(R)-2,4-dihydroxy-N-3,3-trimethylbutanamide | 88308-84-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: (R)-2,4-dihydroxy-N-3,3-trimethylbutanamide
• 英文别名: 2,4-dihydroxy-3,3,N-trimethylbutyramide；(2R)-2,4-Dihydroxy-N,3,3-trimethylbutanamide
• CAS: 88308-84-3
• 化学式: C₇H₁₅NO₃
• 分子量: 161.201
• InChiKey: SZRVHGPZNGVMDQ-YFKPBYRVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.6
• 重原子数：
  11
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.86
• 拓扑面积：
  69.6
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (R)-2,4-dihydroxy-N-3,3-trimethylbutanamide 、 4-(((5aS,6S,8S,8aS)-8-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2,2,4,4-tetraisopropyltetrahydrofuro[3,4-f][1,3,5,2,4]trioxadisilepin-6-yl)methoxy)-4-oxobutanoic acid 在 4-二甲氨基吡啶 、 氟化铵 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 21.67h， 生成 ((2S,3R,4S,5S)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl ((R)-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4-(methylamino)-4-oxobutyl) succinate
  参考文献：
  名称：

  辅酶A类似物作为Aurora激酶A抑制剂的设计和合成：焦磷酸盐和泛神碱部分的作用探讨

  摘要：

  辅酶A（CoA）是有丝分裂调节酶Aurora A激酶的高度选择性抑制剂，具有新颖的作用方式。在本文中，我们报道了作为Aurora A激酶抑制剂的CoA类似物的设计和合成。我们已经设计并合成了修饰的CoA结构作为潜在的抑制剂，将焦磷酸酯基团的二羰基模拟物与保守的腺苷头基和不同长度的基于泛神碱的尾基结合起来。泛酸尾部末端带有-SH基团的类似物显示出最佳的IC50，这可能是由于与Aurora A激酶Cys290共价键形成所致。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2020.115740
• 作为产物：
  描述：

  甲胺 、 D-(-)-泛酰内酯 以 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 3.0h， 以100%的产率得到(R)-2,4-dihydroxy-N-3,3-trimethylbutanamide
  参考文献：
  名称：

  片段连接中配体间奥豪泽效应的优化：在结核分枝杆菌泛酸合成酶抑制剂发现中的应用

  摘要：

  基于片段的方法是一种新兴的方法，用于发现作为潜在新治疗剂的蛋白质结合剂。迄今为止，已经探索了几种利用结构信息来指导抑制剂组装的方法。其中一种方法，即配体间 Overhauser 效应 (ILOE) 观察的应用特别令人感兴趣，因为它不需要 3D 蛋白质结构的可用性，并且是一种基于 NMR 的方法，可应用于无法检测到的目标。直接观察，因为它们的大小。片段作为小分子且通常是疏水性分子，存在一些问题，包括水环境中的化合物聚集和非特异性结合贡献，尤其是在适合 ILOE 观察的较高浓度筛选时。在这里，我们报告了如何通过应用逐步迭代程序来克服这个问题，该程序包括应用具有已知结合模式的优化探针分子来阐明片段的未知结合模式。以具有良好结合特征的酶底物为起点，使用来自 ILOE 观察的修饰片段的相对结合模式来指导片段连接，从而产生我们模型系统的有效抑制剂，结核分枝杆菌泛酸合成酶，潜在的药物靶点。我们用晶体结构支持我们的

  DOI：

  10.1021/ja100595u

文献信息

• Synthesis and Properties of New 4-Oxo-4,5-dihydro-1,3-oxazolium Perchlorates
  作者：D. Yu. Lukina、V. D. Strelkov、L. V. Dyadyuchenko、E. A. Chigorina、V. V. Dotsenko、T. P. Kosulina

  DOI：10.1134/s1070363218120083

  日期：2018.12

  D-Pantoic acid amide obtained by treatment of D-(–)-pantolactone with ammonia reacted with acetic anhydride in the presence of perchloric acid to give 5-[2-(acetoxy)-1,1-dimethylethyl]-2-methyl-4-oxo- 4,5-dihydro-1,3-oxazolium perchlorate. Reaction of the latter with aromatic aldehydes afforded 2-(2- arylethenyl)-4-oxo-4,5-dihydro-1,3-oxazolium perchlorates which showed no appreciable growth-regulating

  在高氯酸存在下，用氨处理D-（-）-泛内酯与乙酸酐反应制得的D-泛酸酰胺，生成5- [2-（乙酰氧基）-1,1-二甲基乙基] -2-甲基- 4-氯-4,5-二氢-1,3-恶唑鎓高氯酸盐。后者与芳族醛的反应提供了2-（2-芳基乙烯基）-4-氧代-4,5-二氢-1,3-恶唑鎓高氯酸盐，其没有显示出明显的生长调节活性，但是清楚地显示了对2,4-的解毒活性。二氯苯氧基乙酸（2,4-D除草剂）。
• Optimization of the Interligand Overhauser Effect for Fragment Linking: Application to Inhibitor Discovery against <i>Mycobacterium tuberculosis</i> Pantothenate Synthetase
  作者：Pawel Sledz、H. Leonardo Silvestre、Alvin W. Hung、Alessio Ciulli、Tom L. Blundell、Chris Abell

  DOI：10.1021/ja100595u

  日期：2010.4.7

  to elucidate the unknown binding modes of fragments. An enzyme substrate with well-characterized binding was used as a starting point, and the relative binding modes of modified fragments derived from ILOE observations were used to guide the fragment linking, leading to a potent inhibitor of our model system, Mycobacterium tuberculosis pantothenate synthetase, a potential drug target. We have supported

  基于片段的方法是一种新兴的方法，用于发现作为潜在新治疗剂的蛋白质结合剂。迄今为止，已经探索了几种利用结构信息来指导抑制剂组装的方法。其中一种方法，即配体间 Overhauser 效应 (ILOE) 观察的应用特别令人感兴趣，因为它不需要 3D 蛋白质结构的可用性，并且是一种基于 NMR 的方法，可应用于无法检测到的目标。直接观察，因为它们的大小。片段作为小分子且通常是疏水性分子，存在一些问题，包括水环境中的化合物聚集和非特异性结合贡献，尤其是在适合 ILOE 观察的较高浓度筛选时。在这里，我们报告了如何通过应用逐步迭代程序来克服这个问题，该程序包括应用具有已知结合模式的优化探针分子来阐明片段的未知结合模式。以具有良好结合特征的酶底物为起点，使用来自 ILOE 观察的修饰片段的相对结合模式来指导片段连接，从而产生我们模型系统的有效抑制剂，结核分枝杆菌泛酸合成酶，潜在的药物靶点。我们用晶体结构支持我们的
• Metabolic delivery of coenzyme A analogs
  申请人：Burkart D. Michael

  公开号：US20070128683A1

  公开（公告）日：2007-06-07

  Methods to generate analogs of coenzyme A in vitro and in vivo are disclosed. The methods comprise reacting pantetheine or a derivative thereof with a reporter to form labeled pantetheine or a derivative thereof, phosphorylating the labeled pantetheine or derivative thereof to form phosphopantetheine or a derivative thereof, adenylating the labeled phosphopantetheine or derivative thereof to form a labeled dephosphoCoenzyme A or derivative thereof, and phosphorylating the 3′-hydrozyl of the labeled dephosphoCoenzume A or derivative thereof to form a labeled coenzyme A analog or derivative thereof.

  本发明公开了在体内外生成辅酶A类似物的方法。该方法包括将泛酰胺或其衍生物与报告物反应以形成标记的泛酰胺或其衍生物，将标记的泛酰胺或其衍生物磷酸化以形成磷酸泛酰胺或其衍生物，将标记的磷酸泛酰胺或其衍生物腺苷化以形成标记的脱磷酸辅酶A或其衍生物，以及将标记的脱磷酸辅酶A或其衍生物的3'-羟基磷酸化以形成标记的辅酶A类似物或其衍生物。
• Methods for Generating Analogs of Coenzyme A
  申请人：Burkart Michael D.

  公开号：US20100304430A1

  公开（公告）日：2010-12-02

  Methods to generate analogs of coenzyme A in vivo are disclosed. The methods to generate analogs of coenzyme A in a cell comprise reacting pantetheine or a derivative thereof with a reporter to form labeled pantetheine or a derivative thereof, contacting the cell with the labeled pantetheine or derivative thereof such that the labeled pantetheine or derivative thereof enters the cell, phosphorylating the labeled pantetheine or derivative thereof to form phosphopantetheine or a derivative thereof, adenylating the labeled phosphopantetheine or derivative thereof to form a labeled dephosphoCoenzyme A or derivative thereof, and phosphorylating the 3′-hydroxyl of the labeled dephosphoCoenzyme A or derivative thereof to form a labeled coenzyme A analog or derivative thereof.

  本文公开了一种在体内生成辅酶A类似物的方法。在细胞内生成辅酶A类似物的方法包括将泛酰胺或其衍生物与报告物质反应以形成标记的泛酰胺或其衍生物，将标记的泛酰胺或其衍生物与细胞接触，使标记的泛酰胺或其衍生物进入细胞，磷酸化标记的泛酰胺或其衍生物以形成磷酸泛酰胺或其衍生物，腺苷酸化标记的磷酸泛酰胺或其衍生物以形成标记的去磷酸辅酶A或其衍生物，然后磷酸化标记的去磷酸辅酶A或其衍生物的3'-羟基，以形成标记的辅酶A类似物或其衍生物。
• US7727738B2
  申请人：——

  公开号：US7727738B2

  公开（公告）日：2010-06-01