2-[5-[1-[6-[2-[[4-[[2-[3-[2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]ethylcarbamoyl]-5-[2-[2-(2-sulfanylethoxy)ethoxy]ethylcarbamoyl]anilino]-2-oxoethoxy]iminomethyl]benzoyl]amino]ethylamino]-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-2-yl]penta-2,4-dienylidene]-1-ethyl-3,3-dimethylindole-5-sulfonate | 1429637-01-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物
• 英文名称: 2-[5-[1-[6-[2-[[4-[[2-[3-[2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]ethylcarbamoyl]-5-[2-[2-(2-sulfanylethoxy)ethoxy]ethylcarbamoyl]anilino]-2-oxoethoxy]iminomethyl]benzoyl]amino]ethylamino]-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-2-yl]penta-2,4-dienylidene]-1-ethyl-3,3-dimethylindole-5-sulfonate
• CAS: 1429637-01-3
• 化学式: C₆₅H₈₃N₁₁O₁₆S₃
• 分子量: 1370.64
• InChiKey: BXEIWQQNHCIRFU-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.4
• 重原子数：
  95
• 可旋转键数：
  39
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  354
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  21

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-ethyl-2-[3-[1-[6-[2-[[4-[(2-iodoacetyl)amino]benzoyl]amino]ethylamino]-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-2-yl]prop-2-enylidene]-3,3-dimethylindole-5-sulfonate 、 2-[5-[1-[6-[2-[[4-[[2-[3-[2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]ethylcarbamoyl]-5-[2-[2-(2-sulfanylethoxy)ethoxy]ethylcarbamoyl]anilino]-2-oxoethoxy]iminomethyl]benzoyl]amino]ethylamino]-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-2-yl]penta-2,4-dienylidene]-1-ethyl-3,3-dimethylindole-5-sulfonate 以 乙腈 为溶剂， 反应 3.0h， 以36%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  首个“即用型”苯基异三官能交联剂，可进行多种生物偶联作用†

  摘要：

  描述了带有一组三个不同且正交的生物可共轭基团（氨氧基，叠氮基和硫醇）的第一水溶性苯衍生物的合成和应用。5-氨基间苯二甲酸支架和不寻常的对酸不稳定的保护基团的组合使用，以暂时掩盖氨氧基和硫醇部分，已为开发高收率的方法合成高价的这种三价生物共轭平台提供了可能。通过（1）快速制备具有有价值的光谱特性的三色FRET级联反应，可以说明这种“即用型”交联剂在创建复杂且易碎的三组分（生物）分子系统中的潜在实用性。 （2）肽和肽-寡核苷酸结合物的发光/荧光标记。因此，通过三个步骤过程中或在“一锅”方式，既涉及肟结扎，巯基烷基化（S Ñ 2或迈克尔加成）和铜-催化的叠氮化物-炔烃的1,3-偶极环加成加成（CuAAC）反应。

  DOI：

  10.1039/c3ob40086g
• 作为产物：
  描述：

  C₄₃H₅₀N₄O₉S₂ 、 5-(2-(aminooxy)acetamido)-N1-(2-(2-(2-azidoethoxy)ethoxy)ethyl)-N3-(2-(2-(2-mercaptoethoxy)ethoxy)ethyl)isophthalamide 2,2,2-trifluoroacetate 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 4.0h， 以32%的产率得到2-[5-[1-[6-[2-[[4-[[2-[3-[2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]ethylcarbamoyl]-5-[2-[2-(2-sulfanylethoxy)ethoxy]ethylcarbamoyl]anilino]-2-oxoethoxy]iminomethyl]benzoyl]amino]ethylamino]-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-2-yl]penta-2,4-dienylidene]-1-ethyl-3,3-dimethylindole-5-sulfonate
  参考文献：
  名称：

  首个“即用型”苯基异三官能交联剂，可进行多种生物偶联作用†

  摘要：

  描述了带有一组三个不同且正交的生物可共轭基团（氨氧基，叠氮基和硫醇）的第一水溶性苯衍生物的合成和应用。5-氨基间苯二甲酸支架和不寻常的对酸不稳定的保护基团的组合使用，以暂时掩盖氨氧基和硫醇部分，已为开发高收率的方法合成高价的这种三价生物共轭平台提供了可能。通过（1）快速制备具有有价值的光谱特性的三色FRET级联反应，可以说明这种“即用型”交联剂在创建复杂且易碎的三组分（生物）分子系统中的潜在实用性。 （2）肽和肽-寡核苷酸结合物的发光/荧光标记。因此，通过三个步骤过程中或在“一锅”方式，既涉及肟结扎，巯基烷基化（S Ñ 2或迈克尔加成）和铜-催化的叠氮化物-炔烃的1,3-偶极环加成加成（CuAAC）反应。

  DOI：

  10.1039/c3ob40086g