Ala-Ala-Phe-7-AMC

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Ala-Ala-Phe-7-AMC
• 英文别名: H-Ala-Ala-Phe-Amc；(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-aminopropanoyl]amino]propanoyl]amino]-N-(4-methyl-2-oxochromen-7-yl)-3-phenylpropanamide
• 化学式: C₂₅H₂₈N₄O₅
• 分子量: 464.521
• InChiKey: FVRLYIFIDKXFHU-FTRWYGJKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.6
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.28
• 拓扑面积：
  140
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Ala-Ala-Phe-7-AMC 在 recombinant Leishmania donovani Peptidase T 、 水 、 cobalt(II) chloride 作用下， 以 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 7-氨基-4-甲基香豆素
  参考文献：
  名称：

  利什曼肽酶T的关键底物结合残基的突变改变其功能和结构动力学。

  摘要：

  背景 M20氨基肽酶（例如肽酶T（PepT））在蛋白质降解途径的最终阶段涉及寡肽的水解，以维持营业额。因此，对PepT的特异性抑制作用对于新型下一代抗真菌药的开发很有效。这项工作描述了金属依赖性，底物偏好和对PepT的抑制，并详细证明了其两个保守的底物结合残基的作用。 方法 使用肽底物和拟肽抑制剂的方案纯化和鉴定PepT。用一系列生化，生物物理和结构生物学方法对残基T364和N378进行突变和表征。 结果 PepT序列带有M20肽酶典型的保守基序，我们的生物化学工作表明，这种胞质酶具有广泛的底物特异性，对在P 1位置带有丙氨酸的肽具有最佳的切割偏好。拟肽类阿马他汀和肌动蛋白通过与底物竞争结合到活性位点而占据了S 1口袋，并有效抑制了PepT，而香菜碱A和Bestatin的抑制作用较差。我们进一步表明，保守的底物结合残基（T364和N378）向丙氨酸的突变影响了结构，降低了底物结合并改变了这种二聚酶的酰胺分解活性。

  DOI：

  10.1016/j.bbagen.2019.129465

文献信息

• [EN] COMPOSITIONS FOR PROMOTING READTHROUGH OF PREMATURE TERMINATION CODONS, AND METHODS OF USING THE SAME<br/>[FR] COMPOSITIONS PERMETTANT DE FAVORISER LA TRANSLECTURE DE CODONS DE TERMINAISON PRÉMATURÉE, ET LEURS PROCÉDÉS D'UTILISATION
  申请人：THE CENTRE FOR DRUG RES AND DEV

  公开号：WO2017049409A1

  公开（公告）日：2017-03-30

  Disclosed are compounds of general formula (I) that promote readthrough of a premature termination codon (PTC) of an RNA molecule in a translation system, and their use, alone or in combination with other compounds, such as aminoglycoside, to treat diseases or disorders ameliorated by modulation of a premature termination codon (PTC) of an RNA molecule in a translation system. The disorder or disease may be Dystrophic epidermolysis bullosa, Batten disease, Duchenne muscular dystrophy, cancer, and spinal muscular atrophy. Ar-L-B (I)

  公开了通式(I)的化合物，它们能够促进RNA分子在翻译系统中过早终止密码子(PTC)的通读，以及它们单独或与其他化合物如氨基糖苷的组合使用，用于治疗通过调节翻译系统中RNA分子的过早终止密码子(PTC)而得到改善的疾病或失调。该疾病或失调可能是营养不良性表皮松解症、贝敦病、杜氏肌营养不良症、癌症和脊髓性肌萎缩症。Ar-L-B (I)
• COMPOSITIONS AND METHODS FOR TREATMENT OF VIRAL DISEASES
  申请人：Johansen Lisa M.

  公开号：US20100009970A1

  公开（公告）日：2010-01-14

  The present invention features compositions, methods, and kits useful in the treatment of viral diseases. In certain embodiments, the viral disease is caused by a single stranded RNA virus, a flaviviridae virus, or a hepatic virus. In particular embodiments, the viral disease is viral hepatitis (e.g., hepatitis A, hepatitis B, hepatitis C, hepatitis D, hepatitis E) and the agent or combination of agents includes sertraline, a sertraline analog, UK-416244, or a UK-416244 analog. Also featured are screening methods for identification of novel compounds that may be used to treat a viral disease.

  本发明涉及用于治疗病毒性疾病的组合物、方法和试剂盒。在某些实施方式中，病毒性疾病是由单链RNA病毒、黄病毒科病毒或肝病毒引起的。在特定实施方式中，病毒性疾病是病毒性肝炎（例如甲型肝炎、乙型肝炎、丙型肝炎、丁型肝炎、戊型肝炎），药剂或药剂组合包括舍曲林、舍曲林类似物、UK-416244或UK-416244类似物。还包括用于鉴定可用于治疗病毒性疾病的新化合物的筛选方法。
• BENZENESULFONAMIDE UPREGULATORS OF NPC1 FOR NEIMANN-PICK DISEASE AND OTHER LYSOSOMAL STORAGE DISORDERS
  申请人：ICAHN SCHOOL OF MEDICINE AT MOUNT SINAI

  公开号：US20180044286A1

  公开（公告）日：2018-02-15

  Methods and compositions for treating lysosomal storage disorders are disclosed. The methods involve administering a genus of benzenesulfonamides, particularly N-[3-(aminosulfonyl)phenyl]-benzamides and heteroarylamides. A genus of suitable compounds is shown in formula 1:

  本发明公开了治疗溶酶体贮积病的方法和组合物。该方法涉及使用苯磺酰胺属的一类化合物，特别是N-[3-(氨基磺酰基)苯基]-苯甲酰胺和杂环苯甲酰胺。适用化合物属于公式1所示的一类化合物。
• Effects of a High-Pressure Treatment on the Activity and Structure of Rabbit Muscle Proteasome
  作者：Shuhei YAMAMOTO、Yuichi OTSUKA、Gerelt BORJIGIN、Kanna MASUDA、Yoshihide IKEUCHI、Tadayuki NISHIUMI、Atsushi SUZUKI

  DOI：10.1271/bbb.69.1239

  日期：2005.1

  The effects were assessed of high hydrostatic pressure on the activity and structure of rabbit skeletal muscle proteasome. The pressure effects on the activity were measured by the amount of fluorometric products released from synthetic substrates under pressure and from fluorescein isothiocyanate (FITC)-labeled casein after releasing the pressure. The effects on the structure were measured by fluorescene spectroscopy under pressure, and by circular dichroism (CD) spectroscopy and surface hydrophobicity after releasing the pressure. The optimal pressure for the hydrolyzing activity of synthetic peptides was 50 MPa. The degradation of FITC-labeled casein increased linearly with increasing pressure applied up to 200 MPa, and then markedly decreased up to at 400 MPa.The changes in the tertiary structure detected by fluorometric measurement were irreversible, whereas the changes in the secondary structure were small compared with those by heat treatment. The pressure-induced activation of proteasome therefore seems to have been due to a little unfolding of the active sites of proteasome.

  评估了高静水压对家兔骨骼肌蛋白酶体的活性和结构的影响。压力对活性的影响是通过合成底物在压力下释放的荧光产物量以及释放压力后荧光素异硫氰酸酯（FITC）标记的酪蛋白释放的荧光产物量来测量的。压力下的荧光光谱以及释放压力后的圆二色性（CD）光谱和表面疏水性测量了对结构的影响。合成肽水解活性的最佳压力为 50 兆帕。FITC标记的酪蛋白的降解随压力的增加而线性增加，最高达200兆帕，然后在400兆帕时明显降低。通过荧光测定法检测到的三级结构的变化是不可逆的，而二级结构的变化与热处理的变化相比很小。因此，压力诱导的蛋白酶体活化似乎是由于蛋白酶体活性位点的少许折叠所致。
• Method for the diagnosis of neuronal ceroid lipofuscinoses
  申请人：Steinbeis-Transferzentrum für Biopolymeranalytik und Biomolekül-Massenspektrometrie

  公开号：EP2910644A1

  公开（公告）日：2015-08-26

  The present invention relates to a method for the diagnosis of neuronal ceroid lipofuscinoses (NCLs), in particular CNL-1, CNL-2 and CNL-10, in a subject. The method is based on determining the activity of lysosomal enzymes with the help of umbelliferone derivatives and coumarin derivatives. The present invention further relates to said umbelliferone derivatives and coumarin derivatives, their use in the diagnosis of NCLs, and a kit for the diagnosis of NCLs.

  本发明涉及一种诊断神经细胞类脂质病（NCL），特别是 CNL-1、CNL-2 和 CNL-10 的方法。该方法基于借助伞形酮衍生物和香豆素衍生物确定溶酶体酶的活性。本发明还涉及上述伞形酮衍生物和香豆素衍生物、它们在诊断 NCL 中的用途以及诊断 NCL 的试剂盒。