本文介绍了针对
SARS-CoV-2 主要
蛋白酶 (M pro )的一流环肽
抑制剂的设计和研究。环肽
抑制剂旨在模拟底物在 M pro的 C 末端自溶裂解位点的构象。环肽包含一个 [4-(2-
氨基乙基) 苯基]-
乙酸 (
AEPA) 接头,旨在强制形成模拟 M pro 肽底物的构象。环肽
抑制剂的体外评估显示该
抑制剂对 M pro表现出适度的活性并且似乎没有被酶切割。构象搜索预测环肽
抑制剂相当刚性,采用有利的构象与 M pro的活性位点结合。与
SARS-CoV-2 M pro的计算对接表明,环肽
抑制剂可以以预测的方式结合 M pro的活性位点。分子动力学模拟进一步深入了解环肽
抑制剂如何结合 M pro的活性位点。尽管环肽
抑制剂的活性不大,但其设计和研究为开发其他活性更高的抗 M pro环肽
抑制剂奠定了基础。