庚二酸-D4 | 19031-56-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 酮酸及其衍生物
• 中文名称: 庚二酸-D4
• 英文名称: α,α,α',α'-d4-pimelic acid
• 英文别名: (α.α.α'.α'-D4)-Pimelinsaeure；2,2,6,6-tetradeuterio-heptanedioic acid；Pimelic Acid-d4；2,2,6,6-tetradeuterioheptanedioic acid
• CAS: 19031-56-2
• 化学式: C₇H₁₂O₄
• 分子量: 164.138
• InChiKey: WLJVNTCWHIRURA-CQOLUAMGSA-N

物化性质

• 溶解度：
  可溶于DMSO（少许）、甲醇（少许）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.5
• 重原子数：
  11
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.71
• 拓扑面积：
  74.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  庚二酸-D4 、 N-hydroxysulfosuccinimide sodium salt 在 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 14.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  同位素标记的交联剂。质谱蛋白质相互作用分析的新工具。

  摘要：

  在蛋白质相互作用分析中，一种鉴定参与蛋白质并同时表征相互作用位点的有前途的方法是对共价交联复合物的酶水解产物进行质谱分析。尽管可以通过为蛋白质组分析开发的方法来完成蛋白质鉴定，但是仍然需要明确地检测和鉴定交联位点，而除了质量以外，还没有针对连接肽的选择标准。为了提供这样的标准，我们将具有独特同位素模式的交联引入微管稳定蛋白Op18 / stathmin（Op18）以及由Op18与微管蛋白形成的复合物中。氘标记的交联剂双（磺基琥珀酰亚胺）-戊二酸酯-d4，-庚二酸酯-d4，和-癸二酸酯-d4及其未氘代的对应物一起制备，并以各自的d0和d4异位异构体的1∶1混合物形式使用。所得的d0 / d4同位素标签即使在复杂的酶促蛋白水解物中也可以直接质谱检测带有连接子的肽。在通过MS / MS阐明连接肽的结构时，d0 / d4标签再次大大促进了连接氨基酸的分配。通过平行应用两个具有相似反应性但间隔长度不

  DOI：

  10.1021/ac001379a

文献信息

• Mass spectra of aliphatic dicarboxylic acids and their dimethyl esters: Cyclic structures for the [M − H2O]+˙ ions from the diacids and [M − MeOH]+˙ ions from the dimethyl esters
  作者：Alex G. Harrison、R. Krishna Mohan Rao Kallury、Ulrich J. Krull、Michael Thompson

  DOI：10.1002/oms.1210231009

  日期：1988.10

  AbstractMethyl 2‐oxocycIoalkane carboxylate structures are proposed lor the [M − MeOH]+˙ ions from dimethyl adipate, pimelate, suberate and azelate. This proposal is based on a comparison of the metastable ion mass spectra and the kinetic energy releases for the major fragmentation reaction of these species with the same data for the molecular ions of authentic cyclic β‐keto esters. The mass spectra of α,α,α′,α′‐d4‐pimelic acid and its dimethyl ester indicate that the α‐hydrogens are involved only to a minor extent in the formation of [M − ROH]+˙ and [M − 2ROH]+˙ ions, while these α‐hydrogens are involved almost exclusively in the loss of ROH from the [M − RO˙]+ ions (R = H or CH3). The molecules XCO(CH2)7COOMe (X = OH, Cl) form abundant ions in their mass spectra with the same structure as the [M − 2MeOH]+˙ ions from dimethyl azelate.