N-Demethylaglycovancomycin | 101485-48-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-Demethylaglycovancomycin
• 英文别名: agluco A51568A；N-Demethylvancomycin aglycone；(1S,2R,18R,19R,22S,25R,28R,40S)-19-[[(2R)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]-22-(2-amino-2-oxoethyl)-5,15-dichloro-2,18,32,35,37,48-hexahydroxy-20,23,26,42,44-pentaoxo-7,13-dioxa-21,24,27,41,43-pentazaoctacyclo[26.14.2.23,6.214,17.18,12.129,33.010,25.034,39]pentaconta-3,5,8(48),9,11,14,16,29(45),30,32,34(39),35,37,46,49-pentadecaene-40-carboxylic acid
• CAS: 101485-48-7
• 化学式: C₅₂H₅₀Cl₂N₈O₁₇
• 分子量: 1129.92
• InChiKey: XCWOFGRKPJGNDG-FAUSCHJRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.1
• 重原子数：
  79
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  10.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  421
• 氢给体数：
  15
• 氢受体数：
  18

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-Demethylaglycovancomycin 在 sodium hydroxide 、 硫代异氰酸苯酯 作用下， 以 吡啶 、 水 为溶剂， 反应 2.0h， 以61%的产率得到N-Des-leucylvancomycin aglycone
  参考文献：
  名称：

  从万古霉素和相关抗生素中选择性裂解凡可可胺，葡萄糖和N-甲基亮氨酸

  摘要：

  万古霉素和相关抗生素与三氟乙酸在–15°C的条件下反应40小时，可选择性裂解氨基糖类香豆素。通过与三氟乙酸在50°C下反应3小时，除去第二个糖（葡萄糖），并使用Edman降解程序裂解N末端亮氨酸部分。

  DOI：

  10.1039/c39880001306
• 作为产物：
  描述：

  desvancosamine 在 三氟乙酸 作用下， 反应 3.0h， 生成 N-Demethylaglycovancomycin
  参考文献：
  名称：

  从万古霉素和相关抗生素中选择性裂解凡可可胺，葡萄糖和N-甲基亮氨酸

  摘要：

  万古霉素和相关抗生素与三氟乙酸在–15°C的条件下反应40小时，可选择性裂解氨基糖类香豆素。通过与三氟乙酸在50°C下反应3小时，除去第二个糖（葡萄糖），并使用Edman降解程序裂解N末端亮氨酸部分。

  DOI：

  10.1039/c39880001306

文献信息

• Attempted introduction of a fourth amide NH into the carboxylate-binding pocket of glycopeptide antibiotics
  作者：Jochen Görlitzer、Thomas F. Gale、Dudley H. Williams

  DOI：10.1039/a906502d

  日期：——

  We report the synthesis of a novel derivative of the glycopeptide antibiotic vancomycin, modified at the N-terminus. This incorporates a fourth amide NH into the antibiotic, at the position which was formerly the N-terminus of the antibiotic-binding pocket. Although this modification gives the potential to form an extra hydrogen bond to the carboxylate anion of the bacterial cell-wall precursor analogue (N,N)-diacetyl-L-lysyl-D-alanyl-D-alanine, the modified antibiotic does not show enhanced binding to this precursor. This lack of enhanced binding is associated with an unfavourable conformational change (relative to the desired conformation) in the antibiotic.

  我们报告了一种新型糖肽抗生素万古霉素衍生物的合成过程，该衍生物在 N 端进行了修饰。它在抗生素结合袋 N 端位置加入了第四个酰胺 NH。虽然这种修饰有可能与细菌细胞壁前体类似物（N,N)-二乙酰基-L-赖氨酰-D-丙氨酰-D-丙氨酸的羧酸阴离子形成额外的氢键，但修饰后的抗生素与这种前体的结合力并没有增强。这种结合力不强的现象与抗生素的不利构象变化（相对于理想构象）有关。
• Expression and assay of an N-methyltransferase involved in the biosynthesis of a vancomycin group antibiotic
  作者：Dominic P. O’Brien、Peter N. Kirkpatrick、Simon W. O’Brien、Thomas Staroske、Jonathan B. Spencer、Dudley H. Williams、Timothy I. Richardson、David A. Evans、Andrew Hopkinson

  DOI：10.1039/a907953j

  日期：——

  An N-methyltransferase responsible for methylating the N-terminal leucine of a vancomycin group antibiotic has been expressed, and its activity assayed against a series of putative vancomycin precursors.

  已经表达了一种负责甲基化万古霉素类抗生素 N 末端亮氨酸的 N-甲基转移酶，并针对一系列推定的万古霉素前体测定了其活性。
• Impurity Identification and Scale-Up of a Novel Glycopeptide Antibiotic
  作者：Shang Jiao、Dongliang Guan、Lili Xu、Bo Liu、Weiwei Shi、Jian Li、Feng Tang、Wei Huang

  DOI：10.1021/acs.oprd.1c00064

  日期：2021.11.19

  variety of novel glycopeptide antibiotics have been developed to combat the drug-resistant bacterial strains. Previously, we reported a series of vancomycin derivatives that are modified with lipid tails and extra sugars. SM-V-61, as one of the vancomycin analogues with a trifluoromethyl-biphenyl fragment and galactose, showed enhanced antibacterial activity, improved PK/PD, better water solubility

  已经开发出多种新型糖肽抗生素来对抗耐药细菌菌株。此前，我们报道了一系列用脂质尾部和额外糖修饰的万古霉素衍生物。SM-V-61 作为具有三氟甲基-联苯片段和半乳糖的万古霉素类似物之一，显示出增强的抗菌活性、改善的 PK/PD、更好的水溶性和安全性。然而，其合成程序不完善、收率较低、杂质复杂等问题阻碍了候选药物SM-V-61的进一步开发。在此，我们报告了对 SM-V-61 杂质分析和工艺优化的进一步研究。我们首先合成并鉴定了多种杂质，建立了SM-V-61质量分析和控制的分析方法。基于定义的分析方法，
• Selective cleavage of vancosamine, glucose, and N-methyl-leucine from vancomycin and related antibiotics
  作者：Ramakrishnan Nagarajan、Amelia A. Schabel

  DOI：10.1039/c39880001306

  日期：——

  Reaction of vancomycin and related antibiotics with trifluoroacetic acid at –15 °C for 40 h selectively cleaved the amino sugar vancosamine; the second sugar, glucose, was removed by reaction with trifluoroacetic acid at 50 °C for 3 h, and the N-terminal leucine moiety was cleaved using the Edman degradation procedure.

  万古霉素和相关抗生素与三氟乙酸在–15°C的条件下反应40小时，可选择性裂解氨基糖类香豆素。通过与三氟乙酸在50°C下反应3小时，除去第二个糖（葡萄糖），并使用Edman降解程序裂解N末端亮氨酸部分。