methyl 5-amino-4-[2-(benzylamino)ethyl]-1-[(dimethylamino)sulfonyl]-2-(methylamino)-1H-benzimidazole-6-carboxylate | 1199810-66-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: methyl 5-amino-4-[2-(benzylamino)ethyl]-1-[(dimethylamino)sulfonyl]-2-(methylamino)-1H-benzimidazole-6-carboxylate
• CAS: 1199810-66-6
• 化学式: C₂₁H₂₈N₆O₄S
• 分子量: 460.557
• InChiKey: ZIGDMZBBQFLALR-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.43
• 重原子数：
  32.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  131.58
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  聚合甲醛 、 methyl 5-amino-4-[2-(benzylamino)ethyl]-1-[(dimethylamino)sulfonyl]-2-(methylamino)-1H-benzimidazole-6-carboxylate 在 甲酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 methyl 8-benzyl-3-[(dimethylamino)sulfonyl]-2-(methylamino)-3,6,7,8,9,10-hexahydroimidazo[4,5-g][1,3]benzodiazepine-5-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  高亲和力的tRNA鸟嘌呤转糖基酶替代结构水簇的功能。

  摘要：

  tRNA修饰酶tRNA-鸟嘌呤转糖基酶（TGT）对于弗氏志贺氏菌（细菌性腹泻性志贺菌病的病原体）的致病机制至关重要。在这里，合成了一类新的合理设计的6-氨基咪唑并[4,5 - g ]喹唑啉-8（7 H）-one-（lin报道了基于TGT的苯并鸟嘌呤抑制剂。为了在核糖34的结合位点附近容纳一个小的疏水缝隙开口，在杂环支架的4位引入了2-氨基乙基取代基。为此，使用了由碘化，铃木交叉偶联，硼氢化，Mitsunobu反应和Gabriel合成组成的合成序列，提供了伯胺，该伯胺用作制备一系列衍生物的常用中间体。所得配体显示出非常低的抑制常数，低至K i = 2 n M。通过在位置4的取代基上连接的末端亲脂性基团与由Val45和Leu68形成的疏水缝隙的相互作用，可以显着提高抑制活性。同时，取代基中的仲铵中心取代了水分子簇，使催化残基Asp102和Asp280溶剂化，而不会降低结合亲和力。此外，据报道，合成中间体具有不寻常的3

  DOI：

  10.1002/chem.200901270
• 作为产物：
  描述：

  methyl 5-amino-4-(2-aminoethyl)-1-[(dimethylamino)sulfonyl]-2-(methylamino)-1H-benzimidazole-6-carboxylate 、 苯甲醛 在 三乙酰氧基硼氢化钠 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以71%的产率得到methyl 5-amino-4-[2-(benzylamino)ethyl]-1-[(dimethylamino)sulfonyl]-2-(methylamino)-1H-benzimidazole-6-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  高亲和力的tRNA鸟嘌呤转糖基酶替代结构水簇的功能。

  摘要：

  tRNA修饰酶tRNA-鸟嘌呤转糖基酶（TGT）对于弗氏志贺氏菌（细菌性腹泻性志贺菌病的病原体）的致病机制至关重要。在这里，合成了一类新的合理设计的6-氨基咪唑并[4,5 - g ]喹唑啉-8（7 H）-one-（lin报道了基于TGT的苯并鸟嘌呤抑制剂。为了在核糖34的结合位点附近容纳一个小的疏水缝隙开口，在杂环支架的4位引入了2-氨基乙基取代基。为此，使用了由碘化，铃木交叉偶联，硼氢化，Mitsunobu反应和Gabriel合成组成的合成序列，提供了伯胺，该伯胺用作制备一系列衍生物的常用中间体。所得配体显示出非常低的抑制常数，低至K i = 2 n M。通过在位置4的取代基上连接的末端亲脂性基团与由Val45和Leu68形成的疏水缝隙的相互作用，可以显着提高抑制活性。同时，取代基中的仲铵中心取代了水分子簇，使催化残基Asp102和Asp280溶剂化，而不会降低结合亲和力。此外，据报道，合成中间体具有不寻常的3

  DOI：

  10.1002/chem.200901270