6-[2-(2-(tert-butoxycarbonylamino)ethoxy)ethoxy]hexanoic acid | 1260107-06-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: 6-[2-(2-(tert-butoxycarbonylamino)ethoxy)ethoxy]hexanoic acid
• 英文别名: 6-[2-(2-N-Boc-aminoethoxy)ethoxy]hexanoic acid；6-[2-[2-[(2-Methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]ethoxy]ethoxy]hexanoic acid
• CAS: 1260107-06-9
• 化学式: C₁₅H₂₉NO₆
• 分子量: 319.398
• InChiKey: MKKQMEFTHJSVBG-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.87
• 拓扑面积：
  94.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-[2-(2-(tert-butoxycarbonylamino)ethoxy)ethoxy]hexanoic acid 、 高丝氨酸内酯氢溴酸盐 在 4-二甲氨基吡啶 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以90%的产率得到tert-butyl (S)-(2-(2-((6-oxo-6-((2-oxotetrahydrofuran-3-yl)amino)hexyl)oxy)ethoxy)ethyl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  Discovery of a quorum sensing modulator pharmacophore by 3D small-molecule microarray screening

  摘要：

  筛选大量类药物小分子的工作传统上是一个耗时且资源密集的任务。在我们的实验室中开发的新方法提供了一种经济划算的3D微阵列辅助筛选平台，可以快速检测成千上万的化合物。作为原理验证，该平台被用来筛选多种群体感应类似物。群体感应是细菌用来启动和传播感染的机制；在这个背景下，调节它可能具有重要的临床价值。3D微阵列载片使用了来自土壤腐生菌Erwinia carotovora subsp. carotovora的LuxR同源物CarR的荧光标记配体结合结构域进行探测。该3D微阵列平台用于发现生物活性的氯吡啶药效团，并通过荧光配体结合测定和等温量热法（ITC）进行了验证。含有氯吡啶药效团的类似物被发现能够有效抑制Serratia（IC50 ≈ 5 μM）和铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruginosa）（IC50 = 10–20 μM）中N-酰基同源肉桂酸内酯（AHL）介导的群体感应表型。

  DOI：

  10.1039/c0ob00300j
• 作为产物：
  描述：

  6-[2-(2-(tert-butoxycarbonylamino)ethoxy)ethoxy]hexanoic acid ethyl ester 在 lithium hydroxide monohydrate 、 盐酸 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 2.0h， 以100%的产率得到6-[2-(2-(tert-butoxycarbonylamino)ethoxy)ethoxy]hexanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Discovery of a quorum sensing modulator pharmacophore by 3D small-molecule microarray screening

  摘要：

  筛选大量类药物小分子的工作传统上是一个耗时且资源密集的任务。在我们的实验室中开发的新方法提供了一种经济划算的3D微阵列辅助筛选平台，可以快速检测成千上万的化合物。作为原理验证，该平台被用来筛选多种群体感应类似物。群体感应是细菌用来启动和传播感染的机制；在这个背景下，调节它可能具有重要的临床价值。3D微阵列载片使用了来自土壤腐生菌Erwinia carotovora subsp. carotovora的LuxR同源物CarR的荧光标记配体结合结构域进行探测。该3D微阵列平台用于发现生物活性的氯吡啶药效团，并通过荧光配体结合测定和等温量热法（ITC）进行了验证。含有氯吡啶药效团的类似物被发现能够有效抑制Serratia（IC50 ≈ 5 μM）和铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruginosa）（IC50 = 10–20 μM）中N-酰基同源肉桂酸内酯（AHL）介导的群体感应表型。

  DOI：

  10.1039/c0ob00300j

文献信息

• Discovery of a quorum sensing modulator pharmacophore by 3D small-molecule microarray screening
  作者：David M. Marsden、Rebecca L. Nicholson、Mette E. Skindersoe、Warren R. J. D. Galloway、Hannah F. Sore、Michael Givskov、George P. C. Salmond、Mark Ladlow、Martin Welch、David R. Spring

  DOI：10.1039/c0ob00300j

  日期：——

  The screening of large arrays of drug-like small-molecules was traditionally a time consuming and resource intensive task. New methodology developed within our laboratories provides an attractive low cost, 3D microarray-assisted screening platform that could be used to rapidly assay thousands of compounds. As a proof-of-principle the platform was exploited to screen a number of quorum sensing analogs. Quorum sensing is used by bacterium to initiate and spread infection; in this context its modulation may have significant clinical value. 3D microarray slides were probed with fluorescently labeled ligand-binding domains of the LuxR homolog CarR from Erwinia carotovora subsp. carotovora. The 3D microarray platform was used to discover the biologically active chloro-pyridine pharmacophore, which was validated using a fluorometric ligand binding assay and ITC. Analogs containing the chloro-pyridine pharmacophore were found to be potent inhibitors of N-acyl-homoserine-lactone (AHL) mediated quorum sensing phenotypes in Serratia (IC50 = ∼5 μM) and Pseudomonas aeruginosa (IC50 = 10–20 μM).

  筛选大量类药物小分子的工作传统上是一个耗时且资源密集的任务。在我们的实验室中开发的新方法提供了一种经济划算的3D微阵列辅助筛选平台，可以快速检测成千上万的化合物。作为原理验证，该平台被用来筛选多种群体感应类似物。群体感应是细菌用来启动和传播感染的机制；在这个背景下，调节它可能具有重要的临床价值。3D微阵列载片使用了来自土壤腐生菌Erwinia carotovora subsp. carotovora的LuxR同源物CarR的荧光标记配体结合结构域进行探测。该3D微阵列平台用于发现生物活性的氯吡啶药效团，并通过荧光配体结合测定和等温量热法（ITC）进行了验证。含有氯吡啶药效团的类似物被发现能够有效抑制Serratia（IC50 ≈ 5 μM）和铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruginosa）（IC50 = 10–20 μM）中N-酰基同源肉桂酸内酯（AHL）介导的群体感应表型。