Acetic acid (2S,3R,4S,5R,6R)-4,5-diacetoxy-6-acetoxymethyl-2-(diphenoxy-phosphoryloxy)-tetrahydro-pyran-3-yl ester | 58497-11-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Acetic acid (2S,3R,4S,5R,6R)-4,5-diacetoxy-6-acetoxymethyl-2-(diphenoxy-phosphoryloxy)-tetrahydro-pyran-3-yl ester
• 英文别名: [(2R,3R,4S,5R,6S)-3,4,5-triacetyloxy-6-diphenoxyphosphoryloxyoxan-2-yl]methyl acetate
• CAS: 58497-11-3
• 化学式: C₂₆H₂₉O₁₃P
• 分子量: 580.482
• InChiKey: UJHJFKMUODVUQI-RTJMFUJLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.35
• 重原子数：
  40.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  159.19
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Acetic acid (2S,3R,4S,5R,6R)-4,5-diacetoxy-6-acetoxymethyl-2-(diphenoxy-phosphoryloxy)-tetrahydro-pyran-3-yl ester 在 platinum(IV) oxide 、 氢气 作用下， 生成 2,3,4,6-tetra-O-acetyl-β-D-glucopyranosyl phosphate
  参考文献：
  名称：

  Structure and mechanism of the ER-based glucosyltransferase ALG6

  摘要：

  在真核蛋白 N-糖基化中，一系列糖基转移酶在转移到受体蛋白上之前催化多乙醇焦磷酸连接的寡糖的生物合成。最后七个步骤发生在内质网 (ER) 的腔中，需要多乙醇磷酸酯激活的甘露糖和葡萄糖作为供体底物2。负责的酶——ALG3、ALG9、ALG12、ALG6、ALG8 和 ALG10——是 C 超家族 (GT-Cs) 的糖基转移酶，其被粗略地定义为含有跨膜螺旋并处理类异戊二烯连接的碳水化合物供体底物3 ,4.在这里，我们展示了酵母 ALG6 分辨率为 3.0 × 的冷冻电子显微镜结构，揭示了以前未描述的跨膜蛋白折叠。与已报道的 GT-C 结构进行比较表明，GT-C 酶包含具有保守模块和可变模块的模块化结构，每个模块都具有不同的功能作用。我们使用长效磷酸酯连接糖和长效醇焦磷酸酯连接糖的合成类似物以及酶促聚糖延伸来生成供体和受体底物，并使用 ALG 途径的纯化酶在体外重现 ALG6 的活性。 ALG6 与多醇磷酸-葡萄糖类似物结合的第二个冷冻电子显微镜结构以 3.9 × 分辨率显示了该酶的活性位点。 ALG6 变体的功能分析鉴定出可能充当通用碱基的催化天冬氨酸残基。该残基在 GT-C 超家族中是保守的。我们的结果定义了 ER-luminal GT-C 酶的结构，并为理解其催化机制提供了结构基础。分析揭示了基于内质网的葡萄糖基转移酶 ALG6 中先前未描述的跨膜蛋白折叠，并为理解葡萄糖转移机制提供了结构基础。

  DOI：

  10.1038/s41586-020-2044-z
• 作为产物：
  描述：

  2,3,4,5-tetra-O-acetyl-D-glucopyranose 、 氯磷酸二苯酯 在 4-二甲氨基吡啶 作用下， 生成 Acetic acid (2S,3R,4S,5R,6R)-4,5-diacetoxy-6-acetoxymethyl-2-(diphenoxy-phosphoryloxy)-tetrahydro-pyran-3-yl ester
  参考文献：
  名称：

  Structure and mechanism of the ER-based glucosyltransferase ALG6

  摘要：

  在真核蛋白 N-糖基化中，一系列糖基转移酶在转移到受体蛋白上之前催化多乙醇焦磷酸连接的寡糖的生物合成。最后七个步骤发生在内质网 (ER) 的腔中，需要多乙醇磷酸酯激活的甘露糖和葡萄糖作为供体底物2。负责的酶——ALG3、ALG9、ALG12、ALG6、ALG8 和 ALG10——是 C 超家族 (GT-Cs) 的糖基转移酶，其被粗略地定义为含有跨膜螺旋并处理类异戊二烯连接的碳水化合物供体底物3 ,4.在这里，我们展示了酵母 ALG6 分辨率为 3.0 × 的冷冻电子显微镜结构，揭示了以前未描述的跨膜蛋白折叠。与已报道的 GT-C 结构进行比较表明，GT-C 酶包含具有保守模块和可变模块的模块化结构，每个模块都具有不同的功能作用。我们使用长效磷酸酯连接糖和长效醇焦磷酸酯连接糖的合成类似物以及酶促聚糖延伸来生成供体和受体底物，并使用 ALG 途径的纯化酶在体外重现 ALG6 的活性。 ALG6 与多醇磷酸-葡萄糖类似物结合的第二个冷冻电子显微镜结构以 3.9 × 分辨率显示了该酶的活性位点。 ALG6 变体的功能分析鉴定出可能充当通用碱基的催化天冬氨酸残基。该残基在 GT-C 超家族中是保守的。我们的结果定义了 ER-luminal GT-C 酶的结构，并为理解其催化机制提供了结构基础。分析揭示了基于内质网的葡萄糖基转移酶 ALG6 中先前未描述的跨膜蛋白折叠，并为理解葡萄糖转移机制提供了结构基础。

  DOI：

  10.1038/s41586-020-2044-z

文献信息

• Synthesis of glycosyl phosphates and azides
  作者：Subramaniam Sabesan、Susana Neira

  DOI：10.1016/0008-6215(92)80015-s

  日期：1992.1

  -rhamnose and d -mannose. These phosphate triesters have been deprotected to glycosyl phosphate triethylammonium salts, suitable for the preparation of other key biological derivatives, such as nucleotide sugars. In addition, the diphenyl phosphate groups at the anomeric center have been displaced by azide to give the glycosyl azides, key intermediates in the synthesis of glycosyl amino acids.

  摘要利用氯代磷酸二苯酯和4-N，N-二甲基氨基吡啶，由邻烷基和酰基化的六吡喃糖制备了富含阴离子的二苯基六吡喃糖基磷酸三酯。通过该方法获得了d-葡萄糖-，d-半乳糖，d-甘露糖，2-乙酰氨基-2-脱氧-d-葡萄糖-，1-fuco-和1-rhamno-吡喃糖基衍生物的糖基磷酸三酯。在0℃以上的温度下，在热力学控制下，主要形成顺式为吡喃糖基C-2-取代基的二苯基糖基磷酸酯，而在低温和动力学控制下，获得具有1,2-反式立体化学的糖基磷酸酯三酯。d-葡萄糖和d-半乳糖衍生物的β-糖基磷酸三酯不稳定，并且会发生异构化为α-糖基磷酸三酯，与1-鼠李糖和d-甘露糖的稳定的β-磷酸酯衍生物相反。这些磷酸三酯已脱保护成糖基磷酸三乙铵盐，适用于制备其他关键的生物衍生物，如核苷酸糖。另外，在异头异构体中心的磷酸二苯酯基团已经被叠氮化物置换，以得到糖基叠氮化物，糖基叠氮化物是糖基氨基酸合成中的关键中间体。