好地确定它们在这些情况下的功能。以前针对组织蛋白酶 B、L 和 S 的基于荧光活性的探针 (ABP) 能够检测它们在完整细胞中的活性以及在动物疾病模型中的非侵入性检测。然而，与它们所基于的组织蛋白酶抑制剂相比，它们的结合效力是次优的，因为 P1 正电荷被报告标记所覆盖。在这里，我们展示了一种改进的组织蛋白酶 ABP 的开发，该组织蛋白酶 ABP 通过将标签连接到探针末端的额外氨基酸上而具有 P1 正电荷。在增强对重组组织蛋白酶的效力的同时，新探针由于额外的肽键而降低了细胞通透性。在第二阶段，探头被