N-benzoyl-N'-(3-cyano-5,6-dihydro-4H-cyclopenta[b]-2-thienyl)thiourea | 328072-42-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: N-benzoyl-N'-(3-cyano-5,6-dihydro-4H-cyclopenta[b]-2-thienyl)thiourea
• 英文别名: N-[(3-cyano-5,6-dihydro-4H-cyclopenta[b]thiophen-2-yl)carbamothioyl]benzamide
• CAS: 328072-42-0
• 化学式: C₁₆H₁₃N₃OS₂
• mdl: MFCD00682355
• 分子量: 327.431
• InChiKey: OMXAWDLXQJAZRU-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  213-214 °C
• 密度：
  1.42±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.19
• 拓扑面积：
  125
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-benzoyl-N'-(3-cyano-5,6-dihydro-4H-cyclopenta[b]-2-thienyl)thiourea 在 乙醇 、 potassium carbonate 、 sodium hydroxide 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 10-(2-Pyrrolidin-1-ylethylsulfanyl)-7-thia-9,11-diazatricyclo[6.4.0.02,6]dodeca-1(12),2(6),8,10-tetraen-12-amine
  参考文献：
  名称：

  结核分枝杆菌乙酰转移酶Eis抑制剂的结构指导优化。

  摘要：

  结核分枝杆菌（Mtb）的增强的细胞内存活（Eis）蛋白是一种多功能的乙酰转移酶，可对氨基糖苷类抗生素进行多乙酰化，从而消除了与细菌核糖体的结合。当由于启动子突变而过表达时，Eis引起耐药性。为了克服Eis介导的Mtb的卡那霉素耐药性，我们设计并优化了结构独特的硫代[2,3- d ]嘧啶Eis抑制剂，以实现有效的卡那霉素佐剂联合治疗。我们获得了12种酶抑制剂复合物的晶体结构，这指导了我们合理的基于72 thieno [2,3- d]嘧啶类似物分为三个家族。我们评估了这些抑制剂在体外的效力，以及它们在抗性Mtb菌株中恢复卡那霉素活性的能力，其中Eis被上调。此外，我们评估了11种化合物的体外代谢稳定性。这项研究展示了结构信息如何指导Eis抑制剂的设计。

  DOI：

  10.1021/acschembio.0c00184
• 作为产物：
  描述：

  环戊酮 在 吗啉 、 1,2,3,4,5,6,7,8-八硫杂环辛烷 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 乙醇 为溶剂， 生成 N-benzoyl-N'-(3-cyano-5,6-dihydro-4H-cyclopenta[b]-2-thienyl)thiourea
  参考文献：
  名称：

  结核分枝杆菌乙酰转移酶Eis抑制剂的结构指导优化。

  摘要：

  结核分枝杆菌（Mtb）的增强的细胞内存活（Eis）蛋白是一种多功能的乙酰转移酶，可对氨基糖苷类抗生素进行多乙酰化，从而消除了与细菌核糖体的结合。当由于启动子突变而过表达时，Eis引起耐药性。为了克服Eis介导的Mtb的卡那霉素耐药性，我们设计并优化了结构独特的硫代[2,3- d ]嘧啶Eis抑制剂，以实现有效的卡那霉素佐剂联合治疗。我们获得了12种酶抑制剂复合物的晶体结构，这指导了我们合理的基于72 thieno [2,3- d]嘧啶类似物分为三个家族。我们评估了这些抑制剂在体外的效力，以及它们在抗性Mtb菌株中恢复卡那霉素活性的能力，其中Eis被上调。此外，我们评估了11种化合物的体外代谢稳定性。这项研究展示了结构信息如何指导Eis抑制剂的设计。

  DOI：

  10.1021/acschembio.0c00184

文献信息

• 2-(Benzoylimino)thiazolidin-4-ones: Formation by an Alternative Ring Closure and Analysis of Rotational Barriers
  作者：Michael Gütschow、Hans-Georg Häcker、Paul Elsinghorst、Susanne Michels、Jörg Daniels、Gregor Schnakenburg

  DOI：10.1055/s-0028-1087995

  日期：2009.4

  The reactions of N-benzoyl-N′-(o-cyanoaryl)thioureas with ethyl bromoacetate under alkaline conditions led to the form­ation of either fused 2-(alkylsulfanyl)-4-aminopyrimidines or 2-(benzoylimino)-3-(o-cyanoaryl)thiazolidin-4-ones. The accurate application of slightly different reaction conditions allowed us to adjust the balance between the formation of the pyrimidine or thiazolidine heterocycles. Atropisomerism in the 3-(o-cyanoaryl)thiazolidin-4-ones was influenced by the size of the o-cyanoaryl ring, which was investigated by means of NMR measurements and theoretical calculations.

  在碱性条件下，N-苯甲酰基-N′-（邻氰基芳基）硫脲与溴乙酸乙酯反应，生成融合的 2-（烷基硫酰基）-4-氨基嘧啶或 2-（苯甲酰基亚氨基）-3-（邻氰基芳基）噻唑烷-4-酮。通过准确地应用略有不同的反应条件，我们可以调整嘧啶或噻唑烷杂环形成之间的平衡。3-(o-氰基芳基)噻唑烷-4-酮中的异构体受邻氰基芳基环大小的影响，这一点通过核磁共振测量和理论计算进行了研究。
• EIS INHIBITORS
  申请人：University of Kentucky Research Foundation

  公开号：US20180162867A1

  公开（公告）日：2018-06-14

  Compounds and compositions are disclosed, which are useful as inhibitors of acetyltransferase Eis, a mediator of kanamycin resistance in Mycobacterium tuberculosis.

  揭示了作为乙酰转移酶Eis抑制剂的化合物和组合物，该酶是结核分枝杆菌中卡那霉素抗性的介质。
• Eis inhibitors
  申请人：University of Kentucky Research Foundation

  公开号：US10253035B2

  公开（公告）日：2019-04-09

  Compounds and compositions are disclosed, which are useful as inhibitors of acetyltransferase Eis, a mediator of kanamycin resistance in Mycobacterium tuberculosis.

  本研究公开了可作为乙酰转移酶 Eis 抑制剂的化合物和组合物，乙酰转移酶 Eis 是结核分枝杆菌对卡那霉素产生抗药性的介质。
• Analogs of a 4-aminothieno[2,3-d]pyrimidine lead (QB13) as modulators of P-glycoprotein substrate specificity
  作者：Hans-Georg Häcker、Antje de la Haye、Katja Sterz、Gregor Schnakenburg、Michael Wiese、Michael Gütschow

  DOI：10.1016/j.bmcl.2009.09.023

  日期：2009.11

  P-glycoprotein (P-gp) is an important factor in the development of multidrug resistance (MDR) in cancer cells. In literature reports, a thieno[ 2,3-d] pyrimidine (QB13) was described as P-gp modulator and opposed effects on the cell accumulation of distinct P-gp substrates were postulated. On the basis of this lead structure, a series of 2-alkylthio-4-aminothieno[2,3-d]pyrimidines was prepared and tested in a daunorubicin accumulation assay. Modulation of substrate specificity was shown for selected compounds in cytotoxicity (MTT) assays. (C) 2009 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Structure-Guided Optimization of Inhibitors of Acetyltransferase Eis from <i>Mycobacterium tuberculosis</i>
  作者：Ankita Punetha、Huy X. Ngo、Selina Y. L. Holbrook、Keith D. Green、Melisa J. Willby、Shilah A. Bonnett、Kyle Krieger、Emily K. Dennis、James E. Posey、Tanya Parish、Oleg V. Tsodikov、Sylvie Garneau-Tsodikova

  DOI：10.1021/acschembio.0c00184

  日期：2020.6.19

  Mycobacterium tuberculosis (Mtb) is a versatile acetyltransferase that multiacetylates aminoglycoside antibiotics abolishing their binding to the bacterial ribosome. When overexpressed as a result of promoter mutations, Eis causes drug resistance. In an attempt to overcome the Eis-mediated kanamycin resistance of Mtb, we designed and optimized structurally unique thieno[2,3-d]pyrimidine Eis inhibitors toward

  结核分枝杆菌（Mtb）的增强的细胞内存活（Eis）蛋白是一种多功能的乙酰转移酶，可对氨基糖苷类抗生素进行多乙酰化，从而消除了与细菌核糖体的结合。当由于启动子突变而过表达时，Eis引起耐药性。为了克服Eis介导的Mtb的卡那霉素耐药性，我们设计并优化了结构独特的硫代[2,3- d ]嘧啶Eis抑制剂，以实现有效的卡那霉素佐剂联合治疗。我们获得了12种酶抑制剂复合物的晶体结构，这指导了我们合理的基于72 thieno [2,3- d]嘧啶类似物分为三个家族。我们评估了这些抑制剂在体外的效力，以及它们在抗性Mtb菌株中恢复卡那霉素活性的能力，其中Eis被上调。此外，我们评估了11种化合物的体外代谢稳定性。这项研究展示了结构信息如何指导Eis抑制剂的设计。