6-α-D-aminopimelyl-ε-D-alanyl-D-alanine | 643745-72-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 6-α-D-aminopimelyl-ε-D-alanyl-D-alanine
• 英文别名: (2R)-2-amino-7-[[(2R)-1-[[(1R)-1-carboxyethyl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-7-oxoheptanoic acid
• CAS: 643745-72-6
• 化学式: C₁₃H₂₃N₃O₆
• 分子量: 317.342
• InChiKey: XNOUXMBVSNOCCL-IWSPIJDZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.3
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  159
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-α-D-aminopimelyl-ε-D-alanyl-D-alanine 在 Actinomadura R₃₉ DD-peptidase 作用下， 生成 D-丙氨酸
  参考文献：
  名称：

  猕猴桃R39 dd-肽酶与特定底物反应的动力学

  摘要：

  的马杜拉放线菌R39 DD 1-肽催化水解和若干小肽和缩酚酸肽的氨解的。然而，其底物特异性及其体内底物的性质的细节尚未被很好地理解。本文描述了具有两个肽模拟物的基材3-（R39的酶的相互作用d -cysteinyl）丙酰基d -alanyl- d丙氨酸和3-（d -cysteinyl）丙酰基d -alanyl- d -thiolactate。前者衬底的反应的详细的研究，由酶催化，表明DD -carboxypeptidase，DD -transpeptidase，和DD-内肽酶活性。这些结果证实了酶对良好底物的N-末端的游离d-氨基酸的特异性，并表明了对扩展的d-氨基酸离去基团的偏好。通过确定胺亲核试剂对通过酶与巯基乳酸底物反应产生的酰基酶的结构特异性来支持后者。结论是，该酶的特定底物，可能还有体内底物，可以由部分交联的肽聚糖聚合物组成，其中自由侧链N端未交联的氨基酸在其中用作特定的酰基。内

  DOI：

  10.1021/bi101760p