methyl (2R)-2-{[(2S)-2-benzyl-4-[(4-methyl-1H-imidazol-5-yl)methyl]-3-oxopiperazine-1-carbonyl]amino}-4-methylpentanoate | 501010-09-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl (2R)-2-{[(2S)-2-benzyl-4-[(4-methyl-1H-imidazol-5-yl)methyl]-3-oxopiperazine-1-carbonyl]amino}-4-methylpentanoate
• 英文别名: methyl (2R)-2-[[(2S)-2-benzyl-4-[(5-methyl-1H-imidazol-4-yl)methyl]-3-oxopiperazine-1-carbonyl]amino]-4-methylpentanoate
• CAS: 501010-09-9
• 化学式: C₂₄H₃₃N₅O₄
• 分子量: 455.557
• InChiKey: DWKYALWDWAYMTB-CTNGQTDRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.27
• 重原子数：
  33.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  107.63
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (2R)-2-{[(2S)-2-benzyl-4-[(4-methyl-1H-imidazol-5-yl)methyl]-3-oxopiperazine-1-carbonyl]amino}-4-methylpentanoate 在 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 1.0h， 以85%的产率得到(2R)-2-[[(2S)-2-benzyl-4-[(5-methyl-1H-imidazol-4-yl)methyl]-3-oxopiperazine-1-carbonyl]amino]-4-methylpentanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and evaluation of potent, highly-selective, 3-aryl-piperazinone inhibitors of protein geranylgeranyltransferase-I

  摘要：

  基于PGGTase-I底物的羧端CAAL序列，设计并合成了一系列化合物。我们利用哌嗪-2-酮作为半刚性骨架，在明确有序的排列中引入了关键的药效团，以模拟CAAL序列。对于抑制PGGTase-I，如45和70结构所展现，其活性高且选择性极佳。这一系列GGTIs的活性依赖于具有自由羧端的L-亮氨酸残基以及3-芳基的S构型。通过咪唑环上的5-甲基取代和3-芳基上的氟取代，其选择性显著提升。发现对哌嗪酮骨架的6位进行修饰是不利的。化合物44和69，即45和70的相应甲酯，分别以0.4 µM和0.7 µM的IC50值选择性地阻断PGGTase-I对Rap1A的细胞内加工。

  DOI：

  10.1039/b517572k
• 作为产物：
  描述：

  benzyl (2S)-2-benzyl-4-[(5-methyl-1-tritylimidazol-4-yl)methyl]-3-oxo-2H-pyrazine-1-carboxylate 在 palladium on activated charcoal 三乙基硅烷 、 氢气 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 methyl (2R)-2-{[(2S)-2-benzyl-4-[(4-methyl-1H-imidazol-5-yl)methyl]-3-oxopiperazine-1-carbonyl]amino}-4-methylpentanoate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and evaluation of potent, highly-selective, 3-aryl-piperazinone inhibitors of protein geranylgeranyltransferase-I

  摘要：

  基于PGGTase-I底物的羧端CAAL序列，设计并合成了一系列化合物。我们利用哌嗪-2-酮作为半刚性骨架，在明确有序的排列中引入了关键的药效团，以模拟CAAL序列。对于抑制PGGTase-I，如45和70结构所展现，其活性高且选择性极佳。这一系列GGTIs的活性依赖于具有自由羧端的L-亮氨酸残基以及3-芳基的S构型。通过咪唑环上的5-甲基取代和3-芳基上的氟取代，其选择性显著提升。发现对哌嗪酮骨架的6位进行修饰是不利的。化合物44和69，即45和70的相应甲酯，分别以0.4 µM和0.7 µM的IC50值选择性地阻断PGGTase-I对Rap1A的细胞内加工。

  DOI：

  10.1039/b517572k