1-((2R,3R,4R,5R)-5-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)-4-hydroxy-3-((S)-2-methoxypropoxy)tetrahydrofuran-2-yl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione | 1244969-84-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-((2R,3R,4R,5R)-5-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)-4-hydroxy-3-((S)-2-methoxypropoxy)tetrahydrofuran-2-yl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• CAS: 1244969-84-3
• 化学式: C₃₀H₄₀N₂O₇Si
• 分子量: 568.742
• InChiKey: XAVBJGXCDMOGJY-DSDPVUMISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.1
• 重原子数：
  40.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  112.01
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-((2R,3R,4R,5R)-5-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)-4-hydroxy-3-((S)-2-methoxypropoxy)tetrahydrofuran-2-yl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 在 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 45.0h， 生成 1-((2R,3R,4R,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-3-((S)-2-methoxypropoxy)tetrahydrofuran-2-yl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  2'-O-（2S-甲氧基丙基）-RNA修饰的Gapmer反义寡核苷酸的合成与反义性质

  摘要：

  以确定是否增加疏水性可增强的肌肉中的第二代反义寡核苷酸（艾滋病服务）的活性，我们研究了2'-的反义性质ø - （2-小号甲氧基丙基）-RNA（2小号-MOP）改性的ASO。的2的合成小号-MOP 5-甲基尿苷亚磷酰胺是由5'-路易斯酸催化的开环，可以为多克规模实现ø -叔-butyldiphenylsilyl醚保护的2,2'-脱水-5-甲基尿苷与2 S-甲氧基-1-丙醇 2 S的合成相应的5-甲基尿苷核苷产生的-MOP 5-甲基胞苷核苷是通过用氨水形成并置换4-三唑啉中间体而完成的。在自动DNA合成仪上制备了2个S -MOP修饰的寡核苷酸，与2'- O-甲氧基乙基RNA（MOE）修饰的寡核苷酸相比，在双链热稳定性方面表现出相似的增强。在Balb-c小鼠中评估了2个含S -MOP的反义寡核苷酸，它们在降低肝脏和肌肉组织中的清道夫受体B1（Srb1）以及磷酸酶和张力蛋白同源物（PTEN）mRNA的表达水平方面表现出良好的活性。

  DOI：

  10.1002/cmdc.201402099
• 作为产物：
  描述：

  2-甲氧基丙醇 、 5'-O-tert-butyldiphenylsilyl-O²-2'-anhydro-5-methyluridine 在 三甲基铝 作用下， 以 正庚烷 、 甲苯 为溶剂， 反应 0.5h， 以42%的产率得到1-((2R,3R,4R,5R)-5-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)-4-hydroxy-3-((S)-2-methoxypropoxy)tetrahydrofuran-2-yl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  2'-O-（2S-甲氧基丙基）-RNA修饰的Gapmer反义寡核苷酸的合成与反义性质

  摘要：

  以确定是否增加疏水性可增强的肌肉中的第二代反义寡核苷酸（艾滋病服务）的活性，我们研究了2'-的反义性质ø - （2-小号甲氧基丙基）-RNA（2小号-MOP）改性的ASO。的2的合成小号-MOP 5-甲基尿苷亚磷酰胺是由5'-路易斯酸催化的开环，可以为多克规模实现ø -叔-butyldiphenylsilyl醚保护的2,2'-脱水-5-甲基尿苷与2 S-甲氧基-1-丙醇 2 S的合成相应的5-甲基尿苷核苷产生的-MOP 5-甲基胞苷核苷是通过用氨水形成并置换4-三唑啉中间体而完成的。在自动DNA合成仪上制备了2个S -MOP修饰的寡核苷酸，与2'- O-甲氧基乙基RNA（MOE）修饰的寡核苷酸相比，在双链热稳定性方面表现出相似的增强。在Balb-c小鼠中评估了2个含S -MOP的反义寡核苷酸，它们在降低肝脏和肌肉组织中的清道夫受体B1（Srb1）以及磷酸酶和张力蛋白同源物（PTEN）mRNA的表达水平方面表现出良好的活性。

  DOI：

  10.1002/cmdc.201402099

文献信息

• [EN] NUCLEIC ACID CHEMICAL MODIFICATIONS<br/>[FR] MODIFICATIONS CHIMIQUES D'ACIDE NUCLÉIQUE
  申请人：ALNYLAM PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2010101951A1

  公开（公告）日：2010-09-10

  he present invention provides nucleosides of formula (1) and oligonucleotides comprising at least on nucleoside of formula (2): Another aspect of the invention relates to a method of inhibiting the expression of a gene in cell, the method comprising (a) contacting an oligonucleotide of the invention with the cell; and (b) maintaining the cell from step (a) for a time sufficient to obtain degradation of the mRNA of the target gene.

  本发明提供了式（1）的核苷和包含至少一种式（2）核苷的寡核苷酸；发明的另一个方面涉及一种抑制细胞中基因表达的方法，该方法包括（a）将本发明的寡核苷酸与细胞接触；和（b）维持步骤（a）中的细胞足够长的时间以获得目标基因mRNA的降解。