抑制Bcl-2家族蛋白-蛋白相互作用(P
PI)是癌症化疗中非常有希望的方向。因此,在过去的十年中,许多药物
化学研究都致力于发现候选药物,据报道,许多具有惊人
化学多样性的
化学支架是Bcl-xL
抑制剂。这就提出了一个问题,即所有这些分子是否都可以占据一个独特的结合位点,或者占据蛋白质表面的离散口袋。 为了测试小型且
化学上不同的Bcl-xL
抑制剂是否可能结合单个口袋,并确定哪个口袋,我们使用了一系列计算和建模方法。我们首先检查了我们构建的Bcl-xL
抑制剂的大型数据集是否确实可以适合通用药效团。然后,我们通过比较晶体结构以及虚拟片段筛选,确定了相互作用的可能结合热点。最后,合成了小多
酚衍
生物的新类似物,以精确探测对接实验表明的氢键。这些产物的Bcl-xL抑制效力证实了预测的结合模式。 X射线结构探索,分子模型研究和药物
化学的这种结合支持所有这些小的Bcl-xL
抑制剂占据相同的相互作用热点。该结合位点的鉴定应有助于设计和优化小的P
PI