benzyl ((S)-1-(((S)-1-(((S)-3-(1H-imidazol-4-yl)-1-oxo-1-(thiazol-2-yl)propan-2-yl)amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl)amino)-3-methyl-1-oxobutan-2-yl)carbamate | 1417704-40-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: benzyl ((S)-1-(((S)-1-(((S)-3-(1H-imidazol-4-yl)-1-oxo-1-(thiazol-2-yl)propan-2-yl)amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl)amino)-3-methyl-1-oxobutan-2-yl)carbamate
• 英文别名: Cbz-Val-Leu-His-thiazol-2-yl；benzyl N-[(2S)-1-[[(2S)-1-[[(2S)-3-(1H-imidazol-5-yl)-1-oxo-1-(1,3-thiazol-2-yl)propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]carbamate
• CAS: 1417704-40-5
• 化学式: C₂₈H₃₆N₆O₅S
• 分子量: 568.697
• InChiKey: YNZXZEUJVZVXSR-VABKMULXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.2
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  183
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  、 Z-Val-Leu-OH 在 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 benzyl ((S)-1-(((S)-1-(((S)-3-(1H-imidazol-4-yl)-1-oxo-1-(thiazol-2-yl)propan-2-yl)amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl)amino)-3-methyl-1-oxobutan-2-yl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  含有亲电子芳基酮部分的新型三肽型 SARS-CoV 3CL 蛋白酶抑制剂的设计与合成

  摘要：

  我们在此描述了一系列分子的设计、合成和生物学评估，以开发新型 SARS-CoV 3CL pro的拟肽抑制剂。一项涉及初始先导化合物1与 SARS-CoV 3CL pro之间结合的对接研究促使用苯并噻唑单元取代噻唑作为 P1' 位点的弹头部分。这种修饰导致鉴定出更有效的衍生物，包括2i、2k、2m、2o和2p，其 IC 50或K i值在亚微摩尔至纳摩尔范围内。特别是，化合物2i和2p表现出最有效的抑制活性，K i值分别为 4.1 和 3.1 nM。通过这一过程鉴定出的拟肽化合物对于开发针对 SARS 的潜在治疗剂来说是有吸引力的线索。对SARS-CoV 3CL pro具有强效抑制活性的拟肽的结构要求可概括如下：（i）S1'位存在苯并噻唑弹头；(ii) S1位点环状内酰胺的氢键结合能力；(iii) S2 位点的适当立体化学和疏水部分大小，以及 (iv) S4 位点的苯氧基乙酰基部分呈现的独特折叠构象。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2012.11.017

文献信息

• Design and synthesis of new tripeptide-type SARS-CoV 3CL protease inhibitors containing an electrophilic arylketone moiety
  作者：Sho Konno、Pillaiyar Thanigaimalai、Takehito Yamamoto、Kiyohiko Nakada、Rie Kakiuchi、Kentaro Takayama、Yuri Yamazaki、Fumika Yakushiji、Kenichi Akaji、Yoshiaki Kiso、Yuko Kawasaki、Shen-En Chen、Ernesto Freire、Yoshio Hayashi

  DOI：10.1016/j.bmc.2012.11.017

  日期：2013.1

  We describe here the design, synthesis and biological evaluation of a series of molecules toward the development of novel peptidomimetic inhibitors of SARS-CoV 3CLpro. A docking study involving binding between the initial lead compound 1 and the SARS-CoV 3CLpro motivated the replacement of a thiazole with a benzothiazole unit as a warhead moiety at the P1′ site. This modification led to the identification

  我们在此描述了一系列分子的设计、合成和生物学评估，以开发新型 SARS-CoV 3CL pro的拟肽抑制剂。一项涉及初始先导化合物1与 SARS-CoV 3CL pro之间结合的对接研究促使用苯并噻唑单元取代噻唑作为 P1' 位点的弹头部分。这种修饰导致鉴定出更有效的衍生物，包括2i、2k、2m、2o和2p，其 IC 50或K i值在亚微摩尔至纳摩尔范围内。特别是，化合物2i和2p表现出最有效的抑制活性，K i值分别为 4.1 和 3.1 nM。通过这一过程鉴定出的拟肽化合物对于开发针对 SARS 的潜在治疗剂来说是有吸引力的线索。对SARS-CoV 3CL pro具有强效抑制活性的拟肽的结构要求可概括如下：（i）S1'位存在苯并噻唑弹头；(ii) S1位点环状内酰胺的氢键结合能力；(iii) S2 位点的适当立体化学和疏水部分大小，以及 (iv) S4 位点的苯氧基乙酰基部分呈现的独特折叠构象。