[(2R,3S,4R,5R,6R)-3,4,6-tribenzyloxy-5-(dibenzylamino)tetrahydro-2H-pyran-2-yl]methyl acetate | 1404058-82-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: [(2R,3S,4R,5R,6R)-3,4,6-tribenzyloxy-5-(dibenzylamino)tetrahydro-2H-pyran-2-yl]methyl acetate
• CAS: 1404058-82-7
• 化学式: C₄₃H₄₅NO₆
• 分子量: 671.833
• InChiKey: UHIVHOLKQUJRRD-NCNXHZBWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.73
• 重原子数：
  50.0
• 可旋转键数：
  16.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.28
• 拓扑面积：
  66.46
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(2R,3S,4R,5R,6R)-3,4,6-tribenzyloxy-5-(dibenzylamino)tetrahydro-2H-pyran-2-yl]methyl acetate 在 甲醇 、 sodium methylate 、 戴斯-马丁氧化剂 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 27.0h， 生成 dibenzyl [(S)-hydroxy[(2S,3S,4R,5R,6R)-3,4,6-tris(benzyloxy)-5-(dibenzylamino)oxan-2-yl]methyl]phosphonate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and evaluation of glucosamine-6-phosphate analogues as activators of glmS riboswitch

  摘要：

  The glmS riboswitch is a ribozyme found in numerous Gram-positive bacteria and responds to the cellular concentrations of glucosamine 6-phosphate (GlcN6P). Given the importance of GlcN6P for cell wall biosynthesis, the glmS riboswitch has become a new drug target for the development of antibiotics. Herein, we describe the efficient synthesis of three GlcN6P analogues and their evaluation on inducing self-cleavage of the glmS riboswitch from Bacillus subtilis. Our results provide valuable information for further elucidation of the structure activity relationships and drug design for glmS riboswitch antibiotics. (C) 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.tet.2012.09.015
• 作为产物：
  描述：

  2-deoxy-2-amino glucose 在 硫酸 、 sodium hydride 、 溶剂黄146 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 [(2R,3S,4R,5R,6R)-3,4,6-tribenzyloxy-5-(dibenzylamino)tetrahydro-2H-pyran-2-yl]methyl acetate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and evaluation of glucosamine-6-phosphate analogues as activators of glmS riboswitch

  摘要：

  The glmS riboswitch is a ribozyme found in numerous Gram-positive bacteria and responds to the cellular concentrations of glucosamine 6-phosphate (GlcN6P). Given the importance of GlcN6P for cell wall biosynthesis, the glmS riboswitch has become a new drug target for the development of antibiotics. Herein, we describe the efficient synthesis of three GlcN6P analogues and their evaluation on inducing self-cleavage of the glmS riboswitch from Bacillus subtilis. Our results provide valuable information for further elucidation of the structure activity relationships and drug design for glmS riboswitch antibiotics. (C) 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.tet.2012.09.015

文献信息

• Phosphonate and Thiasugar Analogues of Glucosamine-6-phosphate: Activation of the <i>glmS</i> Riboswitch and Antibiotic Activity
  作者：Bjarne Silkenath、Dennis Kläge、Hanna Altwein、Nina Schmidhäuser、Günter Mayer、Jörg S. Hartig、Valentin Wittmann

  DOI：10.1021/acschembio.3c00452

  日期：2023.10.20

  glmS riboswitch is a motif found in 5′-untranslated regions of bacterial mRNA that controls the synthesis of glucosamine-6-phosphate (GlcN6P), an essential building block for the bacterial cell wall, by a feedback mechanism. Activation of the glmS riboswitch by GlcN6P mimics interferes with the ability of bacteria to synthesize its cell wall. Accordingly, GlcN6P mimics acting as glmS activators are

  glmS核糖开关是在细菌 mRNA 5' 非翻译区中发现的基序，通过反馈机制控制 6-磷酸葡萄糖胺 (GlcN6P) 的合成， GlcN6P是细菌细胞壁的重要组成部分。GlcN6P 模拟物激活glmS核糖开关会干扰细菌合成细胞壁的能力。因此，作为glmS激活剂的 GlcN6P 模拟物是未来抗生素药物的有前途的候选药物，可以克服新出现的细菌对现有抗生素的耐药性。我们描述了一系列 GlcN6P 的膦酸盐模拟物以及 GlcN6P 的硫糖类似物的合成。磷酸盐模拟物的 p K a值不同，以回答 p K a与GlcN6P 匹配的衍生物是否是有效的glmS激活剂的问题。我们发现所有衍生物激活核糖开关的效率都低于 GlcN6P。这一观察结果可以用膦酸盐中缺失的氢键来解释，并且对于未来 GlcN6P 模拟物的设计来说是有价值的信息。另一方面，GlcN6P 的硫糖类似物被证明是一种glmS核糖开关激活剂，其活性与天然代谢物