Helix-Forming Propensity of Aliphatic Urea Oligomers Incorporating Noncanonical Residue Substitution Patterns
作者:Nagendar Pendem、Céline Douat、Paul Claudon、Michel Laguerre、Sabine Castano、Bernard Desbat、Dominique Cavagnat、Eric Ennifar、Brice Kauffmann、Gilles Guichard
DOI:10.1021/ja401151v
日期:2013.3.27
the helix geometry is compatible with alternative substitution patterns. The central -NH-CH(R)-CH2-NH-CO- residue in a model oligourea pentamer sequence was replaced by guest units bearing various substitution patterns [e.g., -NH-CH2-CH2-NH-CO-, -NH-CH2-CH(R)-NH-CO-, and -NH-CH(R(1))-CH(R(2))-NH-CO-], levels of preorganization (cyclic vs acyclic residues), and stereochemistries, and the helix formation
脂肪族 N,N' 连接的低聚脲是拟肽折叠体,采用定义明确的螺旋二级结构,由一组关闭 12 和 14 元假环的远程三中心 H 键稳定。如果旨在利用这种螺旋折叠将侧链放置在给定的排列中并精心设计功能螺旋,那么根据组成单元的性质描绘控制螺旋形成的规则具有实际效用。在这项工作中,我们测试了螺旋几何形状是否与替代替代模式兼容。模型低聚脲五聚体序列中的中心 -NH-CH(R)-CH2-NH-CO- 残基被带有各种取代模式的客体单元取代 [例如,-NH-CH2-CH2-NH-CO-、-NH- CH2-CH(R)-NH-CO-和-NH-CH(R(1))-CH(R(2))-NH-CO-],预组织水平(环状与非环状残基),和立体化学,并且系统地评估了螺旋形成。螺旋扰动或稳定的程度主要通过傅立叶变换红外、核磁共振和电子圆二色光谱在溶液中监测。我们的结果表明,虽然在 2.5 螺旋中容纳了三种新的取代模式,但短寡聚