methyl (N-(tert-butoxycarbonyl)-L-leucinyl)-L-α-aminobutyrate | 1426227-60-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl (N-(tert-butoxycarbonyl)-L-leucinyl)-L-α-aminobutyrate
• 英文别名: methyl (S)-N-(N-(tert-butoxycarbonyl)-L-leucinyl)-2-aminobutanoate
• CAS: 1426227-60-2
• 化学式: C₁₆H₃₀N₂O₅
• 分子量: 330.425
• InChiKey: REKCLXWCHODITJ-RYUDHWBXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.99
• 重原子数：
  23.0
• 可旋转键数：
  7.0
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.81
• 拓扑面积：
  93.73
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (N-(tert-butoxycarbonyl)-L-leucinyl)-L-α-aminobutyrate 在 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 18.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  可溶性四肽环氧酮蛋白酶体抑制剂的制备和生物学评价。

  摘要：

  设计并合成了一系列新型的20S蛋白酶体四肽基环氧酮抑制剂。为了充分理解SAR，设计，合成和生物分析了R 1，R 2，R 3，R 4和R 5位置的各种基团，包括芳族和脂族取代基。基于酶促结果，选择了7种化合物来评估其细胞活性，可溶性化合物36对人多发性骨髓瘤（MM）细胞系显示出强大的功效。微粒体稳定性结果表明化合物36与市售的卡非佐米相比，它在小鼠，大鼠和人的微粒体中更稳定。用具有荧光素酶表达的MM细胞系ARH77和RPMI-8226的异种移植小鼠模型评价该化合物的体内活性，两个模型的T / C值分别为49.5％和37.6％。为了评估潜在的心血管毒性，化合物36和卡非佐米对HEK293细胞中的hERG离子通道进行了抑制。结果表明36对hERG离子通道没有结合亲和力，而卡非佐米可以与92.1μM的IC 50结合。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2019.07.044
• 作为产物：
  描述：

  BOC-L-亮氨酸 、 (S)-2-氨基丁酸甲酯 在 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 methyl (N-(tert-butoxycarbonyl)-L-leucinyl)-L-α-aminobutyrate
  参考文献：
  名称：

  可溶性四肽环氧酮蛋白酶体抑制剂的制备和生物学评价。

  摘要：

  设计并合成了一系列新型的20S蛋白酶体四肽基环氧酮抑制剂。为了充分理解SAR，设计，合成和生物分析了R 1，R 2，R 3，R 4和R 5位置的各种基团，包括芳族和脂族取代基。基于酶促结果，选择了7种化合物来评估其细胞活性，可溶性化合物36对人多发性骨髓瘤（MM）细胞系显示出强大的功效。微粒体稳定性结果表明化合物36与市售的卡非佐米相比，它在小鼠，大鼠和人的微粒体中更稳定。用具有荧光素酶表达的MM细胞系ARH77和RPMI-8226的异种移植小鼠模型评价该化合物的体内活性，两个模型的T / C值分别为49.5％和37.6％。为了评估潜在的心血管毒性，化合物36和卡非佐米对HEK293细胞中的hERG离子通道进行了抑制。结果表明36对hERG离子通道没有结合亲和力，而卡非佐米可以与92.1μM的IC 50结合。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2019.07.044

文献信息

• Influence of Neighboring Groups on the Thermodynamics of Hydrophobic Binding: An Added Complex Facet to the Hydrophobic Effect
  作者：Nader N. Nasief、David Hangauer

  DOI：10.1021/jm401609a

  日期：2014.3.27

  proentropic in others. A remarkable enthalpy–entropy compensation relationship was also observed, reflecting the fact that the hydrophobic effect is governed by the thermodynamic status of the associated aqueous environment. This study could improve our understanding of the hydrophobic effect and may enhance our ability to design potent ligands that are capable of modulating biological processes.

  使用等温滴定量热法（ITC）对在浅疏水口袋中结合的配体侧链进行系统修饰的热力学后果进行了评估，无论是否存在相邻的配体羧酸酯基团。数据显示，羧酸盐可能会通过改变未结合状态和结合状态下水合水的H键/组织状态来显着改变这些修饰的相对热力学特征。发现该羧酸酯基团在某些情况下是前焓的，对熵的，而在另一些情况下是反焓的，对熵的。还观察到了显着的焓-熵补偿关系，这反映了疏水作用受相关水环境的热力学状态支配的事实。
• Dissecting the Hydrophobic Effect on the Molecular Level: The Role of Water, Enthalpy, and Entropy in Ligand Binding to Thermolysin
  作者：Adam Biela、Nader N. Nasief、Michael Betz、Andreas Heine、David Hangauer、Gerhard Klebe

  DOI：10.1002/anie.201208561

  日期：2013.2.4

  The hydrophobic effect is associated with the successive replacement of water molecules in the binding site of a protein by hydrophobic groups of the ligand. Although the hydrophobic effect is assumed to be entropy‐driven, large changes in enthalpy and entropy are observed with the model system thermolysin. Structural changes in the binding features of the water molecules ultimately determine the thermodynamics

  疏水作用与配体的疏水基团连续替换蛋白质结合位点中的水分子有关。尽管疏水作用被认为是由熵驱动的，但是在模型系统Thermosin中，可以观察到焓和熵的大变化。水分子结合特征的结构变化最终决定了疏水作用的热力学。
• Additivity or cooperativity: Which model can predict the influence of simultaneous incorporation of two or more functionalities in a ligand molecule?
  作者：Nader N. Nasief、David Hangauer

  DOI：10.1016/j.ejmech.2014.11.056

  日期：2015.1

  Predicting how binding affinity responds to ligand structural modifications in structure-activity relationship studies (SAR) is a major challenge in medicinal chemistry. This is particularly true when two or more of these modifications are carried out simultaneously. In this study, we present binding affinity data from several series of thermolysin inhibitors in which simultaneous structural modifications were investigated to determine whether they are cooperative or additive. Data revealed that, while additivity is at work in some cases, cooperativity is more commonly demonstrated. Cooperativity and additivity were then correlated with ligand descriptors, such as the spacing and the topological features of the modified groups, in a manner that may provide guidance as to when each model should be utilized. Cooperativity was particularly associated with contiguous groups and small unbranched hydrophobic side chain. Additivity, on the other hand, was associated with moderately distant hydrophobic group combinations and side chain branching. Such correlations can improve the predictability of SAR studies and can provide a starting point for additional investigations that may lead to further significant enhancements in the current scoring functions. (C) 2014 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.