diisopropyl ((2-(5-iodo-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)methyl)phosphonate | 1238368-02-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: diisopropyl ((2-(5-iodo-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)methyl)phosphonate
• 英文别名: 1-{2-[(diisopropoxyphosphoryl)methoxy]ethyl}-5-iodouracil
• CAS: 1238368-02-9
• 化学式: C₁₃H₂₂IN₂O₆P
• 分子量: 460.206
• InChiKey: WGHOQFIPSFTEDW-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.58±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.16
• 重原子数：
  23.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  99.62
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  diisopropyl ((2-(5-iodo-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)methyl)phosphonate 在 2,6-二甲基吡啶 、 三甲基溴硅烷 、 盐酸 作用下， 以 乙腈 、 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 1.0h， 以37%的产率得到5-iodo-1-[2-(phosphonomethoxy)ethyl]uracil
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and biological evaluation of acyclic nucleotide analogues with a furo[2,3-d]pyrimidin-2(3H)-one base

  摘要：

  作为对双环核苷类似物（BCNAs）[抗水痘-带状疱疹病毒（anti-VZV）和抗人类巨细胞病毒（anti-HCMV）药物]进行更广泛的结构-活性关系（SAR）研究的一部分，合成了一系列新型 2-（膦甲氧基）乙基（PME）取代的呋喃并[2,3-d]嘧啶-2(3H)-酮。目标无环核苷酸类似物是通过受保护的 5-碘-1-[2-（磷酰甲氧基）乙基]尿嘧啶与各种 1-炔烃的 Sonogashira 偶联，然后在原位 Cu(I)促进下进行分子内环化，并以标准方式去除异丙酯基团而制备的。所制备的 PME 类似物在亚毒性浓度下对 VZV 胸苷激酶能力（TK+）、VZV 胸苷激酶缺陷（TK-）、HCMV 或任何其他受测病毒均无活性。

  DOI：

  10.1139/v10-054
• 作为产物：
  描述：

  1-{2-[(diisopropoxyphosphoryl)methoxy]ethyl}uracil 在 ammonium cerium (IV) nitrate 、 碘 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 3.0h， 以87%的产率得到diisopropyl ((2-(5-iodo-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)methyl)phosphonate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and biological evaluation of acyclic nucleotide analogues with a furo[2,3-d]pyrimidin-2(3H)-one base

  摘要：

  作为对双环核苷类似物（BCNAs）[抗水痘-带状疱疹病毒（anti-VZV）和抗人类巨细胞病毒（anti-HCMV）药物]进行更广泛的结构-活性关系（SAR）研究的一部分，合成了一系列新型 2-（膦甲氧基）乙基（PME）取代的呋喃并[2,3-d]嘧啶-2(3H)-酮。目标无环核苷酸类似物是通过受保护的 5-碘-1-[2-（磷酰甲氧基）乙基]尿嘧啶与各种 1-炔烃的 Sonogashira 偶联，然后在原位 Cu(I)促进下进行分子内环化，并以标准方式去除异丙酯基团而制备的。所制备的 PME 类似物在亚毒性浓度下对 VZV 胸苷激酶能力（TK+）、VZV 胸苷激酶缺陷（TK-）、HCMV 或任何其他受测病毒均无活性。

  DOI：

  10.1139/v10-054

文献信息

• Discovery of an Acyclic Nucleoside Phosphonate that Inhibits<i>Mycobacterium tuberculosis</i>ThyX Based on the Binding Mode of a 5-Alkynyl Substrate Analogue
  作者：Anastasia Parchina、Matheus Froeyen、Lia Margamuljana、Jef Rozenski、Steven De Jonghe、Yves Briers、Rob Lavigne、Piet Herdewijn、Eveline Lescrinier

  DOI：10.1002/cmdc.201300146

  日期：2013.8

  by the results of the modeling and NMR studies, and inspired by the success of acyclic antiviral nucleosides, compounds where a 5‐alkynyl uracyl moiety is coupled to an acyclic nucleoside phosphonate (ANP) were synthesized and evaluated. Of the compounds evaluated, sodium (6‐(5‐(3‐octanamidoprop‐1‐yn‐1‐yl)‐2,4‐dioxo‐3,4‐dihydropyrimidin‐1(2H)‐yl)hexyl)phosphonate (3 e) exhibited 43 % of inhibitory effect

  对新抗生素的迫切需求对靶向未开发的重要细胞过程提出了挑战。胸苷酸的生物合成就是这样一种过程，因为它在DNA复制和修复中起着至关重要的作用。胸苷酸合酶（TS）催化生物合成5-三磷酸胸苷（TTP）的关键步骤，这是DNA合成和修复所需的基本组成部分。迄今为止，由于TS抑制剂对人体酶和微生物酶的特异性不足，因此仅被成功用于抗癌治疗。但是，在一系列致病细菌中发现了一个新的TS酶家族（ThyX），该家族在结构和生化上与“经典” TS（ThyA）不同，这为开发选择性ThyX抑制剂作为有效的抗菌药物提供了可能。这里，1）用结核分枝杆菌从公开的晶体结构开始，使用分子模型探索ThyX酶，并通过NMR实验进一步证实。虽然化合物1的脱氧尿酸（dUMP）部分占据了ThyX中天然底物的腔，但其余的配体（“ 5-炔基尾巴”）延伸至酶的四个亚基中的两个之间。通过置换Tyr 44.C，Tyr 108.A和Lys 165.A