6-Benzyl-5-hydroxymethyl-1H-pyrimidine-2,4-dione | 347861-37-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 6-Benzyl-5-hydroxymethyl-1H-pyrimidine-2,4-dione
• 英文别名: 6-benzyl-5-hydroxymethyluracil；5-hydroxmethyl-6-benzyluracil；6-Benzyl-5-(hydroxymethyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione；6-benzyl-5-(hydroxymethyl)-1H-pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 347861-37-4
• 化学式: C₁₂H₁₂N₂O₃
• 分子量: 232.239
• InChiKey: GSDWPRZHOYUVOH-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.307±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.6
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  78.4
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-Benzyl-5-hydroxymethyl-1H-pyrimidine-2,4-dione 在 dipotassium peroxodisulfate 、 silver nitrate 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 以45%的产率得到6-Benzyl-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidine-5-carbaldehyde
  参考文献：
  名称：

  Three Routes for the Synthesis of 6-Benzyl-1-ethoxymethyl-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidine-5-carbaldehyde

  摘要：

  6-苄基-1-乙氧基甲基-2,4-二氧代-1,2,3,4-四氢嘧啶-5-甲醛（1）是 MKC-442 的类似物，MKC-442 是一种非常有效的 HIV-1 逆转录酶抑制剂。化合物 1 通过三种不同的途径合成。6-苄基-1-乙氧基甲基-5-乙烯基-1H-嘧啶-2,4-二酮（7）是由 6-苄基-1H-嘧啶-2,4-二酮（2）通过碘化、N-1 烷基化、N-3 保护、钯（0）催化与四乙烯基锡偶联以及 N-3 去保护五个步骤合成的。最后，化合物 1 由 6-苄基-2,4-二氧代-1,2,3,4-四氢嘧啶-5-甲腈（10）通过雷尼镍还原和 N-1 烷基化合成。有人尝试用化合物 7 作为 6-苄基-1-乙氧基甲基-5-环氧乙烷基-1H-嘧啶-2,4-二酮（11）的前体，将 7 与 MCPBA 反应，但化合物 11 反应性太强，被溶液中的间氯苯甲酸酯开环。两个中间体经过 N-1 烷基化，得到了在 C-5 位含有羟甲基（13）或氰基（14）的新 MKC-442 类似物。这些化合物均未显示出对变异 HIV-1 病毒（Tyr181Cys）的活性，但在 C-5 位分别含有碘基或乙烯基的中间体 4 和 7 对野生型 HIV-1 具有良好的活性。

  DOI：

  10.1055/s-2001-12352
• 作为产物：
  描述：

  聚合甲醛 、 6-benzyl-1,2,3,4-tetrahydropyrimidine-2,4-dione 在 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 48.0h， 以79%的产率得到6-Benzyl-5-hydroxymethyl-1H-pyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  Three Routes for the Synthesis of 6-Benzyl-1-ethoxymethyl-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidine-5-carbaldehyde

  摘要：

  6-苄基-1-乙氧基甲基-2,4-二氧代-1,2,3,4-四氢嘧啶-5-甲醛（1）是 MKC-442 的类似物，MKC-442 是一种非常有效的 HIV-1 逆转录酶抑制剂。化合物 1 通过三种不同的途径合成。6-苄基-1-乙氧基甲基-5-乙烯基-1H-嘧啶-2,4-二酮（7）是由 6-苄基-1H-嘧啶-2,4-二酮（2）通过碘化、N-1 烷基化、N-3 保护、钯（0）催化与四乙烯基锡偶联以及 N-3 去保护五个步骤合成的。最后，化合物 1 由 6-苄基-2,4-二氧代-1,2,3,4-四氢嘧啶-5-甲腈（10）通过雷尼镍还原和 N-1 烷基化合成。有人尝试用化合物 7 作为 6-苄基-1-乙氧基甲基-5-环氧乙烷基-1H-嘧啶-2,4-二酮（11）的前体，将 7 与 MCPBA 反应，但化合物 11 反应性太强，被溶液中的间氯苯甲酸酯开环。两个中间体经过 N-1 烷基化，得到了在 C-5 位含有羟甲基（13）或氰基（14）的新 MKC-442 类似物。这些化合物均未显示出对变异 HIV-1 病毒（Tyr181Cys）的活性，但在 C-5 位分别含有碘基或乙烯基的中间体 4 和 7 对野生型 HIV-1 具有良好的活性。

  DOI：

  10.1055/s-2001-12352

文献信息

• Synthesis of New MKC-442 Analogues Containing Alkenyl Chains or Reactive Functionalities at C-5
  作者：Lene Petersen、Thomas H. Hansen、Nagy M. Khalifa、Per T. Jørgensen、Erik B. Pedersen、Claus Nielsen

  DOI：10.1007/s007060200072

  日期：2002.7

  interaction between HIV-1 reverse transcriptase (RT) and MKC-442 analogues, a new series of compounds was synthesized and evaluated for inhibition of HIV-1 replication. The modifications include bulky alkenyl substituents at the C-5 position of the uracil ring. Analogues with reactive centers (aldehyde and epoxide functionalities) at C-5 were also synthesized in an attempt to develop HIV drugs with improved

   为了更深入地了解HIV-1逆转录酶（RT）和MKC-442类似物之间的相互作用，合成了一系列新化合物并评估了其对HIV-1复制的抑制作用。所述修饰包括在尿嘧啶环的C-5位置的大的烯基取代基。还尝试合成具有C-5反应中心（醛和环氧化物官能团）的类似物，以尝试通过在突变RT的疏水口袋中与半胱氨酸中的巯基形成共价键来开发对Y181C突变体具有增强活性的HIV药物。 。合成困难表明环氧化物具有化学反应性，而醛则更稳定。一种烯基类似物对HIV-1的活性与MKC-442相同，
• Synthesis and Anti-HIV-1 Activity of New Fluoro-HEPT Analogues: An Investigation on Fluoro versus Hydroxy Substituents
  作者：Yasser M. Loksha、Erik B. Pedersen、Roberta Loddo、Paolo La Colla

  DOI：10.1002/ardp.201000187

  日期：2011.6

  uracil (7) with propargyl alcohol to afford 8 which was fluorinated to give the fluoro propargyl derivative 9. Compound 7 was synthesized by N1‐alkylation of the corresponding uracil. Significant activity was found against HIV‐1 except for compounds with 5‐hydroxymethyl and 5‐fluoromethyl substituents.

  6-苄基-5-羟甲基尿嘧啶（1）与甲醛缩醛偶联，然后使用（二乙氨基）三氟化硫（DAST）进行氟化，得到1-烯氧基甲基和1-炔丙氧基甲基5-氟甲基-6-苄基尿嘧啶3a-c。6-(3,5-二甲基苄基)-5-乙基-1-[(2-氟乙氧基)甲基]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(6)通过相应的羟基衍生物5的氟化合成。 6-(3,5-二甲基苄基)-5-乙基-1-(4-碘苄基)尿嘧啶(7)与炔丙醇发生Sonogoshira反应，得到8，氟化得到氟炔衍生物9。化合物7为通过相应尿嘧啶的 N1-烷基化合成。除了具有 5-羟甲基和 5-氟甲基取代基的化合物外，发现对 HIV-1 具有显着活性。
• Synthesis of Furoannelated Analogues of Emivirine (MKC-442)
  作者：Michael Wamberg、Erik B. Pedersen、Claus Nielsen

  DOI：10.1002/ardp.200300815

  日期：2004.3

  Furoannelated analogues 1‐alkoxymethyl‐7‐phenyl‐5, 7‐dihydro‐1H‐furo[3, 4‐d]‐pyrimidine‐2, 4‐diones of Emivirine (3a, b) were synthesized from the primary alcohols 1‐alkoxymethyl‐6‐benzyl‐5‐hydroxymethyl‐1H‐pyrimidine‐2, 4‐dione (5a, b) using a radical ring closure reaction with Pb(OAc)4. These analogues are conformationally restricted in order to fix the aromatic substituent of Emivirine in nearly

  Furoannelated 类似物 1-alkoxymethyl-7-phenyl-5, 7-dihydro-1H-furo [3, 4-d] -pyrimidine-2, 4-diones of Emivirine (3a, b) 由伯醇 1-alkoxymethyl 合成‐6 - 苄基 - 5 - 羟甲基 - 1H - 嘧啶 - 2, 4 - 二酮 (5a, b) 使用与 Pb (OAc) 4 的自由基闭环反应。这些类似物在构象上受到限制，以便将 Emivirine 的芳族取代基固定在与 Emivirine 复合物与 HIV-1 RT 结合时几乎相同的位置。然而，3a、b 的抗 HIV-1 活性明显低于领先的 Emivirine。
• Three Routes for the Synthesis of 6-Benzyl-1-ethoxymethyl-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidine-5-carbaldehyde
  作者：Lene Petersen、Erik B. Pedersen、Claus Nielsen

  DOI：10.1055/s-2001-12352

  日期：——

  6-Benzyl-1-ethoxymethyl-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidine-5-carbaldehyde (1) is an analog of MKC-442, a very potent inhibitor of HIV-1 reverse transcriptase. Compound 1 was synthesized by three different routes. 6-Benzyl-1-ethoxymethyl-5-vinyl-1H-pyrimidine-2,4-dione (7) was synthesized in five steps from 6-benzyl-1H-pyrimidine-2,4-dione (2) by iodination; N-1 alkylation, N-3 protection, Pd(0) catalyzed coupling with tetravinyltin and then N-3 deprotection. Compound 7 was then cleaved with ozone to give compound 1. In another route compound 2 was hydroxymethylated, oxidized and N-1 alkylated to give compound 1. Finally, compound 1 was synthesized from 6-benzyl-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidine-5-carbonitrile (10) by reduction with Raney Nickel followed by N-1 alkylation. An attempt was made to use compound 7 as a precursor for 6-benzyl-1-ethoxymethyl-5-oxiranyl-1H-pyrimidine-2,4-dione (11) by reacting 7 with MCPBA, but compound 11 was too reactive and was ring-opened by the m-chlorobenzoate present in the solution. Two intermediates were N-1 alkylated to give new MKC-442 analogs containing a hydroxymethyl group (13) or a cyano group (14) in the C-5 position. None of the compounds showed activity against the mutated HIV-1 virus (Tyr181Cys) but good activities were observed against wild-type HIV-1 for the intermediates 4 and 7 containing iodine or a vinyl group in the C-5 position, respectively.

  6-苄基-1-乙氧基甲基-2,4-二氧代-1,2,3,4-四氢嘧啶-5-甲醛（1）是 MKC-442 的类似物，MKC-442 是一种非常有效的 HIV-1 逆转录酶抑制剂。化合物 1 通过三种不同的途径合成。6-苄基-1-乙氧基甲基-5-乙烯基-1H-嘧啶-2,4-二酮（7）是由 6-苄基-1H-嘧啶-2,4-二酮（2）通过碘化、N-1 烷基化、N-3 保护、钯（0）催化与四乙烯基锡偶联以及 N-3 去保护五个步骤合成的。最后，化合物 1 由 6-苄基-2,4-二氧代-1,2,3,4-四氢嘧啶-5-甲腈（10）通过雷尼镍还原和 N-1 烷基化合成。有人尝试用化合物 7 作为 6-苄基-1-乙氧基甲基-5-环氧乙烷基-1H-嘧啶-2,4-二酮（11）的前体，将 7 与 MCPBA 反应，但化合物 11 反应性太强，被溶液中的间氯苯甲酸酯开环。两个中间体经过 N-1 烷基化，得到了在 C-5 位含有羟甲基（13）或氰基（14）的新 MKC-442 类似物。这些化合物均未显示出对变异 HIV-1 病毒（Tyr181Cys）的活性，但在 C-5 位分别含有碘基或乙烯基的中间体 4 和 7 对野生型 HIV-1 具有良好的活性。