1,6-二氢-5-羟基-6-氧代-2-(苯基甲基)-4-嘧啶羧酸 | 878649-59-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 中文名称: 1,6-二氢-5-羟基-6-氧代-2-(苯基甲基)-4-嘧啶羧酸
• 中文别名: 2-苄基-5,6-二羟基嘧啶-4-羧酸
• 英文名称: 2'-benzyl-5,6-dihydroxypyrimidine-4-carboxylic acid
• 英文别名: 2-Benzyl-5,6-dihydroxy-pyrimidine-4-carboxylic acid；2-benzyl-5-hydroxy-6-oxo-1H-pyrimidine-4-carboxylic acid
• CAS: 878649-59-3
• 化学式: C₁₂H₁₀N₂O₄
• 分子量: 246.222
• InChiKey: KKFDSUVIQPBLJU-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  417.6±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.47±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.08
• 拓扑面积：
  99
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

安全信息

• 海关编码：
  2933599090

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3,4-二氯苄胺 、 1,6-二氢-5-羟基-6-氧代-2-(苯基甲基)-4-嘧啶羧酸 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以61%的产率得到2-benzyl-N-(3,4-dichlorobenzyl)-5-hydroxy-6-oxo-1,6-dihydropyrimidine-4-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  4,5-二羟基嘧啶甲基羧酸盐、羧酸和甲酰胺作为人巨细胞病毒 pUL89 核酸内切酶的抑制剂

  摘要：

  人巨细胞病毒 (HCMV) 末端酶复合物在 pUL89 (pUL89-C) 的 C 末端包含金属依赖性核酸内切酶。我们在此报告了二羟基嘧啶 (DHP) 酸 ( 14 )、甲酯 ( 13 ) 和酰胺 ( 15 ) 亚型作为 HCMV pUL89-C 抑制剂的设计、合成和表征。所有合成的类似物都在核酸内切酶测定和热位移测定 (TSA) 中进行测试，并进行分子对接以预测结合亲和力。尽管从所有三种亚型中鉴定出在亚 μM 范围内抑制 pUL89-C 的类似物，但酸 ( 14 ) 显示出比酯 ( 13 ) 和酰胺 ( 15 ) 更好的整体效力、显着更大的热位移和更好的对接分数). 在基于细胞的抗病毒试验中，六种类似物以中等活性抑制 HCMV (EC 50 = 14.4–22.8 μM)。酸亚型 ( 14 ) 表现出良好的体外ADME 特性，但渗透性较差。总体而言，我们的数据支持 DHP 酸亚型 ( 14

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.2c00203
• 作为产物：
  描述：

  N’-羟基-2-苯基ETHANIMIDAMIDE 在 水 、 lithium hydroxide 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 邻二甲苯 为溶剂， 反应 12.67h， 生成 1,6-二氢-5-羟基-6-氧代-2-(苯基甲基)-4-嘧啶羧酸
  参考文献：
  名称：

  4,5-二羟基嘧啶甲基羧酸盐、羧酸和甲酰胺作为人巨细胞病毒 pUL89 核酸内切酶的抑制剂

  摘要：

  人巨细胞病毒 (HCMV) 末端酶复合物在 pUL89 (pUL89-C) 的 C 末端包含金属依赖性核酸内切酶。我们在此报告了二羟基嘧啶 (DHP) 酸 ( 14 )、甲酯 ( 13 ) 和酰胺 ( 15 ) 亚型作为 HCMV pUL89-C 抑制剂的设计、合成和表征。所有合成的类似物都在核酸内切酶测定和热位移测定 (TSA) 中进行测试，并进行分子对接以预测结合亲和力。尽管从所有三种亚型中鉴定出在亚 μM 范围内抑制 pUL89-C 的类似物，但酸 ( 14 ) 显示出比酯 ( 13 ) 和酰胺 ( 15 ) 更好的整体效力、显着更大的热位移和更好的对接分数). 在基于细胞的抗病毒试验中，六种类似物以中等活性抑制 HCMV (EC 50 = 14.4–22.8 μM)。酸亚型 ( 14 ) 表现出良好的体外ADME 特性，但渗透性较差。总体而言，我们的数据支持 DHP 酸亚型 ( 14

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.2c00203

文献信息

• 2-(2-Thienyl)-5,6-dihydroxy-4-carboxypyrimidines as Inhibitors of the Hepatitis C Virus NS5B Polymerase:  Discovery, SAR, Modeling, and Mutagenesis
  作者：Uwe Koch、Barbara Attenni、Savina Malancona、Stefania Colarusso、Immacolata Conte、Marcello Di Filippo、Steven Harper、Barbara Pacini、Claudia Giomini、Steven Thomas、Ilario Incitti、Licia Tomei、Raffaele De Francesco、Sergio Altamura、Victor G. Matassa、Frank Narjes

  DOI：10.1021/jm051064t

  日期：2006.3.1

  Infections caused by hepatitis C virus (HCV) are a significant world health problem for which novel therapies are in urgent demand. The polymerase of HCV is responsible for the replication of viral RNA. We recently disclosed dihydroxypyrimidine carboxylates 2 as novel, reversible inhibitors of the HCV NS5B polymerase. This series was further developed into 5,6-dihydroxy-2-(2-thienyl)pyrimidine-4-carboxylic acids such as 34 (EC50 9.3 mu M), which now show activity in the cell-based HCV replication assay. The structure-activity relationship of these inhibitors is discussed in the context of their physicochemical properties and of the polymerase crystal structure. We also report the results of mutagenesis experiments which support the proposed binding model, which involves pyrophosphate-like chelation of the active site Mg ions.
• RNase H Active Site Inhibitors of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Reverse Transcriptase: Design, Biochemical Activity, and Structural Information
  作者：Thorsten A. Kirschberg、Mini Balakrishnan、Neil H. Squires、Tiffany Barnes、Katherine M. Brendza、Xiaowu Chen、Eugene J. Eisenberg、Weili Jin、Nilima Kutty、Stephanie Leavitt、Albert Liclican、Qi Liu、Xiaohong Liu、John Mak、Jason K. Perry、Michael Wang、William J. Watkins、Eric B. Lansdon

  DOI：10.1021/jm900597q

  日期：2009.10.8

  Pyrimidinol carboxylic acids were designed as inhibitors of HIV-1 RNase H function. These molecules can coordinate to two divalent metal ions in the RNase H active site. Inhibition of enzymatic activity was measured in a biochemical assay, but no antiviral effect was observed. Binding wits demonstrated via a solid state structure of the isolated p15-Ec domain of HIV-1 RT showing inhibitor and two Mn(II) ions bound to the RNase H active site.
• SMALL MOLECULE COMPOUNDS AS BROAD-SPECTRUM INHIBITORS OF METALLO-BETA-LACTAMASES
  申请人：Song Yongcheng

  公开号：US20120329842A1

  公开（公告）日：2012-12-27

  The present invention concerns methods and/or compositions for treatment and/or prevention of bacterial infection wherein the bacteria has at least one metallo-β-lactamase. The bacteria are provided with an inhibitor of the metallo-β-lactamase, for example in conjunction with an antibiotic that targets the bacteria. The bacteria may be a drug-resistant strain or susceptible to becoming a drug-resistant strain. In specific embodiments, the bacteria is Pseudomonas or Acinetobacter spp.
• [EN] SMALL MOLECULE COMPOUNDS AS BROAD-SPECTRUM INHIBITORS OF METALLO-BETA-LACTAMASES<br/>[FR] COMPOSÉS À PETITES MOLÉCULES COMME INHIBITEURS À LARGE SPECTRE DE MÉTALLO-BÊTA-LACTAMASES
  申请人：BAYLOR COLLEGE MEDICINE

  公开号：WO2012088283A1

  公开（公告）日：2012-06-28

  The present invention concerns methods and/or compositions for treatment and/or prevention of bacterial infection wherein the bacteria has at least one metallo-P-lactamase. The bacteria are provided with an inhibitor of the metallo-P-lactamase, for example in conjunction with an antibiotic that targets the bacteria. The bacteria may be a drug-resistant strain or susceptible to becoming a drug-resistant strain. In specific embodiments, the bacteria is Pseudomonas or Acinetobacter spp.